NdhF (NdhF)

Ген пятой субъединицы НАДН-дегидрогеназного комплекса хлоропластов (ndhF), обнаружен во всех отделах сосудистых растений и является высоко консервативным. Это небольшой однокопийный фрагмент хлоропластного ДНК, который предположительно кодирует гидрофобный белок из 664 аминокислот с массой 72,9 кДа^[1].

Практическое использование

Благодаря высокой консервативности у разных организмов ген ndhF чрезвычайно полезен для воссоздания филогенетических отношений между разными таксономическими уровнями^[2]^[3]^[4]^[5].

См. также

Примечания

↑ Neyland, Ray; Lowell E. Urbatsch. The ndhF chloroplast gene detected in all vascular plant divisions (англ.) // Planta : journal. — 1996. — Vol. 200, no. 2. — P. 273—277 P. — doi:10.1007/bf00208318. — PMID 8904810.
↑ Dong Wenpan, Jing Liu, Jing Yu, Ling Wang, Shiliang Zhou. Highly Variable Chloroplast Markers for Evaluating Plant Phylogeny at Low Taxonomic Levels and for DNA Barcoding (англ.) // PLOS oOne : journal. — 2012. — doi:10.1371/journal.pone.0035071.
↑ T. B. Patterson T. J. Givnish. Phylogeny, concerted convergence, and phylogenetic niche conservatism in the core Liliales: insights from rbcL and ndhF sequence data (англ.) // Evolution : journal. — Wiley-VCH, 2002. — Vol. 56, no. 2. — P. 233—252. — doi:10.1111/j.0014-3820.2002.tb01334.x. — PMID 11926492. Архивировано 21 апреля 2004 года.
↑ Givnish, T.J.; Pires, J.C.; Graham, S.W.; McPherson, M.A.; Prince, L.M.; Patterson, T.B.; Rai, H.S.; Roalson, E.R.; Evans, T.M.; Hahn, W.J; Millam, K.C.; Meerow, A.W.; Molvray, M.; Kores, P.; O’Brien, H.E.; Kress, W.J.; Hall, J.; Sytsma, K.J. Phylogeny of the monocotyledons based on the highly informative plastid gene ndhF: evidence for widespread concerted convergence (англ.) // Aliso: A Journal of Systematic and Evolutionary Botany : journal. — Rancho Santa Ana Botanic Garden (US). — P. 28—51. Архивировано 16 января 2014 года. In Columbus et al. (2006).
↑ Givnish, T.J.; Pires, J.C.; Graham, S.W.; McPherson, M.A.; Prince, L.M.; Patterson, T.B.; Rai, H.S.; Roalson, E.R.; Evans, T.M.; Hahn, W.J; Millam, K.C.; Meerow, A.W.; Molvray, M.; Kores, P.; O’Brien, H.E.; Kress, W.J.; Hall, J.; Sytsma, K.J. Repeated evolution of net venation and fleshy fruits among monocots in shaded habitats confirms a priori predictions: evidence from an ndhF phylogeny (англ.) // Proceedings of the Royal Society of London, Series B : journal. — 2005. — Vol. 272. — P. 1481—1490. — doi:10.1098/rspb.2005.3067. — PMID 16011923. — PMC 1559828.

[1] Neyland, Ray; Lowell E. Urbatsch. The ndhF chloroplast gene detected in all vascular plant divisions (англ.) // Planta : journal. — 1996. — Vol. 200, no. 2. — P. 273—277 P. — doi:10.1007/bf00208318. — PMID 8904810.

[2] Dong Wenpan, Jing Liu, Jing Yu, Ling Wang, Shiliang Zhou. Highly Variable Chloroplast Markers for Evaluating Plant Phylogeny at Low Taxonomic Levels and for DNA Barcoding (англ.) // PLOS oOne : journal. — 2012. — doi:10.1371/journal.pone.0035071.

[Patterson_2002-3] T. B. Patterson T. J. Givnish. Phylogeny, concerted convergence, and phylogenetic niche conservatism in the core Liliales: insights from rbcL and ndhF sequence data (англ.) // Evolution : journal. — Wiley-VCH, 2002. — Vol. 56, no. 2. — P. 233—252. — doi:10.1111/j.0014-3820.2002.tb01334.x. — PMID 11926492. Архивировано 21 апреля 2004 года.

[Givnish_2006-4] Givnish, T.J.; Pires, J.C.; Graham, S.W.; McPherson, M.A.; Prince, L.M.; Patterson, T.B.; Rai, H.S.; Roalson, E.R.; Evans, T.M.; Hahn, W.J; Millam, K.C.; Meerow, A.W.; Molvray, M.; Kores, P.; O’Brien, H.E.; Kress, W.J.; Hall, J.; Sytsma, K.J. Phylogeny of the monocotyledons based on the highly informative plastid gene ndhF: evidence for widespread concerted convergence (англ.) // Aliso: A Journal of Systematic and Evolutionary Botany : journal. — Rancho Santa Ana Botanic Garden (US). — P. 28—51. Архивировано 16 января 2014 года. In Columbus et al. (2006).

[Givnish_2005-5] Givnish, T.J.; Pires, J.C.; Graham, S.W.; McPherson, M.A.; Prince, L.M.; Patterson, T.B.; Rai, H.S.; Roalson, E.R.; Evans, T.M.; Hahn, W.J; Millam, K.C.; Meerow, A.W.; Molvray, M.; Kores, P.; O’Brien, H.E.; Kress, W.J.; Hall, J.; Sytsma, K.J. Repeated evolution of net venation and fleshy fruits among monocots in shaded habitats confirms a priori predictions: evidence from an ndhF phylogeny (англ.) // Proceedings of the Royal Society of London, Series B : journal. — 2005. — Vol. 272. — P. 1481—1490. — doi:10.1098/rspb.2005.3067. — PMID 16011923. — PMC 1559828.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]