PRPF3 (PRPF3)

U4/U6 малоядерный рибонуклеопротеин Prp3
U4/U6 малоядерный рибонуклеопротеин Prp3
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
	Список идентификаторов PDB 1X4Q
Идентификаторы
Символ	PRPF3 ; HPRP3; HPRP3P; PRP3; Prp3p; RP18; SNRNP90
Внешние ID	OMIM: 607301 MGI: 1918017 HomoloGene: 3447 GeneCards: Ген PRPF3
Функция	• protein binding; • identical protein binding; • poly(A) RNA binding;
Компонент клетки	• nucleus; • spliceosomal complex; • nucleolus; • cytoplasm; • Cajal body; • nuclear speck; • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex;
Биологический процесс	• RNA splicing, via transesterification reactions; • mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA processing; • RNA splicing;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

U4 / U6 малоядерный рибонуклеопротеин Prp3 — белок , который у человека кодируется геном PRPF3.^[1]

Удаление интронов из ядерного пре-мРНК происходит в комплексах, называемых сплайсосомами, которые состоят из 4 малоядерных рибонуклеопротеидных (мяРНК) частиц и неопределенного числа временно сопутствующих факторов сплайсинга. PRPF3 является одним из нескольких белков, которые связывают snRNPs с U4 и U6.^[1]

Взаимодействия

PRPF3, как было выявлено, взаимодействуют с DVL3.^[2]

Примечания

↑ ¹ ² Entrez Gene: PRPF3 PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (S. cerevisiae) (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
↑ Rual, Jean-François; Venkatesan Kavitha, Hao Tong, Hirozane-Kishikawa Tomoko, Dricot Amélie, Li Ning, Berriz Gabriel F., Gibbons Francis D., Dreze Matija, Ayivi-Guedehoussou Nono, Klitgord Niels, Simon Christophe, Boxem Mike, Milstein Stuart, Rosenberg Jennifer, Goldberg Debra S., Zhang Lan V., Wong Sharyl L., Franklin Giovanni, Li Siming, Albala Joanna S., Lim Janghoo, Fraughton Carlene, Llamosas Estelle, Cevik Sebiha, Bex Camille, Lamesch Philippe, Sikorski Robert S., Vandenhaute Jean, Zoghbi Huda Y., Smolyar Alex, Bosak Stephanie, Sequerra Reynaldo, Doucette-Stamm Lynn, Cusick Michael E., Hill David E., Roth Frederick P., Vidal Marc. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — England, 2005. — October (vol. 437, no. 7062). — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.

