SNTA1 (SNTA1)

SNTA1
SNTA1
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1QAV, 1Z86, 1Z87, 2ADZ, 2PDZ, 4HOP
Идентификаторы
Псевдонимы	SNTA1, LQT12, SNT1, TACIP1, dJ1187J4.5, Syntrophin, alpha 1, syntrophin alpha 1
Внешние ID	OMIM: 601017 MGI: 101772 HomoloGene: 2331 GeneCards: SNTA1
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	20-я хромосома человека
Конец	33,443,763 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	2-я хромосома мыши
Конец	154,250,019 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	apex of heart; ; muscle of thigh; ; right auricle; ; right lobe of thyroid gland;
	Наибольшая экспрессия в
	muscle of thigh; ; skeletal muscle tissue; ; medial head of gastrocnemius muscle; ; choroid plexus of fourth ventricle;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	sodium channel regulator activity; nitric-oxide synthase binding; transmembrane transporter binding; ATPase binding; structural molecule activity; calmodulin binding; связывание с белками плазмы; actin binding; PDZ domain binding;
Компонент клетки	цитоплазма; lateral plasma membrane; мембрана; нервно-мышечный синапс; клеточная мембрана; внутренний компонент клетки; межклеточные контакты; Сарколемма; syntrophin complex; цитоскелет; protein-containing complex; dystrophin-associated glycoprotein complex; синапс;
Биологический процесс	сокращение; negative regulation of peptidyl-cysteine S-nitrosylation; ventricular cardiac muscle cell action potential; regulation of heart rate; regulation of sodium ion transmembrane transport; regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	6640
	20648
	ENSG00000101400
	ENSMUSG00000027488
	Q13424
	Q61234
	NM_003098
	NM_009228
	NP_003089
	NP_033254
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

SNTA1 (англ. Syntrophin alpha 1) — белок, который кодируется одноимённым геном, расположенным у людей на коротком плече 20-й хромосомы.^[5] Длина полипептидной цепи белка составляет 505 аминокислот, а молекулярная масса — 53 895^[6].

Кодируемый геном белок по функции принадлежит к фосфопротеинам. Задействован в таком биологическом процессе как альтернативный сплайсинг. Белок имеет сайт для связывания с молекулой актина, молекулой кальмодулина, ионом кальция. Локализован в клеточной мембране, цитоплазме, цитоскелете, мембране, клеточных контактах.

Литература

Castello A., Brocheriou V., Chafey P., Kahn A., Gilgenkrantz H. Characterization of the dystrophin-syntrophin interaction using the two-hybrid system in yeast. FEBS Lett. 1996 г., стр. 124—128; volume=383. PMID 8612778 doi:10.1016/0014-5793(96)00214-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 2004 г., стр. 2121—2127; volume=14. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Fernandez-Larrea J., Merlos-Suarez A., Urena J.M., Baselga J., Arribas J. A role for a PDZ protein in the early secretory pathway for the targeting of proTGF-alpha to the cell surface. Mol. Cell. 1999 г., стр. 423—433; volume=3. PMID 10230395 doi:10.1016/S1097-2765(00)80470-0
Olalla L., Aledo J.C., Bannenberg G., Marquez J. The C-terminus of human glutaminase L mediates association with PDZ domain-containing proteins. FEBS Lett. 2001 г., стр. 116—122; volume=488. PMID 11163757 doi:10.1016/S0014-5793(00)02373-5

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000101400 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027488 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11167 (англ.). Дата обращения: 12 сентября 2017. Архивировано 27 июля 2018 года.
↑ UniProt, Q13424 (англ.). Дата обращения: 12 сентября 2017. Архивировано 26 сентября 2017 года.

См. также

20-я хромосома человека

[refGRCh38EnsemblENSG00000101400-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000101400 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000027488-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027488 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11167 (англ.). Дата обращения: 12 сентября 2017. Архивировано 27 июля 2018 года.

[UniProt-6] UniProt, Q13424 (англ.). Дата обращения: 12 сентября 2017. Архивировано 26 сентября 2017 года.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]