CD164 (CD164)

CD164
CD164
Идентификаторы
Псевдонимы	CD164, MGC-24, MUC-24, endolyn, DFNA66, CD164 molecule, MGC-24v
Внешние ID	OMIM: 603356 MGI: 1859568 HomoloGene: 38129 GeneCards: CD164
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	6-я хромосома человека
Конец	109,382,467 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	10-я хромосома мыши
Конец	41,407,044 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	mucosa of sigmoid colon; ; bronchial epithelial cell; ; secondary oocyte; ; skin of hip; ; epithelium of nasopharynx; ; skin of thigh;
	Наибольшая экспрессия в
	epithelium of lens; ; Epithelium of choroid plexus; ; vestibular membrane of cochlear duct;
	Дополнительные справочные данные
	н/д
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание с белками плазмы;
Компонент клетки	часть мембраны; внеклеточная область; lysosomal membrane; эндосома; клеточная мембрана; лизосома; часть клеточной мембраны; endosome membrane; мембрана; цитоплазматическая везикула;
Биологический процесс	развитие многоклеточного организма; negative regulation of cell adhesion; heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; агрегация клеток; развитие мышечного органа; иммунный ответ; передача сигнала; негативная регуляция пролиферации клеток; гемопоэз;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	8763
	53599
	ENSG00000135535
	ENSMUSG00000019818
	Q04900
	Q9R0L9
NM_006016; NM_001142401; NM_001142402; NM_001142403; NM_001142404;
	NM_001346500
	NM_016898
NP_001135873; NP_001135874; NP_001135875; NP_001135876; NP_001333429;
	NP_006007
	NP_058594
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

CD164 (англ. Sialomucin core protein 24) — мембранный белок, сиаломуцин, продукт гена человека CD164^[5]^[6] Функционирует как молекула клеточной адгезии.

Функции

Сиаломуцины — гетерогенная группа секретируемых или мембрано-связанных муцинов, играющих две ключевых и противоположных ролей in vivo. Они могут быть протективными и антиадгезивными агентами или, наоборот, рецепторами адгезии. CD164 — интегральный трансмембранный сиаломуцин, функционирующий как рецептор адгезии^[5]. Участвует в процессах адгезии клеток фенотипа CD34⁺, а также в пролиферации гемопоэтических клеток.

Белок экспрессирован на эпителии, моноцитах, клетках стромы костного мозга. В патологии может играть важную роль в метастазировании при раке предстательной железы и инфильтрации костного мозга раковыми клетками^[7].

Структура

CD164 состоит из 197 аминокислот, молекулярная масса белка 21 кДа, зрелый гликозилированный белок имеет молекулярную массу 80 кДа. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 5 изоформ белка.

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135535 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019818 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ ¹ ² Watt SM, Bühring HJ, Rappold I, Chan JY, Lee-Prudhoe J, Jones T, Zannettino AC, Simmons PJ, Doyonnas R, Sheer D, Butler LH (August 1998). "CD164, a novel sialomucin on CD34(+) and erythroid subsets, is located on human chromosome 6q21". Blood. 92 (3): 849—66. doi:10.1182/blood.V92.3.849. PMID 9680353.
↑ Zannettino AC, Bühring HJ, Niutta S, Watt SM, Benton MA, Simmons PJ (October 1998). "The sialomucin CD164 (MGC-24v) is an adhesive glycoprotein expressed by human hematopoietic progenitors and bone marrow stromal cells that serves as a potent negative regulator of hematopoiesis". Blood. 92 (8): 2613—28. doi:10.1182/blood.V92.8.2613. PMID 9763543.
↑ Система маркёрных антигенов CD (неопр.). vmede.org. Дата обращения: 11 марта 2021. Архивировано 15 октября 2018 года. (рус.)

