RBBP4 (RBBP4)

Перейти к навигации Перейти к поиску
Связывающий ретинобластому белок 4
Представлено на основе PDB 2XU7.Представлено на основе PDB 2XU7.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2XU7, 3GFC

Идентификаторы
Символ RBBP4 ; NURF55; RBAP48; lin-53
Внешние ID OMIM: 602923 MGI: 1194912 HomoloGene: 21153 GeneCards: Ген RBBP4
Генная онтология
Функция • RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding

• RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding
• protein binding
• DNA-dependent ATPase activity
• nucleosomal DNA binding
• histone binding

• histone deacetylase binding
Компонент клетки • nuclear chromatin

• nucleus
• nucleoplasm
• Sin3 complex
• NuRD complex
• NURF complex
• CAF-1 complex
• ESC/E(Z) complex

• protein complex
Биологический процесс • G2/M transition of mitotic cell cycle

• mitotic cell cycle
• ATP catabolic process
• DNA replication
• nucleosome assembly
• DNA replication-dependent nucleosome assembly
• DNA replication-independent nucleosome assembly
• chromatin remodeling
• transcription, DNA-templated
• regulation of transcription, DNA-templated
• negative regulation of cell proliferation
• chromatin assembly
• centromere-specific nucleosome assembly
• ATP-dependent chromatin remodeling

• regulation of cell cycle
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5928 19646
Ensembl ENSG00000162521 ENSMUSG00000057236
UniProt Q09028 Q60972
RefSeq (мРНК) NM_001135255 NM_009030
RefSeq (белок) NP_001128727 NP_033056
Локус (UCSC) Chr 1:
33.12 – 33.15 Mb		 Chr 4:
129.31 – 129.34 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Связывающий гистоны белок RBBP4 (также известный как RbAp48 или NURF55 ) — белок, кодируемый у человека геном RBBP4 .[1][2]

Функция

[править | править код]

Этот ген кодирует повсеместно экспрессированный ядерный белок, который принадлежит к весьма консервативным подсемействам WD-повторных белков. Он присутствует в белковых комплексах, участвующих в ацетилировании гистонов и сборке хроматина. Это является частью Mi-2/NuRD комплекса, который был причастен к ремоделированию хроматина и репрессии транскрипции, связанных с деацетилированием гистонов. Этот кодируемый белок также является частью корепрессора комплексов, которые являются неотъемлемой частью транскрипционного сайленсинга. Это выявлено среди нескольких клеточных белков, которые связываются непосредственно с белком ретинобластомы для регуляции пролиферации клеток. Этот белок также, кажется, вовлечен в репрессию транскрипции E2F-респонсивных генов.[3]

Клиническое значение

[править | править код]

Снижение RbAp48 в зубчатой извилине гиппокампа мозга, как подозревают, является основной причиной потери памяти при нормальном старении.[4] Возрастное снижение RbAp48 наблюдается в зубчатой извилине при вскрытии тканей после смерти человека, а также у мышей. Кроме того кнокин-ген[англ.] в доминантной негативной форме RbAp48 вызывает дефицит памяти у молодых мышей подобно тому, что наблюдается у пожилых мышей. И, наконец, перенос генов лентивирусов для увеличения экспрессии RbAp48 в мозге, реверсирует нарушения памяти у пожилых мышей.[4]

RBBP4 использует частично PKA- CREB1-CPB пути.[4] Таким образом, одним из возможных терапевтических подходов для восстановления возрастной потери памяти является использование PKA-CREB1-CPB путей метаболизма стимулирующих препаратов. Ранее было показано, что агонисты дофамина D1/D5, такие как 6-Br-APB и SKF-38393 , которые положительно соединены с аденилатциклазой и цАМФ Фосфодиэстеразы ингибитора ролипрама[англ.] уменьшают дефекты памяти у пожилых мышей.[5]

Взаимодействия

[править | править код]

