Список растений с секвенированным геномом (Vhnvkt jgvmyunw v vytfyunjkfguudb iyukbkb)

Перейти к навигации Перейти к поиску

Список растений с секвенированным геномом включает растения, для которых в публичном доступе имеется полная собранная, аннотированная последовательность генома. В список не включены растения, геномы которых не собраны и представлены отдельными последовательностями. Также в представленный список не включены растения, для которых доступны только геномы органелл (пластид и митохондрий). Для всех клад живых организмов, см. список секвенированных геномов.

Водоросли

[править | править код]

В данном случае водоросли понимаются широко, как сборная группа без таксономического значения, объединяющая фотосинтезирующие эукариотические организмы.

Организм (штамм) Клада Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Cyanophora paradoxa Glaucophyte (Глаукофитовые водоросли) Rutgers University[1] 2012
Bathycoccus prasinos BBAN7 Chlorophyta (Зелёные водоросли) Сравнительные анализ 15 Mb Joint Genome Institute 2012[2]
Chlamydomonas reinhardtii CC-503 cw92 mt+ Chlorophyta (Зелёные водоросли) Модельный организм 111 Mb 17,737 University of California at Los Angeles[3] Chlamydomonas reinhardtii (англ.) на сайте Национального центра биотехнологической информации (NCBI). ENAШаблон:ENA 2007
Chlorella variabilis NC64A Chlorophyta (Зелёные водоросли) 2010[4]
Coccomyxa subellipsoidea sp. C-169 Chlorophyta (Зелёные водоросли) Модельный организм (предполагается использование для получения биотоплива) Joint Genome Institute 2007[5]
Dunaliella salina CCAP19/18 Chlorophyta (Зелёные водоросли) Галофил, используется для получения биотоплива и синтеза β-каротина Joint Genome Institute Organelle genomes complete,[6] nuclear genome in progress
Micromonas pusilla CCMP1545 Chlorophyta (Зелёные водоросли) Представитель морского фитопланктона Joint Genome Institute 2007[7][8]
Micromonas pusilla RCC299/NOUM17 Chlorophyta (Зелёные водоросли) Joint Genome Institute 2007[9]
Ostreococcus lucimarinus CCE9901 Chlorophyta (Зелёные водоросли) Простой эукариотический организм с маленьким геномом 13.2 Mb 7,796 2007[10]
Ostreococcus tauri OTH95 Chlorophyta (Зелёные водоросли) 2006[11]
Ostreococcus sp. RCC809 Chlorophyta (Зелёные водоросли) 7,773 Joint Genome Institute 2008[12]
Volvox carteri Chlorophyta (Зелёные водоросли) Многоклеточная водоросль, модельный организм ~131.2 Mb 14,971 2010[13]
Chondrus crispus Rhodophyta (Красные водоросли) 105 Mb 9,606 Genoscope/Station Biologique de Roscoff 2013[14]
Cyanidioschyzon merolae strain:10D Rhodophyta (Красные водоросли) 16.73 Mb 5,017 2004,[15] 2007[16]
Galdieria sulphuraria Rhodophyta (Красные водоросли) Термо-ацидофильный организм (экстремофил) 13.7 Mb 6,623 2005[17] 2005[18] 2013[19]
Porphyridium purpureum Rhodophyta (Красные водоросли) 19.7 Mb 8,355 2013[20]
Pyropia yezoensis Rhodophyta (Красные водоросли) 43 Mb 10,327 2013[21]
Ectocarpus siliculosus Heterokontophyta (Страменопилы) Представитель из супергруппы SAR Station Biologique de Roscoff 2010[22]

Мохообразные

[править | править код]
Организм (разновидность, сорт) Отдел Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Physcomitrella patens ssp. patens str. Gransden 2004 Bryophyta (Мхи) Модельное растение, сформировавшегося при ранней дивергенции наземных растений 2008[23]

Высшие растений (сосудистых растений)

[править | править код]
Организм (разновидность, сорт) Отдел Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Sеlaginella moellendorffii (плаунок Мёллендорфа) Lycopodiophyta (Плауновидные) Модельный организм 2011[24][25]

Покрытосеменные

[править | править код]

Амборелловые (Amborellales)

[править | править код]
Организм (разновидность, сорт) Семейство Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Amborella trichopoda Amborellaceae (Амборелловые) Базальные покрытосеменные 2013[26][27]

Эвдикоты

[править | править код]
Лютикоцветные (Ranunculales)
[править | править код]
Организм (разновидность, сорт) Семейство Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Aquilegia coerulea (водосбор голубой) Ranunculaceae (Лютиковые) Базальные эвдикоты Неизданный геном[28]
Протеецветные (Proteales)
[править | править код]
Организм (разновидность, сорт) Семейство Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Nelumbo nucifera (лотос орехоносный) Nelumbonaceae (Лотосовые) Базальные эвдикоты 2013[29]
Гвоздичноцветные (Caryophyllales)
[править | править код]
Организм (разновидность, сорт) Семейство Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Beta vulgaris (свекла обыкновенная) Chenopodiaceae (Маревые) Сельскохозяйственная культура 714-758 Мб 27,421 2013[30]
Chenopodium quinoa (киноа) Chenopodiaceae (Маревые) Сельскохозяйственная культура 1.39-1.50 Гб 44,776 3,486 подмости, эшафот Н50 в 3.84 Мб, 90 % собранного генома содержится в 439 лесов 2017[31]
Amaranthus hypocondriacus Amaranthaceae (Амарантовые) Сельскохозяйственная культура 403.9 Мб 23,847 16 крупных лесов от 16.9 до 38,1 Мб. N50 и Л50 сборки 24.4 Мб и 7, соответственно.[32] 2016[33]
Розиды (Rosids)
[править | править код]
Организм (разновидность, сорт) Семейство Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Betula nana (карликовая берёза) Betulaceae (Берёзовые) Арктический кустарник 450 Mbp QMUL/SBCS 2013[34]
Aethionema arabicum Brassicaceae (Капустные) Сравнительный анализ геномов Капустных 2013[35]
Arabidopsis lyrata Brassicaceae (Капустные) Модельный организм 2011[36]
Arabidopsis thaliana экотип: Columbia Brassicaceae (Капустные) Модельный организм 135 Mbp 2000[37]
Barbarea vulgaris Сурепка обыкновенная

