В 1932 году окончил рабочий факультет Грозненского нефтяного института. С 1937 года, после окончания геологоразведочного факультета Ленинградского горного института, работал в различных геологических организациях на Северо-Востоке России. Полгода работал в газете «Советская Колыма» собственным корреспондентом по Северному горнопромышленному управлению: 9 февраля 1938 года была опубликована его первая корреспонденция[3].
С марта 1950 года работал директором ВНИИ-1, сменив на этом посту С. П. Александрова.
В 1960 году Н. А. Шило стал директором Северо-Восточного комплексного научно-исследовательского института Дальневосточного научного центра АН СССР (Магадан).
26 июня 1964 года был избран членом-корреспондентом, а 24 ноября1970 года — действительным членом (академиком) АН СССР.
В 1978 году Шило стал председателем президиума Дальневосточного научного центра АН СССР и переехал во Владивосток. Он руководил Дальневосточным научным центром в течение семи лет.
Был народным депутатом РСФСР, делегатом XXV съезда КПСС.
Последние годы жизни посвятил написанию мемуаров «Записки геолога», описывающих в том числе становление науки на Дальнем востоке России, Колыме, историю открытий золотых месторождений. Книга была признана Академией наук лучшей книгой 2008 года в области популяризации науки.
Северо-Восточный комплексный научно-исследовательский институт (СВКНИИ) им. Н. А. Шило. В июне 2009 года в Магадане, на здании СВКНИИ ДВО РАН, установлена мемориальная доска.
г. Пятигорск — названа улица. Улица Академика Н. А. Шило
г. Магадан — институт СВКНИИ ДВО РАН им. Н. А. Шило. Уникальный институт известен развитием золотодобывающей промышленности Северо-Восточного региона России.
Библиография опубликованных научных работ академика Н. А. Шило (1940—1973 гг.): геолог // Тр. СВКНИИ ДВЦ АН СССР. 1973. Вып. 55. С. 12-19.
Кузьменко Ю. А., Семёнова С. В. Николай Алексеевич Шило. М.: Наука, 1983. 105 с. : порт. (Материалы к библиографии учёных СССР. Сер. геол. наук; Вып. 31).
Геологическое строение и коренные источники Яно-Колымского пояса россыпной золотоносности / Н. А. Шило. — Магадан : [б. и.], 1960. — 108 с., 2 л. схем. : ил.; 26 см. — (Труды ВНИИ-1. Геология/ РСФСР. Магаданский совет нар. хозяйства. Всесоюз. науч.-исслед. ин-т золота и редких металлов; Вып. 63).
Металлогения ртути северного сегмента Тихоокеанского рудного пояса / Н. А. Шило, П. В. Бабкин, В. И. Копытин. — Москва : Наука, 1978. — 236 с. : ил.; 26 см.
Основы учения о россыпях / Н. А. Шило. — М. : Наука, 1981. — 383 с.
Петрофизика поверхностных и глубинных образований северо-востока Азии / Ю. Я. Ващилов, Т. П. Зимникова, Н. А. Шило. — М. : Наука, 1982. — 163 с. : ил., карт., 2 отд. л. ил.; 21 см.
Киргиляхский мамонт : Палеогеогр. аспект / Н. А. Шило, А. В. Ложкин, Э. Э. Титов, Ю. В. Шумилов. — М. : Наука, 1983. — 214 с. : ил., 1 л. схем.; 21 см.
Условия формирования золотого оруденения в структурах Северо-Востока СССР / Н. А. Шило, В. И. Гончаров, А. В. Альшевский, В. В. Ворцепнев; Отв. ред. Р. Б. Умитбаев; АН СССР, Дальневост. отд-ние, Сев.-Вост. комплекс. НИИ. — М. : Наука, 1988. — 179,[2] с., [4] л. ил. : ил.; 25 см; ISBN 5-02-005984-6
Золото-серебряное оруденение вулканогенных поясов Тихоокеанского обрамления / Н. А. Шило; РАН. Дальневост. отд-ние. Сев.-вост. науч. центр. — Магадан : СВНЦ ДВО РАН, 1999. — 70 с. : ил.; 21 см.
Четыре космопланетарных проблемы: от Солнечной системы до Каспия / Н. А. Шило. — (2-е изд.). — Москва : Фонд «Новое тысячелетие», 2000. — 167, [1] с. : ил., карты, табл.; 21 см. — (Размышления, поиски, находки / Междунар. акад. наук экологии, безопасности человека и природы).; ISBN 5-86947-046-3
Тропы геолога : Воспоминания и размышления / Н. А. Шило; РАН. Дальневост. отд-ние. — Владивосток : Дальнаука, 1999. — 178 с. : ил., портр., факс.; 20 см. — (Наука в лицах).; ISBN 5-7442-1089-X
Записки геолога / Н. А. Шило; Российская акад. наук, Дальневосточное отд-ние, Сев.-Вост. науч. центр, Сев.-Вост. комплексный науч.-исслед. ин-т. — Москва ; Магадан : СВНЦ ДВО РАН, 2007. — 30 см.
Т. 1: Формирование дальневосточной науки. — 2007. — 427 с. : ил., портр., табл.; ISBN 978-5-94723-097-4
Т. 2: Моя научная деятельность расширяется. — 2007. — 512 с. : ил., портр., факс.; ISBN 978-5-94723-097-4
↑«Газетной строкой…»: Очерки, статьи, документы из истории областной газеты «Магаданская правда», ред. П. Ф. Бурмистров и др., сост. Т. П. Смолина, Магадан, Магаданское книжное изд-во, 1986, с. 51.
↑Выставка трудов академика АН СССР Николая Алексеевича Шило: Каталог выставкиАрхивная копия от 31 мая 2014 на Wayback Machine // Юбилейная выставка посвященная 100-летию Н. А. Шило. ИГЕМ и БЕН РАН. 2013. 26 с.
Гончаров В. И., Ложкин А. В., Никитин В. С. Академик Н. А. Шило: Очерк научной и научно-организационной деятельности // Геология и полезные ископаемые Северо-Востока Азии. Владивосток: Изд-во ДВНЦ АН СССР, 1984. С. 3-7.
Кузьменко Р. И., Косыгин Ю .А., Семенова С. В. Николай Алексеевич Шило. Наука, 1983. 107 с.
Основные направления исследований и научные достижения 1960—2013: К 100-летию основателя Института и его первого директора, академика Николая Алексеевича Шило. Магадан: Изд-во Охотник, 2013. 36 с.
Симаков К. В. Российский ученый и организатор науки академик Н. А. Шило: Речь академика К. В. Симакова на торжественном собрании 7 апреля 2003 г., посвященном 90-летию академика Н. А. Шило // Геодинамика, магматизм и минерагения континентальных окраин севера Пацифики. Магадан: СВКНИИ ДВО РАН, 2003. Т. 1. С. 9-12.
Симаков К. В. Российский ученый и организатор науки академик Н. А. Шило: (доклад академика К. В. Симакова, прочитанный в Государственном Геологическом музее им. В. И. Вернадского на торжественном заседании, которое посвящалось 90-летию со дня рождения академика Н. А. Шило) // Н. А. Шило. Записки геолога. М.: Фонд «Новое тысячелетие», 2007. Т. 2. С. 384—391.
Хрюкова Г. М. Шило Н. А. // Геологи Колымы и Чукотки. Магадан: Магаданск. кн. изд-во, 1969. С. 102—104 : порт. (Помни их имена; Вып. 2).
Н. А. Шило Записки геолога. в 3 томах
Шило Н. А. Учение о россыпях. — Владивосток: Дальнаука, 2002. — 576 с.
