ARNT (ARNT)

ARNT
ARNT
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2K7S, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4LPZ, 4XT2
Идентификаторы
Псевдонимы	ARNT, HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
Внешние ID	OMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: ARNT
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	1-я хромосома человека
Конец	150,876,708 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	3-я хромосома мыши
Конец	95,404,551 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	epithelium of colon; ; sural nerve; ; stromal cell of endometrium; ; ectocervix; ; body of uterus;
	Наибольшая экспрессия в
	muscle of thigh; ; cumulus cell;
	Дополнительные справочные данные
	; ; ; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	sequence-specific DNA binding; ДНК-связывающий; protein dimerization activity; DNA-binding transcription factor activity; transcription coactivator activity; aryl hydrocarbon receptor binding; transcription factor binding; связывание с белками плазмы; protein heterodimerization activity; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; гомодимеризация белка; sequence-specific double-stranded DNA binding; nuclear receptor activity;
Компонент клетки	цитоплазма; transcription regulator complex; нуклеоплазма; RNA polymerase II transcription regulator complex; клеточное ядро; ядерные тельца;
Биологический процесс	positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; дифференцировка клеток; response to hypoxia; ДНК-зависимая регуляция транскрипции; positive regulation of endothelial cell proliferation; regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress; positive regulation of erythrocyte differentiation; embryonic placenta development; mRNA transcription by RNA polymerase II; positive regulation of protein sumoylation; транскрипция, ДНК-зависимая; ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции; intracellular receptor signaling pathway; regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; positive regulation of vascular endothelial growth factor production; positive regulation of glycolytic process; положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор; positive regulation of hormone biosynthetic process; xenobiotic metabolic process;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	405
	11863
	ENSG00000143437
	ENSMUSG00000015522
	P27540
	P53762
NM_001197325; NM_001286035; NM_001286036; NM_001668; NM_178426;
	NM_178427; NM_001350224; NM_001350225; NM_001350226
	NM_001037737; NM_009709
NP_001184254; NP_001272964; NP_001272965; NP_001659; NP_848514;
	NP_001337153; NP_001337154; NP_001337155
	NP_001032826; NP_033839
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

ARNT (сокр. от англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator) — ядерный транслокатор (переносчик) рецептора ароматических углеводородов (AHR), представляет собой белок, который образует комплекс с лиганд-связанным рецептором AHR и необходим для рецепторной функции. Кодируется одноимённым геном ARNT, локализован на коротком плече (p-плече) 1-хромосомы^[5].

Закодированный белок также идентифицирован как бета-субъединица гетеродимерного транскрипционного фактора — фактора, индуцируемого гипоксией (HIF1β). Транслокация t(1; 12) (q21; p13), приводящая к слипанию с белком TEL-ARNT, связана с острым миелобластическим лейкозом. Для этого гена описаны три альтернативные сплайсированные варианты, кодирующие различные изоформы.

Рецептор ароматических углеводородов (АHR) участвует в индукции нескольких ферментов, которые участвуют в метаболизме ксенобиотиков. Лиганд-цитозольная форма рецептора ароматических углеводородов комплексно связана с белком теплового шока (Hsp90). Связывание лигандов, включаящие в себя диоксины (ТХДД) и полициклические ароматические углеводороды (ПАУ), приводит к транслокации (перемещению) лигандсвязывающей субъединицы только в^[6] клеточное ядро. Индукция ферментов, участвующих в метаболизме ксенобиотиков, происходит за счёт связывания лиганд-связанного AhR с чувствительными к ксенобиотическими элементами в промоторных областях генов для этих ферментов.

Взаимодействия с другими белками

ARNT взаимодействует со следующими белками:

AIP,^[7]^[8]
AHR,^[9]^[10]^[11]^[12]
EPAS1,^[13]
HIF1A,^[13]^[14]
NCOA2,^[15]^[15]
SIM1,^[14]^[16] и
SIM2.^[14]^[16]^[17]^[18]