G-type

Brassicaceae (Капустные) Модельный организм при изучение специфических ветвей вторичного метаболизма и механизмов защиты от фитопатогенов 2017[38]
Brassica rapa (репа) Brassicaceae (Капустные) Сельскохозяйственная овощная культура и модельное растение 2011[39]
Capsella rubella (пастушья сумка) Brassicaceae (Капустные) Близкий родственник модельного организма Arabidopsis thaliana 130Mbp 26,521 JGI 2013?[40] 2013[41]
Eutrema salsugineum (эвтрема) Brassicaceae (Капустные) Близкий родственник A. thaliana, обладает высокой солеустойчивостью 240Mbp 26,351 JGI 2013[42]
Eutrema parvulum (эвтрема) Brassicaceae (Капустные) Сравнительный анализ геномов Капустных 2013
Leavenworthia alabamica Brassicaceae (Капустные) Сравнительный анализ геномов Капустных 2013
Sisymbrium irio (гулявник) Brassicaceae (Капустные) Сравнительный анализ геномов Капустных 2013
Thellungiella parvula Brassicaceae (Капустные) Близкий родственник A. thaliana, обладает высокой солеустойчивостью 2011[43]
Cannabis sativa (конопля посевная) Cannabaceae (Коноплёвые) Сельскохозяйственная техническая и лекарственная культура ca 820Mbp 30,074 based on transcriptome assembly and clustering Illumina/454

scaffold N50 16.2 Kbp

2011[44]
Carica papaya (папайя) Caricaceae (Кариковые) Сельскохозяйственная плодовая культура 372Mbp 28,629 contig N50 11kbp

scaffold N50

1Mbp

total coverage ~3x (Sanger)

92,1 % unigenes mapped

235Mbp anchored (of this 161Mbp also oriented)

2008[45]
Kalanchoe sp. (каланхое) Crassulaceae (Толстянковые) Растение с CAM-метаболизмом 2013?[46]
Citrullus lanatus (арбуз) Cucurbitaceae (Тыквенные) Сельскохозяйственная бахчевая культура ca 425Mbp 23,440 BGI Illumina

coverage 108.6x

contig N50 26.38 kbp

Scaffold N50 2.38 Mbp

genome covered 83,2 %

~97 % ESTs mapped

2012[47]
Cucumis melo (дыня)DHL92 Cucurbitaceae (Тыквенные) овощной урожай 450Mbp 27,427 454

13.5x coverage

contig N50: 18.1kbp

scaffold N50: 4.677 Mbp

WGS

2012[48]
Cucumis sativus (огурец) 'Chinese long' inbred line 9930 Cucurbitaceae (Тыквенные) Vegetable crop 350 Mbp (Kmer depth) 367 Mbp (flow cytometry) 26,682 contig N50 19.8kbp

scaffold N50 1,140kbp

total coverage ~72.2 (Sanger + Ilumina)

96,8 % unigenes mapped

72,8 % of the genome anchored

2009[49]
Hevea brasiliensis (гевея бразильская) Euphorbiaceae (молочайные) the most economically important member of the genus Hevea 2013[50]
Jatropha curcas Palaan Euphorbiaceae (молочайные) bio-diesel crop 2011[51]
Manihot esculenta (маниок съедобный) Euphorbiaceae (молочайные) Humanitarian importance ~760Mb 30,666 JGI 2012[52]
Ricinus communis (клещевина) Euphorbiaceae (молочайные) Oilseed crop 320Mbp 31,237 JCVI Sanger coverage~4.6x contig N50 21.1 kbp scaffold N50 496.5kbp 2010[53]
Cajanus cajan (голубиный горох) var. Asha Fabaceae (Бобовые) Модельный организм (представитель семейства Бобовые) 2012[54][55]
Arachis duranensis (геномный диплоид дикого арахиса) accession V14167 Fabaceae (Бобовые) Wild ancestor of peanut, an oilseed and grain legume crop Illumina 154x coverage, contig N50 22 kbp, scaffold N50 948 kbp 2016[56]
Arachis ipaensis (геномный диплоид дикого арахиса) accession K30076 Fabaceae (Бобовые) Wild ancestor of peanut, an oilseed and grain legume crop Illumina 163x coverage, contig N50 23 kbp, scaffold N50 5,343 kbp 2016
Cicer arietinum (нут бараний) Fabaceae (Бобовые) filling 2013[57]
Cicer arietinum L. (нут бараний) Fabaceae (Бобовые) 2013[58]
Glycine max (соя) var. Williams 82 Fabaceae (Бобовые) Protein and oil crop 1115Mbp 46,430 Contig N50:189.4kbp

Scaffold N50:47.8Mbp

Sanger coverage ~8x

WGS

955.1 Mbp assembled

2010[59]
Lotus japonicus (лядвенец) Fabaceae (Бобовые) Модельный организм (представитель семейства Бобовые) 2008[60]
Medicago truncatula (люцерна усечённая) Fabaceae (Бобовые) Модельный организм (представитель семейства Бобовые) 2011[61]
Phaseolus vulgaris (фасоль обыкновенная) Fabaceae (Бобовые) Модельный организм (представитель семейства Бобовые) 520Mbp 31,638 JGI 2013?[62]
Linum usitatissimum (лён обыкновенный) Linaceae (Льновые) Crop ~350Mbp 43,384 BGI et al. 2012[63]
Durio zibethinus (дуриан цибетиновый) Malvaceae (Мальвовые) Tropical fruit tree ~738Mbp 2017[64]
Gossypium raimondii (хлопчатник) Malvaceae (Мальвовые) One of the putative progenitor species of tetraploid cotton 2013?[65]
Theobroma cacao (какао) Malvaceae (Мальвовые) Flavouring crop 2010[66][67]
Theobroma cacao (какао) cv. Matina 1-6 Malvaceae (Мальвовые) Most widely cultivated cacao type 2013[68]
Azadirachta indica (ним) Meliaceae (Мелиевые) Source of number of Terpenoids, including biopesticide azadirachtin, Used in Traditional Medicine 364 Mbp ~20000 GANIT Labs Illumina GAIIx, scaffold N50 of 452028bp, Transcriptome data from Shoot, Root, Leaf, Flower and Seed 2012[69] and 2011[70]
Eucalyptus grandis (эвкалипт) Myrtaceae (Миртовые) Fibre and timber crop 2011[71]
Fragaria vesca (земляника лесная) Rosaceae (Розовые) Сельскохозяйственная ягодная культура 240 Mbp 34,809 scaffold N50: 1.3 Mbp

454/Illumina/solid

39x coverage

WGS

2011[72]
Malus domestica (яблоня домашняя) «Golden Delicious» Rosaceae (Розовые) Сельскохозяйственная плодовая культура ~742.3 Mbp 57,386 contig N50 13.4 (kbp??)

scafold N50 1,542.7 (kbp??)

total coverage ~16.9x (Sanger + 454)

71,2 % anchored

2010[73]
Prunus amygdalus (миндаль) Rosaceae (Розовые) Сельскохозяйственная плодовая культура 2013?[74]
Prunus avium (черешня) cv. Stella Rosaceae (Розовые) Сельскохозяйственная плодовая культура 2013?
Prunus mume (абрикос японский) Rosaceae (Розовые) Сельскохозяйственная плодовая культура 2012[75]
Prunus persica (персик) Rosaceae (Розовые) Сельскохозяйственная плодовая культура 265Mbp 27,852 Sanger coverage:8.47x