Литература

Zannettino AC (2001). "CD164". J. Biol. Regul. Homeost. Agents. 15 (4): 394—6. PMID 11862985.
Masuzawa Y, Miyauchi T, Hamanoue M, et al. (1992). "A novel core protein as well as polymorphic epithelial mucin carry peanut agglutinin binding sites in human gastric carcinoma cells: sequence analysis and examination of gene expression". J. Biochem. 112 (5): 609—15. doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123948. PMID 1478919.
Zhou GQ, Zhang Y, Ferguson DJ, et al. (2006). "The Drosophila ortholog of the endolysosomal membrane protein, endolyn, regulates cell proliferation". J. Cell. Biochem. 99 (5): 1380—96. doi:10.1002/jcb.20965. PMID 16924678. S2CID 6995864.
Chan JY, Lee-Prudhoe JE, Jorgensen B, et al. (2001). "Relationship between novel isoforms, functionally important domains, and subcellular distribution of CD164/endolyn". J. Biol. Chem. 276 (3): 2139—52. doi:10.1074/jbc.M007965200. PMID 11027692.
Ganesh SK, Zakai NA, van Rooij FJ, et al. (2009). "Multiple loci influence erythrocyte phenotypes in the CHARGE Consortium". Nat. Genet. 41 (11): 1191—8. doi:10.1038/ng.466. PMC 2778265. PMID 19862010.
Barbe L, Lundberg E, Oksvold P, et al. (2008). "Toward a confocal subcellular atlas of the human proteome". Mol. Cell. Proteomics. 7 (3): 499—508. doi:10.1074/mcp.M700325-MCP200. PMID 18029348.
Kurosawa N, Kanemitsu Y, Matsui T, et al. (1999). "Genomic analysis of a murine cell-surface sialomucin, MGC-24/CD164". Eur. J. Biochem. 265 (1): 466—72. doi:10.1046/j.1432-1327.1999.00777.x. PMID 10491205.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). "The DNA sequence and analysis of human chromosome 6". Nature. 425 (6960): 805—11. Bibcode:2003Natur.425..805M. doi:10.1038/nature02055. PMID 14574404.
Doyonnas R, Yi-Hsin Chan J, Butler LH, et al. (2000). "CD164 monoclonal antibodies that block hemopoietic progenitor cell adhesion and proliferation interact with the first mucin domain of the CD164 receptor". J. Immunol. 165 (2): 840—51. doi:10.4049/jimmunol.165.2.840. PMID 10878358.
Gudbjartsson DF, Walters GB, Thorleifsson G, et al. (2008). "Many sequence variants affecting diversity of adult human height". Nat. Genet. 40 (5): 609—15. doi:10.1038/ng.122. PMID 18391951. S2CID 3005450.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. 6 (9): 791—806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y, et al. (2005). "Transcriptome analysis of human gastric cancer". Mamm. Genome. 16 (12): 942—54. doi:10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
Havens AM, Jung Y, Sun YX, et al. (2006). "The role of sialomucin CD164 (MGC-24v or endolyn) in prostate cancer metastasis". BMC Cancer. 6: 195. doi:10.1186/1471-2407-6-195. PMC 1557671. PMID 16859559.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
Forde S, Tye BJ, Newey SE, et al. (2007). "Endolyn (CD164) modulates the CXCL12-mediated migration of umbilical cord blood CD133+ cells". Blood. 109 (5): 1825—33. doi:10.1182/blood-2006-05-023028. PMID 17077324.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Hennersdorf F, Florian S, Jakob A, et al. (2005). "Identification of CD13, CD107a, and CD164 as novel basophil-activation markers and dissection of two response patterns in time kinetics of IgE-dependent upregulation". Cell Res. 15 (5): 325—35. doi:10.1038/sj.cr.7290301. PMID 15916720.

[refGRCh38EnsemblENSG00000135535-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135535 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000019818-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019818 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9680353-5] ¹ ² Watt SM, Bühring HJ, Rappold I, Chan JY, Lee-Prudhoe J, Jones T, Zannettino AC, Simmons PJ, Doyonnas R, Sheer D, Butler LH (August 1998). "CD164, a novel sialomucin on CD34(+) and erythroid subsets, is located on human chromosome 6q21". Blood. 92 (3): 849—66. doi:10.1182/blood.V92.3.849. PMID 9680353.

[pmid9763543-6] Zannettino AC, Bühring HJ, Niutta S, Watt SM, Benton MA, Simmons PJ (October 1998). "The sialomucin CD164 (MGC-24v) is an adhesive glycoprotein expressed by human hematopoietic progenitors and bone marrow stromal cells that serves as a potent negative regulator of hematopoiesis". Blood. 92 (8): 2613—28. doi:10.1182/blood.V92.8.2613. PMID 9763543.

[CD-7] Система маркёрных антигенов CD (неопр.). vmede.org. Дата обращения: 11 марта 2021. Архивировано 15 октября 2018 года. (рус.)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Белки: Кластеры дифференцировки
1-50	CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) CD2 CD3 (γ, δ, ε) CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 (a) CD9 CD10 CD11 (a, b, c, d) CD13 CD14 CD15 CD16 (A, B) CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 (A, B) CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 (a, b, c, d) CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 (a, b, c, d, e, f) CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 (E, L, P) CD63 CD64 (A, B, C) CD66 (a, b, c, d, e, f) CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 (a, b) CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 (a, d, e, h, j, k) CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 (a, b) CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 (a, b) CD121 (a, b) CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 (a, b, c) CD157 CD158 (a, d, e, i, k) CD159 (a, c) CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 (a, b) CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 (a, b, g) CD174 CD177 CD178 CD179 (a, b) CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 (a, b) CD212 CD213a (1, 2) CD217 CD218 (a, b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 (a, b) CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD270 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD319 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350
351-400	CD351 CD352 CD353 CD354 CD355 CD357 CD358 CD360 CD361 CD362 CD363 CD364 CD365 CD366 CD367 CD368 CD369 CD370 CD371