MAPK6 состоит из 721 аминокислоты, молекулярная масса 82,7 кДа, молекулярная масса транслируемой молекулы — около 100 кДа[7][8]. Описана единственная изоформа белка. Содержит атипический киназный домен на N-конце белка и крупный C-конец. Первые 150 аминокислотных остатков белка на 50 % похожи на таковой у MAPK4/ERK4. Киназный домен имеет 70 % сходства с MAPK4[7][8]. Активационная петля мотива фосфорилирования содержит единственный акцепторный участок фосфорилирования (серин-глутаминовая кислота-глицин)[8].
MAPK6, или ERK3, — атипический фермент семейства MAPK из группы киназ, регулируемых внеклеточными сигналами (ERK). Фосфорилирует белки MAP2 и MAPKAPK5. Точная роль комплекса MAPK6 с MAPKAPK5 не ясна, но известно, что образование комплекса сопровождается сложным процессом фосфорилирования: MAPK6 фосфорилируется по положению серин-189 и затем опосредует фосфорилирование и активацию MAPKAPK5, который, в свою очередь, далее фосфорилирует MAPK6. Возможно, киназа стимулирует вход клетки в клеточный цикл.
Киназа ERK3/MAPK6 широко представлена во многих тканях, однако значительно более высокий уровень экспрессии наблюдается в скелетных мышцах и мозге. Белок локализован в цитоплазме и ядре, но характеризуется коротким времени жизни: менее 1 ч. Деградируется убиквитином с последующим распадом в протеасоме[7].
ERK3/MAPK6 взаимодействует с фосфорилированным ко-рецептором NCOA3/SRC-3, онкогенным белком, вызывающим при высокой экспрессии рак. После фосфорилирования NCOA3 вызывает повышение активности матриксных металлопротеиназ (MMP), причём фосфорилирование по серину-857, вызванному киназой MAPK6, является ключевым для взаимодействия NCOA3/SRC-3 с транскрипционным фактором PEA3, который повышает экспрессию MMP и приводит к проинвазивной клеточной активности[9].
Boulton TG, Nye SH, Robbins DJ, Ip NY, Radziejewska E, Morgenbesser SD, DePinho RA, Panayotatos N, Cobb MH, Yancopoulos GD (May 1991). "ERKs: a family of protein-serine/threonine kinases that are activated and tyrosine phosphorylated in response to insulin and NGF". Cell. 65 (4): 663—75. doi:10.1016/0092-8674(91)90098-J. PMID2032290.
Rai R, Mahale A, Saranath D (August 2004). "Molecular cloning, isolation and characterisation of ERK3 gene from chewing-tobacco induced oral squamous cell carcinoma". Oral Oncology. 40 (7): 705—12. doi:10.1016/j.oraloncology.2004.01.010. PMID15172640.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (October 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173—8. doi:10.1038/nature04209. PMID16189514.