WGS

ca 99 % ESTs mapped

215.9 Mbp in pseudomolecules

2013[76]
Pyrus bretschneideri (белая китайская груша) cv. Dangshansuli Rosaceae (Розовые) Сельскохозяйственная плодовая культура 2012[77]
Pyrus communis (груша обыкновенная) cv. Doyenne du Comice Rosaceae (Розовые) Сельскохозяйственная плодовая культура 2013?
Citrus clementina (клементин) Rutaceae (Рутовые) Сельскохозяйственная плодовая культура 2013?[78]
Citrus sinensis (апельсин) Rutaceae (Рутовые) Сельскохозяйственная плодовая культура 2013?, 2013[79]
Populus trichocarpa (тополь) Salicaceae (Ивовые) Carbon sequestration, model tree, timber 510 Mbp (cytogenetic) 485 Mbp (coverage) 73,013 [Phytozome] Scaffold N50: 19.5 Mbp

Contig N50:552.8 Kbp [phytozome]

WGS

>=95 % cDNA found

2006[80]
Vitis vinifera (виноград культурный) генотип PN40024 Vitaceae (Виноградовые) Сельскохозяйственная плодовая культура 2007[81]
Астериды (Asterids)
[править | править код]
Организм Семейство Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Mimulus guttatus (губастик) Phrymaceae (Фримовые) model system for studying ecological and evolutionary genetics ca 430Mbp 26,718 JGI Scaffold N50 = 1.1 Mbp

Contig N50 = 45.5 Kbp

2013?[82]
Solanum lycopersicum (томат) cv. Heinz 1706 Solanaceae (Пасленовые) Сельскохозяйственная культура ca 900Mbp 34,727 SGN Sanger/454/Illumina/Solid

Pseudomolecules spanning 91 scaffolds (760Mbp of which 594Mbp have been oriented)

over 98 % ESTs mappable

2011[83] 2012[84]
Solanum pimpinellifolium (Currant Tomato) Solanaceae (Пасленовые) closest wild relative to tomato Illumina

contig N50: 5100bp

~40x coverage

2012
Solanum tuberosum (картофель) Solanaceae (Пасленовые) Сельскохозяйственная овощная культура 844 Mbp kmer (856 Mbp) 39,031 PGSC Sanger/454/Illumina

79.2x coverage

contig N50: 31,429bp

scaffold N50: 1,318,511bp

2011[85]
Solanum commersonii (commerson’s nightshade) Solanaceae (Пасленовые) Wild potato relative 838 Mbp kmer (840 Mbp) 37,662 UNINA, UMN, UNIVR, Sequentia Biotech, CGR Illumina

105x coverage

contig N50: 6,506bp

scaffold N50: 44,298bp

2015[86]
Nicotiana benthamiana

(табак)

Solanaceae (Пасленовые) Close relative of tobacco ca 3Gbp Illumina

63x coverage

contig N50: 16,480bp

scaffold N50:89,778bp

>93 % unigenes found

2012[87]
Nicotiana sylvestris (табак лесной) Solanaceae (Пасленовые) model system for studies of terpenoid production 2.636Gbp Philip Morris International 94x coverage

scaffold N50: 79.7 kbp

194kbp superscaffolds using physical Nicotiana map

2013[88]
Nicotiana tomentosiformis Solanaceae (Пасленовые) Tobacco progenitor 2.682 Gb Philip Morris International 146x coverage

scaffold N50: 82.6 kb

166kbp superscaffolds using physical Nicotiana map

2013
Capsicum annuum (перец стручковый)

(a) cv. CM334 (b) cv. Zunla-1

Solanaceae (Пасленовые) Food crop ~3.48 Gbp (a) 34,903

(b) 35,336

N50 contig: (a) 30.0 kb (b) 55.4 kb

N50 scaffold: (a) 2.47 Mb (b) 1.23 Mb

(a) 2014[89](b) 2014[90]
Capsicum annuum var. glabriusculum (Chiltepin) Solanaceae (Пасленовые) Progenitor of cultivated pepper ~3.48 Gbp 34,476 N50 contig: 52.2 kb

N50 scaffold: 0.45 Mb

2014
Petunia (петуния) Solanaceae (Пасленовые) Economically important flower 2011[91]
Utricularia gibba (пузырчатка) Lentibulariaceae (Пузырчатковые) model system for studying genome size evolution; a carnivorous plant 81.87 Mb 28,494 LANGEBIO, CINVESTAV Scaffold N50: 80.839 Kb 2013[92]

Однодольные

[править | править код]
Злакоцветные
[править | править код]
Организм Семейство Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Setaria italica (могар) Poaceae (Злаки) Model of C4 metabolism 2012[93]
Aegilops tauschii (эгилопс) Poaceae (Злаки) bread wheat D-genome progenitor ca 4.36Gb BGI Non-repetitive sequence assembled 2013[94]
Brachypodium distachyon Poaceae (Злаки) Model monocot 2010[95]
Dichanthelium oligosanthes Poaceae (Злаки) C3 grass closely related to C4 species 960 Mb DDPSC 2016[96]
Hordeum vulgare (ячмень обыкновенный) Poaceae (Злаки) Model of ecological adoption IBSC 2012[97]
Oryza brachyantha (дикий рис) Poaceae (Злаки) Disease resistant wild relative of rice 2013[98]
Oryza glaberrima (африканский рис) var CG14 Poaceae (Злаки) West-African species of rice 2010[99]
Oryza rufipogon (красный рис) Poaceae (Злаки) Ancestor to Oryza sativa 406 Mb 37,071 SIBS Illumina HiSeq2000

100x coverage

2012[100]
Oryza sativa (рис посевной длиннозёрный) ssp indica Poaceae (Злаки) Crop and model cereal 2002[101]
Oryza sativa (рис посевной короткозерный) ssp japonica Poaceae (Злаки) Crop and model cereal 2002[102]
Panicum virgatum (просо прутьевидное) Poaceae (Злаки) biofuel 2013?[103]
Phyllostachys edulis (листоколосник бамбуковый) Poaceae (Злаки) 2013[104]
Sorghum bicolor (сорго двуцветное) genotype BTx623 Poaceae (Злаки) Crop ca 730Mbp 34,496 contig N50:195.4kbp

scaffold N50: 62.4Mbp

Sanger, 8.5x coverage

WGS

2009[105]
Triticum aestivum (пшеница мягкая) Poaceae (Злаки) 20 % of global nutrition Non-repetitive sequence assembled

Roche 454/Illumina WGS

2012[106]
Triticum urartu (пшеница) Poaceae (Злаки) Bread wheat A-genome progenitor ca 4.94Gb BGI Non-repetitive sequence assembled

