Синдекан 1 (Vnu;ytgu 1)

Перейти к навигации Перейти к поиску
Синдекан 1
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ SDC1 ; CD138; SDC; SYND1; syndecan
Внешние ID OMIM: 186355 MGI1349162 HomoloGene2252 GeneCards: Ген SDC1
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 6382 20969
Ensembl ENSG00000115884 ENSMUSG00000020592
UniProt P18827 P18828
RefSeq (мРНК) NM_001006946 NM_011519
RefSeq (белок) NP_001006947 NP_035649
Локус (UCSC) Chr 2:
20.4 – 20.43 Mb
Chr 12:
8.77 – 8.79 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Синдекан 1 (англ. syndecan 1; CD138) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Всего описано 4 белка этого семейства. Продукт гена человека SDC1.

Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 1 участвует в клеточной пролиферации, клеточной миграции и клеточном взаимодействии с белками внеклеточного матрикса.[1]

Синдекан 1 несёт гепарансульфатные и хондроитинсульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом. Связывается с CDCP1.

Отщепление эктодомена приводит к образованию растворимой формы белка. Отщепление может происходить под действием гепараназы, тромбина и эпидермального фактора роста, а также при стрессе и в процессе заживления раны.

Белок состоит из 288 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 32.5 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (232 аминокислоты), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 6 участков гликозилирования: 3 участка присоединения O-хондроитинсульфатных цепей, 2 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей и 1 участок N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит фосфорилируемый тирозин.

Применение

[править | править код]

Синдекан 1 используется в качестве маркёра плазматических клеток[2], если известно, что клетки произошли из клеток крови.[3]

Примечания

[править | править код]
  1. Entrez Gene: SDC1 syndecan 1.
  2. Rawstron A.C. Immunophenotyping of plasma cells (неопр.) // Curr Protoc Cytom. — 2006. — May (т. Chapter 6). — С. Unit6.23. — ISBN 0-471-14295-6. — doi:10.1002/0471142956.cy0623s36. — PMID 18770841.
  3. O'Connell F.P., Pinkus J.L., Pinkus G.S. CD138 (syndecan-1), a plasma cell marker immunohistochemical profile in hematopoietic and nonhematopoietic neoplasms (англ.) // Am. J. Clin. Pathol. : journal. — 2004. — February (vol. 121, no. 2). — P. 254—263. — doi:10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L. — PMID 14983940. Архивировано 9 июня 2011 года. (недоступная ссылка)

Литература

[править | править код]