MBD2 (MBD2)

Метил-CpG-связывающий домен белка 2
Метил-CpG-связывающий домен белка 2
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
	Список идентификаторов PDB 2L2L
Идентификаторы
Символ	MBD2 ; DMTase; NY-CO-41
Внешние ID	OMIM: 603547 MGI: 1333813 HomoloGene: 2918 GeneCards: Ген MBD2
Функция	• RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding; • satellite DNA binding; • mRNA binding; • protein binding; • methyl-CpG binding; • protein domain specific binding; • nucleosomal DNA binding; • siRNA binding; • C2H2 zinc finger domain binding;
Компонент клетки	• histone deacetylase complex; • nuclear chromatin; • heterochromatin; • nucleus; • cytoplasm; • protein complex;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of Wnt signaling pathway; • regulation of cell proliferation; • maternal behavior; • ATP-dependent chromatin remodeling; • cellular protein complex assembly; • negative regulation of transcription, DNA-templated;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Метил-CpG-связывающий домен белка 2 — белок, кодируемый у человека геном MBD2^[1]^[2].

Функция

Метилирование ДНК является основным видом модификации эукариотических геномов и играет важную роль в развитии млекопитающих. Белки человека MECP2, MBD1, MBD2, MBD3 и MBD4 представляют собой семейство ядерных белков, относимых к одной группе по признаку наличием в каждом из них метил-CpG-связывающего домена (MBD). Каждый из этих белков, за исключением MBD3, способен специфически связываться с метилированной ДНК. MECP2, MBD1 и MBD2 также могут репрессировать транскрипцию с метилированных промоторов. Белок, кодируемый этим геном, возможно играет роль посредника в биологическом ответе на сигнала метилирования. Также поступали сообщения, что этот белок функционирует как деметилаза, активируя транскрипцию, так как метилирование в промоторных областях ДНК вызывает сайленсинг генов^[3].

Взаимодействия

MBD2, как было выяснено, взаимодействует с:

Примечания

↑ Hendrich B., Bird A. Identification and Characterization of a Family of Mammalian Methyl-CpG Binding Proteins (англ.) // Mol Cell Biol : journal. — 1998. — November (vol. 18, no. 11). — P. 6538—6547. — PMID 9774669. — PMC 109239.
↑ Hendrich B., Abbott C., McQueen H., Chambers D., Cross S., Bird A. Genomic structure and chromosomal mapping of the murine and human Mbd1, Mbd2, Mbd3, and Mbd4 genes (англ.) // Mamm Genome^[англ.] : journal. — 1999. — September (vol. 10, no. 9). — P. 906—912. — doi:10.1007/s003359901112. — PMID 10441743.
↑ Entrez Gene: MBD2 methyl-CpG binding domain protein 2 (неопр.).
↑ ¹ ² ³ Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — October (vol. 277, no. 43). — P. 40958—40966. — doi:10.1074/jbc.M207467200. — PMID 12183469.
↑ Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — January (vol. 22, no. 2). — P. 536—546. — doi:10.1128/mcb.22.2.536-546.2002. — PMID 11756549. — PMC 139742.
↑ ¹ ² Ng H.H., Zhang Y., Hendrich B., Johnson C.A., Turner B.M., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 is a transcriptional repressor belonging to the MeCP1 histone deacetylase complex (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — September (vol. 23, no. 1). — P. 58—61. — doi:10.1038/12659. — PMID 10471499.
↑ ¹ ² ³ Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — August (vol. 13, no. 15). — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
↑ Jiang C.L., Jin S.G., Pfeifer G.P. MBD3L1 is a transcriptional repressor that interacts with methyl-CpG-binding protein 2 (MBD2) and components of the NuRD complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — December (vol. 279, no. 50). — P. 52456—52464. — doi:10.1074/jbc.M409149200. — PMID 15456747.
↑ Sekimata M., Takahashi A., Murakami-Sekimata A., Homma Y. Involvement of a novel zinc finger protein, MIZF, in transcriptional repression by interacting with a methyl-CpG-binding protein, MBD2 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — November (vol. 276, no. 46). — P. 42632—42638. — doi:10.1074/jbc.M107048200. — PMID 11553631.
↑ Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. The minimal repression domain of MBD2b overlaps with the methyl-CpG-binding domain and binds directly to Sin3A (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — November (vol. 275, no. 45). — P. 34963—34967. — doi:10.1074/jbc.M005929200. — PMID 10950960.