Illumina WGS

2013[107]
Zea mays (кукуруза) ssp mays B73 Poaceae (Злаки) Cereal crop 2,300Mbp 39,656[108] contig N50 40kbp

scaffold N50: 76kbp

Sanger, 4-6x coverage per BAC

2009[109]
Другие однодольные (не злаки)
[править | править код]
Организм напрягать Семья Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Musa acuminata (банан заостренный) Musaceae (Банановые) А-генома современного банана сорта 523 Пмб 36,542 Н50 контигов: 43.1 Кб

Н50 лески: 1.3 Мб

2012[110]
Муса balbisiana (банан Бальбиса) Musaceae (Банановые) Б-геном современного банана сорта 438 Пмб 36,638 Н50 контигов: 7.9 Кб 2013[111]
Phoenix dactylifera (финиковая пальма) Arecaceae (Пальмовые) Древесных растений в засушливых регионах 658 Пмб 28,800 Н50 контигов: 6.4 Кб 2011[112]
Elaeis масло (Африканская масличная Пальма) Arecaceae (Пальмовые) Масличная культура ~1800 Пмб 34,800 Н50 эшафот: 1.27 Мб 2013[113]
Spirodela polyrhiza (многокоренник) Araceae (Ароидные) Водное растение 158 ВР 19,623 Н50 эшафот: 3.76 Мб 2014[114]
Phalaenopsis equestris (фаленопсис наездник) Orchidaceae (Орхидные) Разведение родителем многих современных мотылек орхидеи, сортов и гибридов растений с crassulacean кислотный метаболизм (Кэм) Пмб 1600 29,431 Н50 эшафот: 359,115 Кб 2014[115]

Голосеменные

[править | править код]
Организм (вид, сорт) Семейство Актуальность Размер генома Количество предсказанных генов Организация Статус сборки Год завершения сборки и ссылки
Picea abies (ель европейская) Pinaceae (Сосновые)  Лесоматериалами, tonewood в, декоративных, таких как Рождественская ёлка 20 Гб 28,354 Умео Научного Центра Завода / SciLifeLab, Швеция 2013[116]
Picea glauca (ель сизая) Pinaceae (Сосновые)  Лесная, Целлюлозно 20.8 Гб 56,064 Институциональное Сотрудничество 2013[117]
Pinus taeda (сосна ладанная) Pinaceae (Сосновые) Лесоматериалами 20.15 Гб 50,172 Институциональное сотрудничество N50 Размер ремонтины: 66.9 кбп 2014[118][119][120]

Без рубрики добавить…

[править | править код]

геном из Galdieria sulphuraria, наконец, был опубликован (Schönknecht, г., У.-Х. Чен, и соавт. (2013). «Перенос генов от бактерий и архей способствовало эволюции экстремофильных эукариот.» Наука 339(6124): 1207—1210.) Размер генома составляет 13.7 МБ, и 6623 белок-кодирующих генов были аннотированы.

Накамура и соавт. опубликовал последовательность генома для Pyropia yezoensis (Накамура, Ю. Н. Сасаки, и соавт. (2013). «Первый симбионт-бесплатные геномной последовательности из морских красных водорослей, Susabi-нори Pyropia yezoensis.» Биохимия 8(3): e57122.).

Бхаттачария и соавт. опубликован геном Porphyridium purpureum (Бхаттачарья, Д., Д. С. цена, и соавт. (2013). «Геном красной водоросли Porphyridium purpureum.» Природа Коммуникаций 4.)

Сиквенсы, заявленные в пресс-релизах

[править | править код]

Сюда входят не соответствующие требованиям первого абзаца данной статьи, практически полные сиквенсы высокого качества, опубликованные, собранные и общедоступные. Этот список включает виды, для которых сиквенсы были заявлены в пресс-релизах и на сайтах, но не в информативных публикациях в реферируемом журнале с цифровым идентификатором объекта (Digital Object Identifier/DOI).

См. также

[править | править код]

