Активатор апоптоза harakiri (Gtmnfgmkj ghkhmk[g harakiri)

Перейти к навигации Перейти к поиску
Активатор апоптоза harakiri
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2L58, 2L5B

Идентификаторы
ПсевдонимыHRK, DP5, HARAKIRI, harakiri, BCL2 interacting protein
Внешние IDOMIM: 603447 MGI: 1201608 HomoloGene: 136405 GeneCards: HRK
Расположение гена (человек)
12-я хромосома человека
Хр.12-я хромосома человека[1]
12-я хромосома человека
Расположение в геноме HRK
Расположение в геноме HRK
Локус12q24.22Начало116,856,144 bp[1]
Конец116,881,441 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
5-я хромосома мыши
Хр.5-я хромосома мыши[2]
5-я хромосома мыши
Расположение в геноме HRK
Расположение в геноме HRK
Локус5|5 FНачало118,302,713 bp[2]
Конец118,327,543 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003806

NM_007545

RefSeq (белок)

NP_003797

NP_031571

Локус (UCSC)Chr 12: 116.86 – 116.88 MbChr 5: 118.3 – 118.33 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Активатор апоптоза harakiri (HRK) — белок семейства Bcl2, активатор апоптоза, который у человека кодируется геном HRK.

Структура гена, мРНК и белка

[править | править код]

кДНК HRK была впервые независимо клонирована из клеток HeLa и симпатических нейронов крыс в 1997 году[5][6]. кДНК HRK человека имела длину около 700 нуклеотидов и включала 5'- и 3'-некодирующие области, кодирующую область и поли(А)-хвост. В 3'-некодирующей области был обнаружен сигнал дестабилизации мРНК 5'-ATTTA-3'[5].

Ген HRK кодирует белок длиной в 91 аминокислотный остаток. Гомологи HRK по первичной структуре пока не обнаружены. Фрагмент 37—44 гомологичен домену BH3 (англ. Bcl-2 homology domain 3)[5].

Распространение и внутриклеточная локализация

[править | править код]

Методом нозерн-блота мРНК HRK была обнаружена в лимфоидных органах, особенно в селезёнке и костном мозге, а также в поджелудочной железе человека[5]. Хотя методом полногеномного секвенирования РНК присутствие мРНК HRK в селезёнке и костном мозге выявить не удалось, небольшие её количества были обнаружены в лимфатических узлах, коре головного мозга, щитовидной железе, надпочечниках и тестикулах[7].

мРНК HRK была обнаружена только в головном мозге взрослых крыс и отсутствовала в селезёнке, тимусе, тестикулах, тонком кишечнике, сердечной и скелетных мышцах[6].

Методом иммуногистохимии низкие и средние количества белка Hrk были обнаружены во многих органах, при этом препараты тонкого кишечника, поджелудочной железы, кожи, молочных желёз и лимфоидных тканей имели, как правило, отрицательную окраску (белок отсутствует)[7].

В клетках HRK локализуется преимущественно в митохондриях и взаимодействует там с белком митохондриального матрикса p32[8].

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135116 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046607 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. 1 2 3 4 Inohara N., Ding L., Chen S., Núñez G. harakiri, a novel regulator of cell death, encodes a protein that activates apoptosis and interacts selectively with survival-promoting proteins Bcl-2 and Bcl-X(L) // EMBO J. — 1997. — Vol. 16, № 7. — P. 1686—94. — PMID 9130713.
  6. 1 2 Imaizumi K., Tsuda M., Imai Y., Wanaka A., Takagi T., Tohyama M. Molecular cloning of a novel polypeptide, DP5, induced during programmed neuronal death // J Biol Chem. — 1997. — Vol. 272, № 30. — P. 18842—8. — PMID 9228060. Архивировано 27 августа 2014 года.
  7. 1 2 HRK в базе данных The Human Protein Atlas. Дата обращения: 7 апреля 2014. Архивировано 9 апреля 2014 года.
  8. Sunayama J., Ando Y., Itoh N., Tomiyama A., Sakurada K., Sugiyama A., Kang D., Tashiro F., Gotoh Y., Kuchino Y., Kitanaka C. Physical and functional interaction between BH3-only protein Hrk and mitochondrial pore-forming protein p32 // Cell Death Differ. — 2004. — Vol. 11, № 7. — P. 771—81. — PMID 15031724. Архивировано 10 апреля 2014 года.