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143437 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015522 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:700 (англ.). Дата обращения: 21 сентября 2017. Архивировано 21 сентября 2017 года.
↑ Hughes D., Guttenplan J. B., Marcus C. B., Subbaramaiah K., Dannenberg A. J. Heat Shock Protein 90 Inhibitors Suppress Aryl Hydrocarbon Receptor-Mediated Activation of CYP1A1 and CYP1B1 Transcription and DNA Adduct Formation (англ.) // Cancer Prevention Research. — 2008. — 1 November (vol. 1, no. 6). — P. 485—493. — ISSN 1940-6207. — doi:10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149. [исправить]
↑ Carver L.A., Bradfield C.A. Ligand-dependent interaction of the aryl hydrocarbon receptor with a novel immunophilin homolog in vivo (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — April (vol. 272, no. 17). — P. 11452—11456. — doi:10.1074/jbc.272.17.11452. — PMID 9111057.
↑ Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I. The hsp90 chaperone complex regulates intracellular localization of the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — April (vol. 21, no. 7). — P. 2594—2607. — doi:10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001. — PMID 11259606. — PMC 86890.
↑ Lindebro M.C., Poellinger L., Whitelaw M.L. Protein-protein interaction via PAS domains: role of the PAS domain in positive and negative regulation of the bHLH/PAS dioxin receptor-Arnt transcription factor complex (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1995. — July (vol. 14, no. 14). — P. 3528—3539. — PMID 7628454. — PMC 394421.
↑ Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson J.A., Poellinger L. Ligand-dependent recruitment of the Arnt coregulator determines DNA recognition by the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1993. — April (vol. 13, no. 4). — P. 2504—2514. — PMID 8384309. — PMC 359572.
↑ Yamaguchi Y., Kuo M.T. Functional analysis of aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator interactions with aryl hydrocarbon receptor in the yeast two-hybrid system (англ.) // Biochemical Pharmacology^[англ.] : journal. — 1995. — October (vol. 50, no. 8). — P. 1295—1302. — doi:10.1016/0006-2952(95)02016-6. — PMID 7488247.
↑ Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Identification of a novel mechanism of regulation of Ah (dioxin) receptor function (англ.) // Genes & Development : journal. — 1999. — January (vol. 13, no. 1). — P. 20—5. — doi:10.1101/gad.13.1.20. — PMID 9887096. — PMC 316371.
↑ ¹ ² Hogenesch J.B., Chan W.K., Jackiw V.H., Brown R.C., Gu Y.Z., Pray-Grant M., Perdew G.H., Bradfield C.A. Characterization of a subset of the basic-helix-loop-helix-PAS superfamily that interacts with components of the dioxin signaling pathway (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — March (vol. 272, no. 13). — P. 8581—8593. — doi:10.1074/jbc.272.13.8581. — PMID 9079689.
↑ ¹ ² ³ Woods S.L., Whitelaw M.L. Differential activities of murine single minded 1 (SIM1) and SIM2 on a hypoxic response element. Cross-talk between basic helix-loop-helix/per-Arnt-Sim homology transcription factors (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — March (vol. 277, no. 12). — P. 10236—10243. — doi:10.1074/jbc.M110752200. — PMID 11782478.
↑ ¹ ² Beischlag T.V., Wang S., Rose D.W., Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson W.E., Probst M.R., Rosenfeld M.G., Hankinson O. Recruitment of the NCoA/SRC-1/p160 family of transcriptional coactivators by the aryl hydrocarbon receptor/aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — June (vol. 22, no. 12). — P. 4319—4333. — doi:10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002. — PMID 12024042. — PMC 133867.
↑ ¹ ² Probst M.R., Fan C.M., Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Two murine homologs of the Drosophila single-minded protein that interact with the mouse aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — February (vol. 272, no. 7). — P. 4451—4457. — doi:10.1074/jbc.272.7.4451. — PMID 9020169.
↑ Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2004. — January (vol. 24, no. 2). — P. 608—616. — doi:10.1128/mcb.24.2.608-616.2004. — PMID 14701734. — PMC 343817.
↑ Moffett P., Reece M., Pelletier J. The murine Sim-2 gene product inhibits transcription by active repression and functional interference (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — September (vol. 17, no. 9). — P. 4933—4947. — doi:10.1128/mcb.17.9.4933. — PMID 9271372. — PMC 232345.

[refGRCh38EnsemblENSG00000143437-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143437 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000015522-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015522 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:700 (англ.). Дата обращения: 21 сентября 2017. Архивировано 21 сентября 2017 года.