Ссылки

[править | править код]
  1. ↑ Price D. C., Chan C. X., Yoon HS; Price D. C., Chan C. X., Yoon H. S. Cyanophora paradoxa genome elucidates origin of photosynthesis in algae and plants (англ.) // Science : journal. — 2012. — Vol. 335, no. 6070. — P. 843—847. — doi:10.1126/science.1213561. — Bibcode: 2012Sci...335..843P. — PMID 22344442.
  2. ↑ Genome Biology | Full text | Gene functionalities and genome structure in Bathycoccus prasinos reflect cellular specializations at the base of the green lineage. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 20 октября 2015 года.
  3. ↑ Merchant ; Merchant et al. The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions (англ.) // Science : journal. — 2007. — Vol. 318, no. 5848. — P. 245—250. — doi:10.1126/science.1143609. — Bibcode: 2007Sci...318..245M. — PMID 17932292.
  4. ↑ The Chlorella variabilis NC64A genome revals adaptation to photosymbiosis, coevolution with viruses, and cryptic sex (англ.) // Plant Cell[англ.] : journal. — 2010. — September (vol. 22, no. 9). — P. 2943—2955. — doi:10.1105/tpc.110.076406. — PMID 20852019.
  5. ↑ Coccomyxa JGI entry. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 23 августа 2015 года.
  6. ↑ Smith; Smith. The Dunaliella salina organelle genomes: large sequences, inflated with intronic and intergenic DNA (англ.) // BMC Plant Biology[англ.] : journal. — 2010. — Vol. 10, no. 1. — P. 83. — doi:10.1186/1471-2229-10-83. — PMID 20459666.
  7. ↑ Micromonas p.C3 JGI entry. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 19 октября 2013 года.
  8. ↑ Green evolution and dynamic adaptations revealed by genomes of the marine picoeukaryotes Micromonas (англ.) // Science : journal. — 2009. — 10 April (vol. 324, no. 5924). — P. 268—272. — doi:10.1126/science.1167222. — Bibcode: 2009Sci...324..268W. — PMID 19359590.
  9. ↑ Micromonas p.N3 JGI entry. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 22 июня 2015 года.
  10. ↑ Palenik, B. The tiny eukaryote Ostreococcus provides genomic insights into the paradox of plankton speciation (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2007. — Vol. 104, no. 18. — P. 7705—7710. — doi:10.1073/pnas.0611046104. — Bibcode: 2007PNAS..104.7705P. — PMID 17460045.
  11. ↑ Genome analysis of the smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils many unique features (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2006. — August (vol. 103, no. 31). — P. 11647—11652. — doi:10.1073/pnas.0604795103. — Bibcode: 2006PNAS..10311647D. — PMID 16868079.
  12. ↑ Info — Ostreococcus RCC809. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 19 октября 2013 года.
  13. ↑ Prochnik S. E., Umen J., Nedelcu A. M., ; Prochnik S. E., Umen J., Nedelcu A. M., et al. Genomic analysis of organismal complexity in the multicellular green alga Volvox carteri (англ.) // Science : journal. — 2010. — 9 July (vol. 329, no. 5988). — P. 223—226. — doi:10.1126/science.1188800. — Bibcode: 2010Sci...329..223P. — PMID 20616280.
  14. ↑ Collén, J. Genome structure and metabolic features in the red seaweed Chondrus crispus shed light on evolution of the Archaeplastida (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2013. — Vol. 110. — P. 5247—5252. — doi:10.1073/pnas.1221259110. — PMID 23503846.
  15. ↑ Genome sequence of the ultrasmall unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae 10D (англ.) // Nature : journal. — 2004. — April (vol. 428, no. 6983). — P. 653—657. — doi:10.1038/nature02398. — Bibcode: 2004Natur.428..653M. — PMID 15071595.
  16. ↑ Nozaki. A 100%-complete sequence reveals unusually simple genomic features in the hot-spring red alga Cyanidioschyzon merolae (англ.) // BMC Biol.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 5. — doi:10.1186/1741-7007-5-28.
  17. ↑ Galdieria sulphuraria Genome Project at MSU. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 4 сентября 2004 года.
  18. ↑ Barbier, G. Comparative genomics of two closely related unicellular thermo-acidophilic red algae, Galdieria sulphuraria and Cyanidioschyzon merolae, reveals the molecular basis of the metabolic flexibility of Galdieria sulphuraria and significant differences in carbohydrate metabolism of both algae (англ.) // Plant Physiology : journal. — American Society of Plant Biologists, 2005. — February (vol. 137). — P. 460—474. — doi:10.1104/pp.104.051169. — PMID 15710685.
  19. ↑ Schönknecht. (March 8, 2013) Gene Transfer from Bacteria and Archaea Facilitated Evolution of an Extremophilic Eukaryote (англ.) // Science : journal. — 2013. — March (vol. 339). — P. 1207—1210. — doi:10.1126/science.1231707. — PMID 23471408.
  20. ↑ Bhattacharya. Genome of the red alga Porphyridium purpureum (англ.) // Nature Communications : journal. — Nature Publishing Group, 2013. — Vol. 4. — doi:10.1038/ncomms2931.
  21. ↑ Nakamura. (March 11, 2013) The First Symbiont-Free Genome Sequence of Marine Red Alga, Susabi-nori (Pyropia yezoensis) (англ.) // PLoS ONE : journal. — 2013. — Vol. 8, no. 3. — doi:10.1371/journal.pone.0057122.
  22. ↑ Cock J. M., Sterck L., Rouzé P., ; Cock J. M., Sterck L., Rouzé P., et al. The Ectocarpus genome and the independent evolution of multicellularity in brown algae (англ.) // Nature : journal. — 2010. — 3 June (vol. 465, no. 7298). — P. 617—621. — doi:10.1038/nature09016. — Bibcode: 2010Natur.465..617C. — PMID 20520714.
  23. ↑ The Physcomitrella genome reveals evolutionary insights into the conquest of land by plants (англ.) // Science : journal. — 2008. — January (vol. 319, no. 5859). — P. 64—9. — doi:10.1126/science.1150646. — Bibcode: 2008Sci...319...64R. — PMID 18079367.
  24. ↑ The Selaginella genome identifies genetic changes associated with the evolution of vascular plants (англ.) // Science : journal. — 2011. — 20 May (vol. 332, no. 6032). — P. 960—963. — doi:10.1126/science.1203810. — Bibcode: 2011Sci...332..960B. — PMID 21551031.
  25. ↑ JGI project page. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 24 апреля 2011 года.
  26. ↑ Amborella Genome Project; Amborella Genome Project. The Amborella genome and the evolution of flowering plants (англ.) // Science : journal. — 2013. — 20 December (vol. 342, no. 6165). — P. 1241089. — doi:10.1126/science.1241089. — PMID 24357323.
  27. ↑ amborella.org Архивировано 28 июня 2013 года.
  28. ↑ Phytozome v9.1: Aquilegia caerulea. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 20 февраля 2015 года.
  29. ↑ Ray Ming. Genome of the long-living sacred lotus (Nelumbo nucifera Gaertn.) (англ.) // BioMed Central[англ.] : journal. — 2013. — 10 May (vol. 14, no. 5). — P. R41. — doi:10.1186/gb-2013-14-5-r41. Архивировано 27 декабря 2015 года.
  30. ↑ Juliane C. Dohm. The genome of the recently domesticated crop plant sugar beet (Beta vulgaris) (англ.) // Nature : journal. — 2013. — December (vol. 505, no. 7484). — P. 546—549. — doi:10.1038/nature12817. — PMID 24352233.
