SEMA7A (SEMA7A)

SEMA7A
SEMA7A
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	3NVQ
Идентификаторы
Псевдонимы	SEMA7A, CD108, CDw108, H-SEMA-K1, H-Sema-L, JMH, SEMAK1, SEMAL, semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group), PFIC11
Внешние ID	OMIM: 607961 MGI: 1306826 HomoloGene: 2678 GeneCards: SEMA7A
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	15-я хромосома человека
Конец	74,433,958 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	9-я хромосома мыши
Конец	57,870,148 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	C1 segment; ; primary visual cortex; ; right hemisphere of cerebellum; ; stromal cell of endometrium; ; цитоархитектоническое поле Бродмана 9;
	Наибольшая экспрессия в
	cumulus cell; ; primary visual cortex; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; anterior horn of spinal cord; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; lobe of cerebellum;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание с белками плазмы; integrin binding; neuropilin binding; semaphorin receptor binding; chemorepellent activity;
Компонент клетки	мембрана; клеточная мембрана; anchored component of membrane; внеклеточное пространство; наружная сторона клеточной мембраны; часть клеточной мембраны; collagen-containing extracellular matrix;
Биологический процесс	дифференцировка клеток; positive regulation of protein phosphorylation; развитие нервной системы; развитие многоклеточного организма; osteoblast differentiation; иммунный ответ; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; axon extension; olfactory lobe development; integrin-mediated signaling pathway; positive regulation of axon extension; воспалительная реакция; neuron projection development; regulation of inflammatory response; negative chemotaxis; positive regulation of macrophage cytokine production; neural crest cell migration; positive regulation of cell migration; negative regulation of axon extension involved in axon guidance; semaphorin-plexin signaling pathway;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	8482
	20361
	ENSG00000138623; ENSG00000288455
	ENSMUSG00000038264
	O75326
	Q9QUR8
	NM_003612; NM_001146029; NM_001146030
	NM_011352
	NP_001139501; NP_001139502; NP_003603
	NP_035482
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Семафорин-7A (англ. Semaphorin 7A, GPI membrane anchor; SEMA7A; CD108) — мембранный гликопротеин класса семафоринов, прикреплён к клеточной мембране за счёт гликозилфосфатидилинозитольной группы. Антиген группы крови John-Milton-Hagen (JMH). Продукт гена человека SEMA7A^[5].

Структура

SEMA7A состоит из 666 аминокислот, молекулярная масса 74,8 кДа. Содержит один Ig-подобный домен типа C2. Гликозилфосфатидилинозитол заякоривает белок на мембране.

Взаимодействует с интегринами ITGA1 и ITGB1 и с рецептором семафоринов PLXNC1.

Функции

SEMA7A играет важную роль в интегрин-опосредованной передаче сигнала. Функционирует в регуляции клеточной миграции и в иммунном ответе. Стимулирует образование комплексов фокальной адгезии, активацию протеинкиназы PTK2/FAK1 и последующее фосфорилирование киназ MAPK1 и MAPK3. Стимулирует продукцию воспалительных цитокинов моноцитами и макрофагами. Играет важную роль в модулировании воспалительной реакции и T-клеточного иммунного ответа. Белок стимулирует рост аксонов в эмбриональной обонятельной луковице. Участвует в прикреплении меланоцитов, их росте и образовании дендритных отростков.

Кроме этого, белок служит рецептором малярийного паразита Plasmodium falciparum.

Группа крови JMH

Система группы крови John Milton Hagen (JMH) — высокочастотный антиген эритроцитарной группы крови человека.^[6] Система состоит из 6 антигенов, расположенных на семафорине-7A^[7], но, как правило, они не вызывают существенного гемолиза или гемолитических расстройств новорожденных.^[8]

Тканевая локализация

Белок экспрессирован на активированных лимфоцитах и эритроцитах. Детектируется на кератиноцитах, эндотелиальных клетках кровеносных сосудов кожи. Экспрессирован на фибробрастах, меланоцитах, в плаценте, яичках, яичниках, селезёнке, мозге, спинном мозге, лёгких, сердце, надпочечниках, лимфатических узлах, вилочковой железе, кишечнике и почках.

Примечания

↑ ¹ ² ³ ENSG00000288455 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138623, ENSG00000288455 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038264 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Entrez Gene: SEMA7A semaphorin 7A, GPI membrane anchor (John Milton Hagen blood group) (неопр.).
↑ Bobolis, Kristie A.; Moulds, John J.; Telen, Marilyn J. Isolation of the JMH Antigen on a Novel Phosphatidylinositol-Linked Human Membrane Protein (англ.) : journal. Архивировано 21 октября 2018 года.
↑ Johnson, S.T. JMH blood group system: a review. (неопр.) // Immunohematology. — 2014. — Т. 30, № 1. — С. 18—23. — PMID 25238240.
↑ JMH (неопр.). bbguy.org. Дата обращения: 21 октября 2018. Архивировано 21 октября 2018 года.

