Активатор апоптоза harakiri (HRK ) — белок семейства Bcl2 , активатор апоптоза , который у человека кодируется геном HRK .
кДНК HRK была впервые независимо клонирована из клеток HeLa и симпатических нейронов крыс в 1997 году[ 5] [ 6] . кДНК HRK человека имела длину около 700 нуклеотидов и включала 5'- и 3'-некодирующие области, кодирующую область и поли(А)-хвост . В 3'-некодирующей области был обнаружен сигнал дестабилизации мРНК 5'-ATTTA-3'[ 5] .
Ген HRK кодирует белок длиной в 91 аминокислотный остаток . Гомологи HRK по первичной структуре пока не обнаружены. Фрагмент 37—44 гомологичен домену BH3 (англ. Bcl-2 homology domain 3 )[ 5] .
Методом нозерн-блота мРНК HRK была обнаружена в лимфоидных органах, особенно в селезёнке и костном мозге , а также в поджелудочной железе человека[ 5] . Хотя методом полногеномного секвенирования РНК присутствие мРНК HRK в селезёнке и костном мозге выявить не удалось, небольшие её количества были обнаружены в лимфатических узлах , коре головного мозга , щитовидной железе , надпочечниках и тестикулах [ 7] .
мРНК HRK была обнаружена только в головном мозге взрослых крыс и отсутствовала в селезёнке, тимусе , тестикулах, тонком кишечнике , сердечной и скелетных мышцах [ 6] .
Методом иммуногистохимии низкие и средние количества белка Hrk были обнаружены во многих органах, при этом препараты тонкого кишечника, поджелудочной железы, кожи , молочных желёз и лимфоидных тканей имели, как правило, отрицательную окраску (белок отсутствует)[ 7] .
В клетках HRK локализуется преимущественно в митохондриях и взаимодействует там с белком митохондриального матрикса p32[ 8] .
↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135116 - Ensembl , May 2017
↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046607 - Ensembl , May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ 1 2 3 4 Inohara N., Ding L., Chen S., Núñez G. harakiri, a novel regulator of cell death, encodes a protein that activates apoptosis and interacts selectively with survival-promoting proteins Bcl-2 and Bcl-X(L) // EMBO J. — 1997. — Vol. 16, № 7 . — P. 1686—94. — PMID 9130713 .
↑ 1 2 Imaizumi K., Tsuda M., Imai Y., Wanaka A., Takagi T., Tohyama M. Molecular cloning of a novel polypeptide, DP5, induced during programmed neuronal death // J Biol Chem. — 1997. — Vol. 272, № 30 . — P. 18842—8. — PMID 9228060 . Архивировано 27 августа 2014 года.
↑ 1 2 HRK в базе данных The Human Protein Atlas (неопр.) . Дата обращения: 7 апреля 2014. Архивировано 9 апреля 2014 года.
↑ Sunayama J., Ando Y., Itoh N., Tomiyama A., Sakurada K., Sugiyama A., Kang D., Tashiro F., Gotoh Y., Kuchino Y., Kitanaka C. Physical and functional interaction between BH3-only protein Hrk and mitochondrial pore-forming protein p32 // Cell Death Differ. — 2004. — Vol. 11, № 7 . — P. 771—81. — PMID 15031724 . Архивировано 10 апреля 2014 года.