  31. ↑ Jarvis, David E.; Ho, Yung Shwen; Lightfoot, Damien J.; Schmöckel, Sandra M.; Li, Bo; Borm, Theo J. A.; Ohyanagi, Hajime; Mineta, Katsuhiko; Michell, Craig T. The genome of Chenopodium quinoa (англ.) // Nature : journal. — 2017. — 16 February (vol. 542, no. 7641). — P. 307—312. — ISSN 0028-0836. — doi:10.1038/nature21370. Архивировано 13 июля 2017 года.
  32. ↑ Phytozome. phytozome.jgi.doe.gov. Дата обращения: 21 июня 2017. Архивировано 9 июня 2017 года.
  33. ↑ Clouse, J. W. The Amaranth Genome: Genome, Transcriptome, and Physical Map Assembly (англ.) // The Plant Genome : journal. — 2016. — 1 March (vol. 9, no. 1). — ISSN 1940-3372. — doi:10.3835/plantgenome2015.07.0062. Архивировано 6 июня 2018 года.
  34. ↑ Genome sequence of dwarf birch (Betula nana) and cross-species RAD markers (англ.) // Molecular Ecology[англ.] : journal. — 2013. — Vol. 22, no. 11. — P. 3098—3111. — doi:10.1111/mec.12131. — PMID 23167599.
  35. ↑ An atlas of over 90,000 conserved noncoding sequences provides insight into crucifer regulatory regions : Nature Genetics : Nature Publishing Group
  36. ↑ The Arabidopsis lyrata genome sequence and the basis of rapid genome size change (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2011. — April (vol. 43, no. 5). — P. 476—481. — doi:10.1038/ng.807.
  37. ↑ The Arabidopsis Genome Initiative. Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana (англ.) // Nature : journal. — 2000. — December (vol. 408, no. 6814). — P. 796—815. — doi:10.1038/35048692. — PMID 11130711.
  38. ↑ Byrne, Stephen L. The genome sequence of Barbarea vulgaris facilitates the study of ecological biochemistry (англ.) // Scientific Reports[англ.] : journal. — 2017. — 17 January (vol. 7). — ISSN 2045-2322. — doi:10.1038/srep40728. — PMID 28094805. Архивировано 21 января 2022 года.
  39. ↑ The genome of the mesopolypoid crop species Brassica rapa (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2011. — Vol. 43. — P. 1035—1039. — doi:10.1038/ng.919. — PMID 21873998.
  40. ↑ Phytozome v9.1: Capsella rubella. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 26 апреля 2015 года.
  41. ↑ The Capsella rubella genome and the genomic consequences of rapid mating system evolution. (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2013. — Vol. 45, no. 7. — P. 831—835. — doi:10.1038/ng.2669. — PMID 23749190.
  42. ↑ Yang, R. The Reference Genome of the Halophytic Plant Eutrema salsugineum (англ.) // Front Plant Sci[англ.] : journal. — 2013. — Vol. 4. — P. 46. — doi:10.3389/fpls.2013.00046. — PMID 23518688.
  43. ↑ The genome of the extremophile crucifer Thellungiella parvula (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2011. — Vol. 43, no. 9. — P. 913—918. — doi:10.1038/ng.889.
  44. ↑ The draft genome and transcriptome of Cannabis sativa (англ.) // BioMed Central[англ.] : journal. — 2011. — Vol. 12, no. 10. — doi:10.1186/gb-2011-12-10-r102. — PMID 22014239.
  45. ↑ Ming, R. The draft genome of the transgenic tropical fruit tree papaya (Carica papaya Linnaeus) (англ.) // Nature : journal. — 2008. — Vol. 452. — P. 991—996. — doi:10.1038/nature06856. — PMID 18432245.
  46. ↑ Kalanchoe. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 5 октября 2016 года.
  47. ↑ The draft genome of watermelon (Citrullus lanatus) and resequencing of 20 diverse accessions : Nature Genetics : Nature Publishing Group. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 15 июня 2017 года.
  48. ↑ The genome of melon (Cucumis melo L.). Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 2 февраля 2018 года.
  49. ↑ Huang S., Li R., Zhang1 Z; Huang S., Li R., Zhang1 Z. The genome of the cucumber, Cucumis sativus L (неопр.) // Nature Genetics. — 2009. — December (т. 41, № 12). — С. 1275—. — doi:10.1038/ng.475. — PMID 19881527.
  50. ↑ BMC Genomics | Full text | Draft genome sequence of the rubber tree Hevea brasiliensis. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 31 августа 2015 года.
  51. ↑ Sequence analysis of the genome of an oil-bearing tree, Jatropha curcas L. (англ.) // DNA Research[англ.] : journal. — 2011. — February (vol. 18, no. 1). — P. 65—76. — doi:10.1093/dnares/dsq030. — PMID 21149391.
  52. ↑ Prochnik et al. (2012), J. Tropical Plant Biology
  53. ↑ Draft genome sequence of the oilseed species Ricinus communis (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2010. — Vol. 28, no. 9. — P. "951—956". — doi:10.1038/nbt.1674.
  54. ↑ Nagendra K. Singh. The first draft of the pigeonpea genome sequence (неопр.) // Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology. — 2012. — Т. 21, № 1. — С. 98—112. — doi:10.1007/s13562-011-0088-8. — PMID 24431589.
  55. ↑ Draft genome sequence of pigeonpea (Cajanus cajan), an orphan legume crop of resource-poor farmers (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2012. — Vol. 30, no. 1. — P. 83—89. — doi:10.1038/nbt.2022. — PMID 22057054.
  56. ↑ Bertioli, David John; Cannon, Steven B.; Froenicke, Lutz; Huang, Guodong; Farmer, Andrew D.; Cannon, Ethalinda K. S.; Liu, Xin; Gao, Dongying; Clevenger, Josh. The genome sequences of Arachis duranensis and Arachis ipaensis, the diploid ancestors of cultivated peanut (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2016. — 1 April (vol. 48, no. 4). — P. 438—446. — ISSN 1061-4036. — doi:10.1038/ng.3517. — PMID 26901068. Архивировано 11 сентября 2017 года.
  57. ↑ Draft genome sequence of chickpea (Cicer arietinum) provides a resource for trait improvement : Nature Biotechnology : Nature Publishing Group. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 21 июля 2017 года.
  58. ↑ Jain, Mukesh. A draft genome sequence of the pulse crop chickpea (Cicer arietinum L.) (англ.) // The Plant Journal[англ.] : journal. — 2013. — Vol. 74. — P. 715—729. — doi:10.1111/tpj.12173.
  59. ↑ Huang S., Li R., Zhang1 Z; Huang S., Li R., Zhang1 Z. Genome sequence of the palaeopolyploid soybean (англ.) // Nature : journal. — 2010. — 10 January (vol. 463, no. 12). — P. 178—183. — doi:10.1038/nature08670. — Bibcode: 2010Natur.463..178S. — PMID 20075913.
  60. ↑ Genome structure of the legume, Lotus japonicus (неопр.) // DNA Research[англ.]. — 2008. — Т. 15, № 4. — С. 227—239. — doi:10.1093/dnares/dsn008. — PMID 18511435.
  61. ↑ The Medicago genome provides insight into the evolution of rizobial symbioses (англ.) // Nature : journal. — 2011. — Vol. 480, no. 7378. — doi:10.1038/nature10625. — Bibcode: 2011Natur.480..520Y. — PMID 22089132.
  62. ↑ Phytozome v9.1: Phaseolus vulgaris v1.0. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 15 апреля 2015 года.
  63. ↑ Wang, Zhiwen. The genome of flax ( Linum usitatissimum ) assembled de novo from short shotgun sequence reads (англ.) // The Plant Journal[англ.] : journal. — 2012. — Vol. 72. — P. 461—473. — doi:10.1111/j.1365-313X.2012.05093.x.