Ссылки

GeneReviews/NIH/NCBI/UW entry on Retinitis Pigmentosa Overview

Литература

Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides. (англ.) // Gene^[англ.] : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
Xu S.Y., Schwartz M., Rosenberg T., Gal A. A ninth locus (RP18) for autosomal dominant retinitis pigmentosa maps in the pericentromeric region of chromosome 1 (англ.) // Human Molecular Genetics^[англ.] : journal. — Oxford University Press, 1997. — Vol. 5, no. 8. — P. 1193—1197. — doi:10.1093/hmg/5.8.1193. — PMID 8842740.
Wang A., Forman-Kay J., Luo Y., et al. Identification and characterization of human genes encoding Hprp3p and Hprp4p, interacting components of the spliceosome (англ.) // Human Molecular Genetics^[англ.] : journal. — Oxford University Press, 1997. — Vol. 6, no. 12. — P. 2117—2126. — doi:10.1093/hmg/6.12.2117. — PMID 9328476.
Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., et al. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene^[англ.] : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
Horowitz D.S., Kobayashi R., Krainer A.R. A new cyclophilin and the human homologues of yeast Prp3 and Prp4 form a complex associated with U4/U6 snRNPs (англ.) // RNA : journal. — 1997. — Vol. 3, no. 12. — P. 1374—1387. — PMID 9404889. — PMC 1369579.
Heng H.H., Wang A., Hu J. Mapping of the human HPRP3 and HPRP4 genes encoding U4/U6-associated splicing factors to chromosomes 1q21.1 and 9q31-q33 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 48, no. 2. — P. 273—275. — doi:10.1006/geno.1997.5181. — PMID 9521884.
Xu S.Y., Rosenberg T., Gal A. Refined genetic mapping of autosomal dominant retinitis pigmentosa locus RP18 reduces the critical region to 2 cM between D1S442 and D1S2858 on chromosome 1q (англ.) // Human Genetics : journal. — 1998. — Vol. 102, no. 4. — P. 493—494. — doi:10.1007/s004390050728. — PMID 9600251.
Reidt U., Reuter K., Achsel T., et al. Crystal structure of the human U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein particle-specific SnuCyp-20, a nuclear cyclophilin (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 11. — P. 7439—7442. — doi:10.1074/jbc.275.11.7439. — PMID 10713041.
Chakarova C.F., Hims M.M., Bolz H., et al. Mutations in HPRP3, a third member of pre-mRNA splicing factor genes, implicated in autosomal dominant retinitis pigmentosa (англ.) // Human Molecular Genetics^[англ.] : journal. — Oxford University Press, 2002. — Vol. 11, no. 1. — P. 87—92. — doi:10.1093/hmg/11.1.87. — PMID 11773002.
Horowitz D.S., Lee E.J., Mabon S.A., Misteli T. A cyclophilin functions in pre-mRNA splicing (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2002. — Vol. 21, no. 3. — P. 470—480. — doi:10.1093/emboj/21.3.470. — PMID 11823439. — PMC 125845.
Gonzalez-Santos J.M., Wang A., Jones J., et al. Central region of the human splicing factor Hprp3p interacts with Hprp4p (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 26. — P. 23764—23772. — doi:10.1074/jbc.M111461200. — PMID 11971898.
Nottrott S., Urlaub H., Lührmann R. Hierarchical, clustered protein interactions with U4/U6 snRNA: a biochemical role for U4/U6 proteins (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2002. — Vol. 21, no. 20. — P. 5527—5538. — doi:10.1093/emboj/cdf544. — PMID 12374753. — PMC 129076.
Ajuh P., Chusainow J., Ryder U., Lamond A.I. A novel function for human factor C1 (HCF-1), a host protein required for herpes simplex virus infection, in pre-mRNA splicing (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2003. — Vol. 21, no. 23. — P. 6590—6602. — doi:10.1093/emboj/cdf652. — PMID 12456665. — PMC 136956.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Martínez-Gimeno M., Gamundi M.J., Hernan I., et al. Mutations in the pre-mRNA splicing-factor genes PRPF3, PRPF8, and PRPF31 in Spanish families with autosomal dominant retinitis pigmentosa (англ.) // Investigative Ophthalmology & Visual Science^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 44, no. 5. — P. 2171—2177. — doi:10.1167/iovs.02-0871. — PMID 12714658.
Reidt U., Wahl M.C., Fasshauer D., et al. Crystal structure of a complex between human spliceosomal cyclophilin H and a U4/U6 snRNP-60K peptide (англ.) // Journal of Molecular Biology^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 331, no. 1. — P. 45—56. — doi:10.1016/S0022-2836(03)00684-3. — PMID 12875835.
Wada Y., Itabashi T., Sato H., Tamai M. Clinical features of a Japanese family with autosomal dominant retinitis pigmentosa associated with a Thr494Met mutation in the HPRP3 gene (англ.) // Graefes Arch. Clin. Exp. Ophthalmol. : journal. — 2005. — Vol. 242, no. 11. — P. 956—961. — doi:10.1007/s00417-004-0923-x. — PMID 15085354.
Stanĕk D., Neugebauer K.M. Detection of snRNP assembly intermediates in Cajal bodies by fluorescence resonance energy transfer (англ.) // Journal of Cell Biology^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 166, no. 7. — P. 1015—1025. — doi:10.1083/jcb.200405160. — PMID 15452143. — PMC 2172029.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Maita H., Kitaura H., Ariga H., Iguchi-Ariga S.M. Association of PAP-1 and Prp3p, the products of causative genes of dominant retinitis pigmentosa, in the tri-snRNP complex (англ.) // Experimental Cell Research^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 302, no. 1. — P. 61—8. — doi:10.1016/j.yexcr.2004.08.022. — PMID 15541726.

[entrez-1] ¹ ² Entrez Gene: PRPF3 PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (S. cerevisiae) (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

[pmid16189514-2] Rual, Jean-François; Venkatesan Kavitha, Hao Tong, Hirozane-Kishikawa Tomoko, Dricot Amélie, Li Ning, Berriz Gabriel F., Gibbons Francis D., Dreze Matija, Ayivi-Guedehoussou Nono, Klitgord Niels, Simon Christophe, Boxem Mike, Milstein Stuart, Rosenberg Jennifer, Goldberg Debra S., Zhang Lan V., Wong Sharyl L., Franklin Giovanni, Li Siming, Albala Joanna S., Lim Janghoo, Fraughton Carlene, Llamosas Estelle, Cevik Sebiha, Bex Camille, Lamesch Philippe, Sikorski Robert S., Vandenhaute Jean, Zoghbi Huda Y., Smolyar Alex, Bosak Stephanie, Sequerra Reynaldo, Doucette-Stamm Lynn, Cusick Michael E., Hill David E., Roth Frederick P., Vidal Marc. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — England, 2005. — October (vol. 437, no. 7062). — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.

[1]

[2]