[HSP90-2009-6] Hughes D., Guttenplan J. B., Marcus C. B., Subbaramaiah K., Dannenberg A. J. Heat Shock Protein 90 Inhibitors Suppress Aryl Hydrocarbon Receptor-Mediated Activation of CYP1A1 and CYP1B1 Transcription and DNA Adduct Formation (англ.) // Cancer Prevention Research. — 2008. — 1 November (vol. 1, no. 6). — P. 485—493. — ISSN 1940-6207. — doi:10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149. [исправить]

[pmid9111057-7] Carver L.A., Bradfield C.A. Ligand-dependent interaction of the aryl hydrocarbon receptor with a novel immunophilin homolog in vivo (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — April (vol. 272, no. 17). — P. 11452—11456. — doi:10.1074/jbc.272.17.11452. — PMID 9111057.

[pmid11259606-8] Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I. The hsp90 chaperone complex regulates intracellular localization of the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — April (vol. 21, no. 7). — P. 2594—2607. — doi:10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001. — PMID 11259606. — PMC 86890.

[pmid7628454-9] Lindebro M.C., Poellinger L., Whitelaw M.L. Protein-protein interaction via PAS domains: role of the PAS domain in positive and negative regulation of the bHLH/PAS dioxin receptor-Arnt transcription factor complex (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1995. — July (vol. 14, no. 14). — P. 3528—3539. — PMID 7628454. — PMC 394421.

[pmid8384309-10] Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson J.A., Poellinger L. Ligand-dependent recruitment of the Arnt coregulator determines DNA recognition by the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1993. — April (vol. 13, no. 4). — P. 2504—2514. — PMID 8384309. — PMC 359572.

[pmid7488247-11] Yamaguchi Y., Kuo M.T. Functional analysis of aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator interactions with aryl hydrocarbon receptor in the yeast two-hybrid system (англ.) // Biochemical Pharmacology^[англ.] : journal. — 1995. — October (vol. 50, no. 8). — P. 1295—1302. — doi:10.1016/0006-2952(95)02016-6. — PMID 7488247.

[pmid9887096-12] Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Identification of a novel mechanism of regulation of Ah (dioxin) receptor function (англ.) // Genes & Development : journal. — 1999. — January (vol. 13, no. 1). — P. 20—5. — doi:10.1101/gad.13.1.20. — PMID 9887096. — PMC 316371.

[pmid9079689-13] ¹ ² Hogenesch J.B., Chan W.K., Jackiw V.H., Brown R.C., Gu Y.Z., Pray-Grant M., Perdew G.H., Bradfield C.A. Characterization of a subset of the basic-helix-loop-helix-PAS superfamily that interacts with components of the dioxin signaling pathway (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — March (vol. 272, no. 13). — P. 8581—8593. — doi:10.1074/jbc.272.13.8581. — PMID 9079689.

[pmid11782478-14] ¹ ² ³ Woods S.L., Whitelaw M.L. Differential activities of murine single minded 1 (SIM1) and SIM2 on a hypoxic response element. Cross-talk between basic helix-loop-helix/per-Arnt-Sim homology transcription factors (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — March (vol. 277, no. 12). — P. 10236—10243. — doi:10.1074/jbc.M110752200. — PMID 11782478.

[pmid12024042-15] ¹ ² Beischlag T.V., Wang S., Rose D.W., Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson W.E., Probst M.R., Rosenfeld M.G., Hankinson O. Recruitment of the NCoA/SRC-1/p160 family of transcriptional coactivators by the aryl hydrocarbon receptor/aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — June (vol. 22, no. 12). — P. 4319—4333. — doi:10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002. — PMID 12024042. — PMC 133867.

[pmid9020169-16] ¹ ² Probst M.R., Fan C.M., Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Two murine homologs of the Drosophila single-minded protein that interact with the mouse aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — February (vol. 272, no. 7). — P. 4451—4457. — doi:10.1074/jbc.272.7.4451. — PMID 9020169.

[pmid14701734-17] Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2004. — January (vol. 24, no. 2). — P. 608—616. — doi:10.1128/mcb.24.2.608-616.2004. — PMID 14701734. — PMC 343817.

[pmid9271372-18] Moffett P., Reece M., Pelletier J. The murine Sim-2 gene product inhibits transcription by active repression and functional interference (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — September (vol. 17, no. 9). — P. 4933—4947. — doi:10.1128/mcb.17.9.4933. — PMID 9271372. — PMC 232345.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]