  64. ↑ {{{заглавие}}} (неопр.). — doi:10.1038/ng.3972.
  65. ↑ Phytozome v9.1: Gossypium raimondii v2.1. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 18 февраля 2015 года.
  66. ↑ Argout, Xavier. The genome of Theobroma cacao (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2010. — Vol. 43, no. 2. — P. 101—108. — doi:10.1038/ng.736. — PMID 21186351.
  67. ↑ Pennisi, E. Genomics Researchers Upset by Rivals' Publicity (англ.) // Science. — 2010. — Vol. 329, no. 5999. — P. 1585. — doi:10.1126/science.329.5999.1585. — Bibcode: 2010Sci...329.1585P. — PMID 20929817.
  68. ↑ Genome Biology | Abstract | The genome sequence of the most widely cultivated cacao type and its use to identify candidate genes regulating pod color. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 4 марта 2016 года.
  69. ↑ BMC Genomics | Full text | A draft of the genome and four transcriptomes of a medicinal and pesticidal angiosperm Azadirachta indica. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 23 сентября 2015 года.
  70. ↑ Источник. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 4 марта 2016 года.
  71. ↑ Myburg, Alexander A. The genome of Eucalyptus grandis (англ.) // Nature. — 2014. — doi:10.1038/nature13308. Архивировано 7 февраля 2016 года.
  72. ↑ The genome of woodland strawberry (Fragaria vesca) (неопр.) // Nature Genetics. — 2011. — Т. 43, № 2. — С. 109—116. — doi:10.1038/ng.740. — PMID 21186353.
  73. ↑ Velasco, R. The genome of the domesticated apple (Malus x domestica Borkh.) (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2010. — Vol. 42, no. 10. — P. 833—839. — doi:10.1038/ng.654. — PMID 20802477.
  74. ↑ Gramene News » Blog Archive » Four Rosaceae Genomes Released. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 30 декабря 2013 года.
  75. ↑ The genome of Prunus mume : Nature Communications : Nature Publishing Group. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 11 мая 2016 года.
  76. ↑ The International Peach Genome Initiative; The International Peach Genome Initiative. The high-quality draft genome of peach (Prunus persica) identifies unique patterns of genetic diversity, domestication and genome evolution (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2013. — Vol. 45, no. 5. — P. 487—494. — doi:10.1038/ng.2586. — PMID 23525075. Архивировано 22 июля 2017 года.
  77. ↑ The genome of the pear (Pyrus bretschneideri Rehd.). Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 4 июня 2018 года.
  78. ↑ Phytozome v9.1: Citrus clementina. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 19 февраля 2015 года.
  79. ↑ The draft genome of sweet orange (Citrus sinensis) (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2013. — Vol. 45, no. 1. — P. 59—66. — doi:10.1038/ng.2472. — PMID 23179022.
  80. ↑ The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray) (англ.) // Science : journal. — 2006. — September (vol. 313, no. 5793). — P. 1596—1604. — doi:10.1126/science.1128691. — Bibcode: 2006Sci...313.1596T. — PMID 16973872.
  81. ↑ The grapevine genome sequence suggests ancestral hexaploidization in major angiosperm phyla (англ.) // Nature : journal. — 2007. — September (vol. 449, no. 7161). — P. 463—467. — doi:10.1038/nature06148. — Bibcode: 2007Natur.449..463J. — PMID 17721507.
  82. ↑ Phytozome v9.1: Mimulus guttatus. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 16 февраля 2015 года.
  83. ↑ Sol Genomics Network. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 5 июля 2018 года.
  84. ↑ The Tomato Genome Consortium. The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution (англ.) // Nature : journal. — 2012. — 31 May (vol. 485, no. 7400). — P. 635—641. — doi:10.1038/nature11119. — Bibcode: 2012Natur.485..635T. — PMID 22660326.
  85. ↑ Xu, X. Genome sequence and analysis of the tuber crop potato (англ.) // Nature : journal. — 2011. — Vol. 475, no. 7355. — P. 189—195. — doi:10.1038/nature10158. — PMID 21743474.
  86. ↑ Aversano R., Contaldi F., Ercolano M. R., Grosso V., Iorizzo M., Tatino F., Xumerle L., Dal Molin A., Avanzato C., Ferrarini A., Delledonne M., Sanseverino W., Aiese Cigliano R., Capella-Gutierrez S., Gabaldón T., Frusciante L., Bradeen J. M., Carputo D. The Solanum commersonii genome sequence provides insights into adaptation to stress conditions and genome evolution of wild potato relatives (англ.) // The Plant Cell : journal. — 2015. — 14 April (vol. 27, no. 4). — P. 954—968. — doi:10.1105/tpc.114.135954. — PMID 25873387.
  87. ↑ Bombarely, A. A draft genome sequence of Nicotiana benthamiana to enhance molecular plant-microbe biology research (англ.) // Mol Plant Microbe Interact : journal. — 2012. — Vol. 25. — P. 1523—1530. — doi:10.1094/MPMI-06-12-0148-TA. — PMID 22876960.
  88. ↑ Genome Biology | Abstract | Reference genomes and transcriptomes of Nicotiana sylvestris and Nicotiana tomentosiformis. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 1 октября 2015 года.
  89. ↑ Kim; Kim. Genome sequence of the hot pepper provides insights into the evolution of pungency in Capsicum species (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2014. — Vol. 46, no. 3. — P. 270—278. — doi:10.1038/ng.2877. — PMID 24441736.
  90. ↑ Qin; Qin. Whole-genome sequencing of cultivated and wild peppers provides insights into Capsicum domestication and specialization. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2014. — Vol. 111. — P. 5135—5140. — doi:10.1073/pnas.1400975111. — PMID 24591624.
  91. ↑ The Petunia Platform - Home. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 12 июля 2016 года.
  92. ↑ Architecture and evolution of a minute plant genome | Nature. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 15 июля 2017 года.
  93. ↑ Bennetzen, J. L. Reference genome sequence of the model plant Setaria (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2012. — Vol. 30. — P. 555—561. — doi:10.1038/nbt.2196. — PMID 22580951.
  94. ↑ Aegilops tauschii draft genome sequence reveals a gene repertoire for wheat adaptation (англ.) // Nature : journal. — 2013. — Vol. 496, no. 7443. — P. 91—95. — doi:10.1038/nature12028. — Bibcode: 2013Natur.496...91.. — PMID 23535592.
  95. ↑ The International Brachypodium Initiative; The International Brachypodium Initiative. Genome sequencing and analysis of the model grass Brachypodium distachyon (англ.) // Nature : journal. — 2009. — December (vol. 463, no. 7282). — P. 763—768. — doi:10.1038/nature08747. — Bibcode: 2010Natur.463..763T. — PMID 20148030.
  96. ↑ Studer, Anthony J. The draft genome of the C3 panicoid grass species Dichanthelium oligosanthes (англ.) // BioMed Central[англ.] : journal. — 2016. — 28 October (vol. 17). — P. 223. — doi:10.1186/s13059-016-1080-3. — PMID 27793170. Архивировано 2 июня 2018 года.