RBBP4, как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания

[править | править код]
  1. ↑ Qian Y.W., Wang Y.C., Hollingsworth RE Jr, Jones D., Ling N., Lee E.Y. A retinoblastoma-binding protein related to a negative regulator of Ras in yeast (англ.) // Nature : journal. — 1993. — September (vol. 364, no. 6438). — P. 648—652. — doi:10.1038/364648a0. — PMID 8350924.
  2. ↑ Barak O., Lazzaro M.A., Lane W.S., Speicher D.W., Picketts D.J., Shiekhattar R. Isolation of human NURF: a regulator of Engrailed gene expression (англ.) // EMBO J : journal. — 2003. — November (vol. 22, no. 22). — P. 6089—6100. — doi:10.1093/emboj/cdg582. — PMID 14609955. — PMC 275440.
  3. ↑ Entrez Gene: RBBP4 retinoblastoma-binding protein 4.
  4. ↑ 1 2 3 Pavlopoulos E., Jones S., Kosmidis S., Close M., Kim C., Kovalerchik O., Small S.A., Kandel E.R. Molecular Mechanism for Age-Related Memory Loss: The Histone-Binding Protein RbAp48 (англ.) // Sci Transl Med[англ.] : journal. — 2013. — August (vol. 5, no. 200). — P. 200ra115. — doi:10.1126/scitranslmed.3006373. — PMID 23986399.
  5. ↑ Bach M.E., Barad M., Son H., Zhuo M., Lu Y.F., Shih R., Mansuy I., Hawkins R.D., Kandel E.R. Age-related defects in spatial memory are correlated with defects in the late phase of hippocampal long-term potentiation in vitro and are attenuated by drugs that enhance the cAMP signaling pathway (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — April (vol. 96, no. 9). — P. 5280—5285. — doi:10.1073/pnas.96.9.5280. — PMID 10220457. — PMC 21855.
  6. ↑ Yarden R.I., Brody L.C. BRCA1 interacts with components of the histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 9. — P. 4983—4988. — doi:10.1073/pnas.96.9.4983. — PMID 10220405. — PMC 21803.
  7. ↑ Zhang Q., Vo N., Goodman R.H. Histone binding protein RbAp48 interacts with a complex of CREB binding protein and phosphorylated CREB (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 14. — P. 4970—4978. — doi:10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000. — PMID 10866654. — PMC 85947.
  8. ↑ Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 2. — P. 536—546. — doi:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. — PMID 11756549. — PMC 139742.
  9. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau M.L. Dual mechanisms of regulation of transcription of luteinizing hormone receptor gene by nuclear orphan receptors and histone deacetylase complexes (англ.) // J. Steroid Biochem. Mol. Biol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 85, no. 2—5. — P. 401—414. — doi:10.1016/S0960-0760(03)00230-9. — PMID 12943729.
  10. ↑ 1 2 Yao Y.L., Yang W.M. The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 43. — P. 42560—42568. — doi:10.1074/jbc.M302955200. — PMID 12920132.
  11. ↑ 1 2 3 Nicolas E., Ait-Si-Ali S., Trouche D. The histone deacetylase HDAC3 targets RbAp48 to the retinoblastoma protein (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — 2001. — Vol. 29, no. 15. — P. 3131—3136. — doi:10.1093/nar/29.15.3131. — PMID 11470869. — PMC 55834.
  12. ↑ Grozinger C.M., Hassig C.A., Schreiber S.L. Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 9. — P. 4868—4873. — doi:10.1073/pnas.96.9.4868. — PMID 10220385. — PMC 21783.
  13. ↑ You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98, no. 4. — P. 1454—1458. — doi:10.1073/pnas.98.4.1454. — PMID 11171972. — PMC 29278.
  14. ↑ 1 2 Hassig C.A., Fleischer T.C., Billin A.N., Schreiber S.L., Ayer D.E. Histone deacetylase activity is required for full transcriptional repression by mSin3A (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 341—347. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80214-7. — PMID 9150133.
  15. ↑ Ng H.H., Zhang Y., Hendrich B., Johnson C.A., Turner B.M., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 is a transcriptional repressor belonging to the MeCP1 histone deacetylase complex (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23, no. 1. — P. 58—61. — doi:10.1038/12659. — PMID 10471499.
  16. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 15. — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
  17. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau M.L. Silencing of transcription of the human luteinizing hormone receptor gene by histone deacetylase-mSin3A complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 36. — P. 33431—33438. — doi:10.1074/jbc.M204417200. — PMID 12091390.
  18. ↑ Hassig C.A., Tong J.K., Fleischer T.C., Owa T., Grable P.G., Ayer D.E., Schreiber S.L. A role for histone deacetylase activity in HDAC1-mediated transcriptional repression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — Vol. 95, no. 7. — P. 3519—3524. — doi:10.1073/pnas.95.7.3519. — PMID 9520398. — PMC 19868.
  19. ↑ Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 357—364. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80216-0. — PMID 9150135.
  20. ↑ Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 9. — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.
  21. ↑ Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395, no. 6705. — P. 917—921. — doi:10.1038/27699. — PMID 9804427.
  22. ↑ Qian Y.W., Lee E.Y. Dual retinoblastoma-binding proteins with properties related to a negative regulator of ras in yeast (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. — Vol. 270, no. 43. — P. 25507—25513. — doi:10.1074/jbc.270.43.25507. — PMID 7503932.
  23. ↑ Nicolas E., Morales V., Magnaghi-Jaulin L., Harel-Bellan A., Richard-Foy H., Trouche D. RbAp48 belongs to the histone deacetylase complex that associates with the retinoblastoma protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 13. — P. 9797—9804. — doi:10.1074/jbc.275.13.9797. — PMID 10734134.
  24. ↑ 1 2 Zhang Y., Sun Z.W., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex (англ.) // Mol. Cell[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 1, no. 7. — P. 1021—1031. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80102-1. — PMID 9651585.
  25. ↑ Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1) (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 3. — P. 835—848. — doi:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. — PMID 11784859. — PMC 133546.

Литература

[править | править код]
Источник — https://ru.wikipedia.org/wiki/RBBP4