Литература

Scanlan M.J., Chen Y.T., Williamson B., Gure A.O., Stockert E., Gordan J.D., Türeci O., Sahin U., Pfreundschuh M., Old L.J. Characterization of human colon cancer antigens recognized by autologous antibodies (англ.) // Int. J. Cancer^[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 76, no. 5. — P. 652—658. — doi:10.1002/(SICI)1097-0215(19980529)76:5<652::AID-IJC7>3.0.CO;2-P. — PMID 9610721.
Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.P., Lane W.S., Reinberg D. The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 95, no. 2. — P. 279—289. — doi:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. — PMID 9790534.
Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395, no. 6705. — P. 917—921. — doi:10.1038/27699. — PMID 9804427.
Bhattacharya S.K., Ramchandani S., Cervoni N., Szyf M. A mammalian protein with specific demethylase activity for mCpG DNA (англ.) // Nature : journal. — 1999. — Vol. 397, no. 6720. — P. 579—583. — doi:10.1038/17533. — PMID 10050851.
Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 15. — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
Ng H.H., Zhang Y., Hendrich B., Johnson C.A., Turner B.M., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 is a transcriptional repressor belonging to the MeCP1 histone deacetylase complex (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23, no. 1. — P. 58—61. — doi:10.1038/12659. — PMID 10471499.
Tatematsu K.I., Yamazaki T., Ishikawa F. MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase (англ.) // Genes Cells^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 5, no. 8. — P. 677—688. — doi:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x. — PMID 10947852.
Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. The minimal repression domain of MBD2b overlaps with the methyl-CpG-binding domain and binds directly to Sin3A (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 275, no. 45. — P. 34963—34967. — doi:10.1074/jbc.M005929200. — PMID 10950960.
Humphrey G.W., Wang Y., Russanova V.R., Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard B.H. Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 9. — P. 6817—6824. — doi:10.1074/jbc.M007372200. — PMID 11102443.
Feng Q., Zhang Y. The MeCP1 complex represses transcription through preferential binding, remodeling, and deacetylating methylated nucleosomes (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2001. — Vol. 15, no. 7. — P. 827—832. — doi:10.1101/gad.876201. — PMID 11297506. — PMC 312663.
Sekimata M., Takahashi A., Murakami-Sekimata A., Homma Y. Involvement of a novel zinc finger protein, MIZF, in transcriptional repression by interacting with a methyl-CpG-binding protein, MBD2 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 46. — P. 42632—42638. — doi:10.1074/jbc.M107048200. — PMID 11553631.
Müller-Tidow C., Kügler K., Diederichs S., Klümpen S., Möller M., Vogt U., Metzger R., Schneider P.M., Berdel W.E., Serve H. Loss of expression of HDAC-recruiting methyl-CpG-binding domain proteins in human cancer (англ.) // Br. J. Cancer^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 85, no. 8. — P. 1168—1174. — doi:10.1054/bjoc.2001.2041. — PMID 11710831. — PMC 2375156.
Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identification and Functional Characterization of the p66/p68 Components of the MeCP1 Complex (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 2. — P. 536—546. — doi:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. — PMID 11756549. — PMC 139742.
Bakker J., Lin X., Nelson W.G. Methyl-CpG binding domain protein 2 represses transcription from hypermethylated pi-class glutathione S-transferase gene promoters in hepatocellular carcinoma cells (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 25. — P. 22573—22580. — doi:10.1074/jbc.M203009200. — PMID 11960994.
Saito M., Ishikawa F. The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 38. — P. 35434—35439. — doi:10.1074/jbc.M203455200. — PMID 12124384.
Detich N., Theberge J., Szyf M. Promoter-specific activation and demethylation by MBD2/demethylase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 39. — P. 35791—35794. — doi:10.1074/jbc.C200408200. — PMID 12177048.
Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 43. — P. 40958—40966. — doi:10.1074/jbc.M207467200. — PMID 12183469.
Krithivas A., Fujimuro M., Weidner M., Young D.B., Hayward S.D. Protein Interactions Targeting the Latency-Associated Nuclear Antigen of Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus to Cell Chromosomes (англ.) // J. Virol.^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 76, no. 22. — P. 11596—11604. — doi:10.1128/JVI.76.22.11596-11604.2002. — PMID 12388720. — PMC 136775.

[pmid9774669-1] Hendrich B., Bird A. Identification and Characterization of a Family of Mammalian Methyl-CpG Binding Proteins (англ.) // Mol Cell Biol : journal. — 1998. — November (vol. 18, no. 11). — P. 6538—6547. — PMID 9774669. — PMC 109239.

[pmid10441743-2] Hendrich B., Abbott C., McQueen H., Chambers D., Cross S., Bird A. Genomic structure and chromosomal mapping of the murine and human Mbd1, Mbd2, Mbd3, and Mbd4 genes (англ.) // Mamm Genome^[англ.] : journal. — 1999. — September (vol. 10, no. 9). — P. 906—912. — doi:10.1007/s003359901112. — PMID 10441743.

[entrez-3] Entrez Gene: MBD2 methyl-CpG binding domain protein 2 (неопр.).

[pmid12183469-4] ¹ ² ³ Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — October (vol. 277, no. 43). — P. 40958—40966. — doi:10.1074/jbc.M207467200. — PMID 12183469.

[pmid11756549-5] Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — January (vol. 22, no. 2). — P. 536—546. — doi:10.1128/mcb.22.2.536-546.2002. — PMID 11756549. — PMC 139742.

[pmid10471499-6] ¹ ² Ng H.H., Zhang Y., Hendrich B., Johnson C.A., Turner B.M., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 is a transcriptional repressor belonging to the MeCP1 histone deacetylase complex (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — September (vol. 23, no. 1). — P. 58—61. — doi:10.1038/12659. — PMID 10471499.

[pmid10444591-7] ¹ ² ³ Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — August (vol. 13, no. 15). — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.

[pmid15456747-8] Jiang C.L., Jin S.G., Pfeifer G.P. MBD3L1 is a transcriptional repressor that interacts with methyl-CpG-binding protein 2 (MBD2) and components of the NuRD complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — December (vol. 279, no. 50). — P. 52456—52464. — doi:10.1074/jbc.M409149200. — PMID 15456747.

[pmid11553631-9] Sekimata M., Takahashi A., Murakami-Sekimata A., Homma Y. Involvement of a novel zinc finger protein, MIZF, in transcriptional repression by interacting with a methyl-CpG-binding protein, MBD2 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — November (vol. 276, no. 46). — P. 42632—42638. — doi:10.1074/jbc.M107048200. — PMID 11553631.

[pmid10950960-10] Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. The minimal repression domain of MBD2b overlaps with the methyl-CpG-binding domain and binds directly to Sin3A (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — November (vol. 275, no. 45). — P. 34963—34967. — doi:10.1074/jbc.M005929200. — PMID 10950960.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]