  97. ↑ The International Barley Genome Sequencing Consortium; The International Barley Genome Sequencing Consortium. A physical, genetic and functional sequence assembly of the barley genome (англ.) // Nature : journal. — 2012. — Vol. 491, no. 7426. — P. 711—716. — doi:10.1038/nature11543. — Bibcode: 2012Natur.491..711T. — PMID 23075845.
  98. ↑ Whole-genome sequencing of Oryza brachyantha reveals mechanisms underlying Oryza genome evolution : Nature Communications : Nature Publishing Group. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 8 июня 2016 года.
  99. ↑ Hurwitz, B. L. Rice structural variation: A comparative analysis of structural variation between rice and three of its closest relatives in the genus Oryza (англ.) // The Plant journal : for cell and molecular biology : journal. — 2010. — Vol. 63, no. 6. — P. 990—1003. — doi:10.1111/j.1365-313X.2010.04293.x. — PMID 20626650.
  100. ↑ Huang, X. A map of rice genome variation reveals the origin of cultivated rice (англ.) // Nature : journal. — 2012. — Vol. 490, no. 7421. — P. 497—501. — doi:10.1038/nature11532. — PMID 23034647.
  101. ↑ Yu J; Yu J. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. indica) (англ.) // Science : journal. — 2002. — April (vol. 296, no. 5565). — P. 79—92. — doi:10.1126/science.1068037. — Bibcode: 2002Sci...296...79Y. — PMID 11935017.
  102. ↑ Goff SA; Goff S. A. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. japonica) (англ.) // Science : journal. — 2002. — April (vol. 296, no. 5565). — P. 92—100. — doi:10.1126/science.1068275. — Bibcode: 2002Sci...296...92G. — PMID 11935018.
  103. ↑ Phytozome v9.1: Panicum virgatum. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 19 февраля 2015 года.
  104. ↑ The draft genome of the fast-growing non-timber forest species moso bamboo (Phyllostachys heterocycla) : Nature Genetics : Nature Publishing Group. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 21 июля 2017 года.
  105. ↑ Paterson, A. The Sorghum bicolor genome and the diversification of grasses (англ.) // Nature : journal. — 2009. — Vol. 457, no. 7229. — P. 551—556. — doi:10.1038/nature07723. — Bibcode: 2009Natur.457..551P. — PMID 19189423. Архивировано 27 февраля 2012 года.
  106. ↑ Analysis of the bread wheat genome using whole-genome shotgun sequencing (англ.) // Nature : journal. — 2012. — Vol. 491, no. 7426. — P. 705—710. — doi:10.1038/nature11650. — Bibcode: 2012Natur.491..705B. — PMID 23192148.
  107. ↑ Ling H-Q, Zhou S., Liu D. Draft genome of the wheat A-genome progenitor Triticum urartu (англ.) // Nature : journal. — 2013. — Vol. 496, no. 7443. — P. 87—90. — doi:10.1038/nature11997. — Bibcode: 2013Natur.496...87L.
  108. ↑ MaizeSequence 5b.60: Home
  109. ↑ Schnable P; Schnable P. The B73 Maize Genome: Complexity, Diversity, and Dynamics (англ.) // Science : journal. — 2009. — 22 November (vol. 326, no. 5956). — P. 1112—1115. — doi:10.1126/science.1178534. — Bibcode: 2009Sci...326.1112S. — PMID 19965430.
  110. ↑ D’Hont; D’Hont. The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants (англ.) // Nature : journal. — 2012. — Vol. 488, no. 7410. — P. 213—217. — doi:10.1038/nature11241. — Bibcode: 2012Natur.488..213D. — PMID 22801500.
  111. ↑ Davey; Davey. A draft Musa balbisiana genome sequence for molecular genetics in polyploid, inter- and intra-specific Musa hybrids. (англ.) // BMC Genomics[англ.] : journal. — 2013. — Vol. 14. — P. 683. — doi:10.1186/1471-2164-14-683. — PMID 24094114.
  112. ↑ Al-Dous; Al-Dous. De novo genome sequencing and comparative genomics of date palm (Phoenix dactylifera) (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2011. — Vol. 29, no. 6. — P. 521—527. — doi:10.1038/nbt.1860. — PMID 21623354.
  113. ↑ Singh; Singh. Oil palm genome sequence reveals divergence of interfertile species in Old and New worlds. (англ.) // Nature : journal. — 2013. — Vol. 500, no. 7462. — P. 335—339. — doi:10.1038/nature12309. — PMID 23883927.
  114. ↑ Wang; Wang. The Spirodela polyrhiza genome reveals insights into its neotenous reduction fast growth and aquatic lifestyle. (англ.) // Nature Communications : journal. — Nature Publishing Group, 2014. — Vol. 5. — P. 3311. — doi:10.1038/ncomms4311. — PMID 24548928.
  115. ↑ Cai; Cai. The genome sequence of the orchid Phalaenopsis equestris (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2014. — Vol. 47. — P. 65—72. — doi:10.1038/ng.3149. — PMID 25420146.
  116. ↑ The Norway spruce genome sequence and conifer genome evolution (англ.) // Nature : journal. — 2013. — Vol. 497, no. 7451. — P. 579—584. — doi:10.1038/nature12211. — PMID 23698360.
  117. ↑ Assembling the 20 Gb white spruce (Picea glauca) genome from whole-genome shotgun sequencing data (англ.) // Bioinformatics : journal. — 2013. — Vol. 29, no. 12. — P. 1492—1497. — doi:10.1093/bioinformatics/btt178. — PMID 23698863.
  118. ↑ Sequencing and Assembly of the 22-Gb Loblolly Pine Genome (англ.) // Genetics : journal. — 2014. — Vol. 196, no. 3. — P. 875—890. — doi:10.1534/genetics.113.159715. — PMID 24653210.
  119. ↑ Unique Features of the Loblolly Pine (Pinus taeda L.) Megagenome Revealed Through Sequence Annotation (англ.) // Genetics : journal. — 2014. — Vol. 196, no. 3. — P. 891—909. — doi:10.1534/genetics.113.159996. — PMID 24653211.
  120. ↑ Decoding the massive genome of loblolly pine using haploid DNA and novel assembly strategies (англ.) // BioMed Central[англ.] : journal. — 2014. — Vol. 15, no. 3. — P. R59. — doi:10.1186/gb-2014-15-3-r59. — PMID 24647006.
  121. ↑ Архивированная копия. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано из оригинала 1 марта 2012 года.
  122. ↑ First Draft Of Oil Palm Genome Completed. Energy-daily.com. Дата обращения: 27 августа 2010. Архивировано 24 сентября 2010 года.
  123. ↑ Jute genome decoded : Golden fibre to become healthy, high yielding, weather-tolerant; Hawaii-based Bangladeshi scientist leads team to landmark discovery. The Daily Star. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 23 октября 2012 года.
  124. ↑ Jute genome sequence decoded by Bangladeshi scientists. Hindusthan Times. Архивировано из оригинала 9 марта 2011 года.
  125. ↑ স্বপ্নযাত্রা (Chasing the dream). Jute Genome Project. Архивировано из оригинала 6 июля 2012 года.
  126. ↑ Welcome to the British Ash Tree Genome Project | The British Ash Tree Genome Project —
    The School of Biological & Chemical Sciences    . Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 23 сентября 2017 года.
  127. ↑ BBC News — Ash genome reveals fungus resistance. Дата обращения: 18 декабря 2017. Архивировано 2 октября 2018 года.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Список_растений_с_секвенированным_геномом&oldid=141805797