Литература

Xu X., Ng S., Wu Z.L., etal. Human semaphorin K1 is glycosylphosphatidylinositol-linked and defines a new subfamily of viral-related semaphorins. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 35. — P. 22428—22434. — doi:10.1074/jbc.273.35.22428. — PMID 9712866.
Lange C., Liehr T., Goen M., etal. New eukaryotic semaphorins with close homology to semaphorins of DNA viruses. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 51, no. 3. — P. 340—350. — doi:10.1006/geno.1998.5256. — PMID 9721204.
Yamada A., Kubo K., Takeshita T., etal. Molecular cloning of a glycosylphosphatidylinositol-anchored molecule CDw108. (англ.) // J. Immunol. : journal. — 1999. — Vol. 162, no. 7. — P. 4094—4100. — PMID 10201933.
Angelisová P., Drbal K., Cerný J., etal. Characterization of the human leukocyte GPI-anchored glycoprotein CDw108 and its relation to other similar molecules. (англ.) // Immunobiology : journal. — 1999. — Vol. 200, no. 2. — P. 234—245. — doi:10.1016/s0171-2985(99)80073-4. — PMID 10416131.
Tamagnone L., Artigiani S., Chen H., etal. Plexins are a large family of receptors for transmembrane, secreted, and GPI-anchored semaphorins in vertebrates. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — Vol. 99, no. 1. — P. 71—80. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80063-X. — PMID 10520995.
Mine T., Harada K., Matsumoto T., etal. CDw108 expression during T-cell development. (англ.) // Tissue Antigens^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 55, no. 5. — P. 429—436. — doi:10.1034/j.1399-0039.2000.550505.x. — PMID 10885563.
Holmes S., Downs A.M., Fosberry A., etal. Sema7A is a potent monocyte stimulator. (неопр.) // Scand. J. Immunol.. — 2002. — Т. 56, № 3. — С. 270—275. — doi:10.1046/j.1365-3083.2002.01129.x. — PMID 12193228.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., etal. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Maurin J.C., Delorme G., Machuca-Gayet I., etal. Odontoblast expression of semaphorin 7A during innervation of human dentin. (англ.) // Matrix Biol.^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 24, no. 3. — P. 232—238. — doi:10.1016/j.matbio.2005.03.005. — PMID 15907379.
Hu Y., Malone J.P., Fagan A.M., etal. Comparative proteomic analysis of intra- and interindividual variation in human cerebrospinal fluid. (англ.) // Mol. Cell. Proteomics : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 12. — P. 2000—2009. — doi:10.1074/mcp.M500207-MCP200. — PMID 16199891.
Koh J.M., Oh B., Lee J.Y., etal. Association study of semaphorin 7a (sema7a) polymorphisms with bone mineral density and fracture risk in postmenopausal Korean women. (англ.) // J. Hum. Genet.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 51, no. 2. — P. 112—117. — doi:10.1007/s10038-005-0331-z. — PMID 16372136.

[refGRCh38EnsemblENSG00000138623,_ENSG00000288455-1] ¹ ² ³ ENSG00000288455 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138623, ENSG00000288455 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000038264-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038264 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] Entrez Gene: SEMA7A semaphorin 7A, GPI membrane anchor (John Milton Hagen blood group) (неопр.).

[Isolation_of_the_JMH_Antigen_on_a_Novel_Phosphatidylinositol-Linked_Human_Membrane_Protein-6] Bobolis, Kristie A.; Moulds, John J.; Telen, Marilyn J. Isolation of the JMH Antigen on a Novel Phosphatidylinositol-Linked Human Membrane Protein (англ.) : journal. Архивировано 21 октября 2018 года.

[7] Johnson, S.T. JMH blood group system: a review. (неопр.) // Immunohematology. — 2014. — Т. 30, № 1. — С. 18—23. — PMID 25238240.

[8] JMH (неопр.). bbguy.org. Дата обращения: 21 октября 2018. Архивировано 21 октября 2018 года.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Белки: Кластеры дифференцировки
1-50	CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) CD2 CD3 (γ, δ, ε) CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 (a) CD9 CD10 CD11 (a, b, c, d) CD13 CD14 CD15 CD16 (A, B) CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 (A, B) CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 (a, b, c, d) CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 (a, b, c, d, e, f) CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 (E, L, P) CD63 CD64 (A, B, C) CD66 (a, b, c, d, e, f) CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 (a, b) CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 (a, d, e, h, j, k) CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 (a, b) CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 (a, b) CD121 (a, b) CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 (a, b, c) CD157 CD158 (a, d, e, i, k) CD159 (a, c) CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 (a, b) CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 (a, b, g) CD174 CD177 CD178 CD179 (a, b) CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 (a, b) CD212 CD213a (1, 2) CD217 CD218 (a, b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 (a, b) CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD270 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD319 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350
351-400	CD351 CD352 CD353 CD354 CD355 CD357 CD358 CD360 CD361 CD362 CD363 CD364 CD365 CD366 CD367 CD368 CD369 CD370 CD371