NCOR2 (NCOR2)

Перейти к навигации Перейти к поиску
Корепрессор ядерных рецепторов 2
PDB представлено на основе 1xc5.PDB представлено на основе 1xc5.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1KKQ, 1R2B, 1XC5, 2GPV, 2L5G, 2LTP, 2ODD, 2RT5, 3R29, 3R2A, 4A69

Идентификаторы
Символ NCOR2 ; CTG26; N-CoR2; SMAP270; SMRT; SMRTE; SMRTE-tau; TNRC14; TRAC; TRAC-1; TRAC1
Внешние ID OMIM: 600848 MGI: 1337080 HomoloGene: 31370 ChEMBL: 5949 GeneCards: Ген NCOR2
Генная онтология
Функция • DNA binding

• chromatin binding
• transcription corepressor activity
• Notch binding
• protein binding
• histone deacetylase binding

• protein N-terminus binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm
• nucleolus
• membrane
• nuclear matrix
• nuclear body

• transcriptional repressor complex
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• transcription, DNA-templated
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• transforming growth factor beta receptor signaling pathway
• Notch signaling pathway
• gene expression
• cellular lipid metabolic process
• small molecule metabolic process

• regulation of cellular ketone metabolic process by negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 9612 20602
Ensembl ENSG00000196498 ENSMUSG00000029478
UniProt Q9Y618 Q9WU42
RefSeq (мРНК) NM_001077261 NM_001253904
RefSeq (белок) NP_001070729 NP_001240833
Локус (UCSC) Chr 12:
124.81 – 125.05 Mb		 Chr 5:
125.02 – 125.18 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Корепрессор ядерных рецепторов 2 (NCOR2) — транскрипционный корегуляторный белок, содержащий несколько доменов, взаимодействующих с ядерными рецепторами. Кроме того, NCOR2 способствует доставке гистондезацетилаз в промоторные области ДНК. В связи с этим считается, что NCOR2 помогает ядерным рецепторам в подавлении экспрессии целевых генов[1][2]. По другому NCOR2 называется посредником сайленсинга для рецепторов витамина А и рецепторов гормонов щитовидной железы ( SMRT )[1] или T3 рецептор-ассоциированного кофактора 1 ( TRAC-1 )[2].

Функция

[править | править код]

NCOR2/SMRT — белок корегуляции транскрипции, который содержит несколько модулирующих функциональных областей, в том числе, несколько реперессирующих доменов, а также два или три C-концевых домена, взаимодействующих с ядерными рецепторами[1]. NCOR2/SMRT служит корепрессором для множества транскрипционных факторов. В этой связи, NCOR2/SMRT функционирует как платформа, содействующая связыванию гистондезацетилаз с промоторами ДНК и факторами транскрипции Sin3A с последующим образованием мультисубъединичного репрессорного комплекса[3].

Открытие

[править | править код]

SMRT изначально клонирован и охарактеризован в лаборатории д-ра Рональда М. Эванс (англ. Ronald M. Evans) в Институте биологических исследований Солка[1]. В более раннем исследовании этой молекулы с аналогичными выводами этот белок обозначался как TRAC-1[2].

Взаимодействия

[править | править код]

NCOR2 взаимодействует с:

Примечания

[править | править код]
  1. ↑ 1 2 3 4 Chen J.D., Evans R.M. A transcriptional co-repressor that interacts with nuclear hormone receptors (англ.) // Nature : journal. — 1995. — Vol. 377, no. 6548. — P. 454—457. — doi:10.1038/377454a0. — PMID 7566127.
  2. ↑ 1 2 3 Sande S., Privalsky M.L. Identification of TRACs (T3 receptor-associating cofactors), a family of cofactors that associate with, and modulate the activity of, nuclear hormone receptors (англ.) // Molecular Endocrinology[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 10, no. 7. — P. 813—825. — doi:10.1210/me.10.7.813. — PMID 8813722.
  3. ↑ Nagy L., Kao H.Y., Chakravarti D., Lin R.J., Hassig C.A., Ayer D.E., Schreiber S.L., Evans R.M. Nuclear receptor repression mediated by a complex containing SMRT, mSin3A, and histone deacetylase (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 89, no. 3. — P. 373—380. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80218-4. — PMID 9150137.
  4. ↑ Liao G., Chen L.Y., Zhang A., Godavarthy A., Xia F., Ghosh J.C., Li H., Chen J.D. Regulation of androgen receptor activity by the nuclear receptor corepressor SMRT (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 7. — P. 5052—5061. — doi:10.1074/jbc.M206374200. — PMID 12441355.
  5. ↑ Song L.N., Coghlan M., Gelmann E.P. Antiandrogen effects of mifepristone on coactivator and corepressor interactions with the androgen receptor (англ.) // Molecular Endocrinology[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 18, no. 1. — P. 70—85. — doi:10.1210/me.2003-0189. — PMID 14593076.
  6. ↑ Dotzlaw H., Moehren U., Mink S., Cato A.C., Iñiguez Lluhí J.A., Baniahmad A. The amino terminus of the human AR is target for corepressor action and antihormone agonism (англ.) // Molecular Endocrinology[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 16, no. 4. — P. 661—673. — doi:10.1210/me.16.4.661. — PMID 11923464.
  7. ↑ 1 2 Wong C.W., Privalsky M.L. Components of the SMRT corepressor complex exhibit distinctive interactions with the POZ domain oncoproteins PLZF, PLZF-RARalpha, and BCL-6 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 42. — P. 27695—27702. — doi:10.1074/jbc.273.42.27695. — PMID 9765306.
  8. ↑ Huynh K.D., Fischle W., Verdin E., Bardwell V.J. BCoR, a novel corepressor involved in BCL-6 repression (англ.) // Genes & Development : journal. — 2000. — Vol. 14, no. 14. — P. 1810—1823. — doi:10.1101/gad.14.14.1810. — PMID 10898795. — PMC 316791.
  9. ↑ Deltour S., Guerardel C., Leprince D. Recruitment of SMRT/N-CoR-mSin3A-HDAC-repressing complexes is not a general mechanism for BTB/POZ transcriptional repressors: the case of HIC-1 and gammaFBP-B (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 26. — P. 14831—14836. — doi:10.1073/pnas.96.26.14831. — PMID 10611298. — PMC 24733.
  10. ↑ 1 2 3 4 Lee S.K., Kim J.H., Lee Y.C., Cheong J., Lee J.W. Silencing mediator of retinoic acid and thyroid hormone receptors, as a novel transcriptional corepressor molecule of activating protein-1, nuclear factor-kappaB, and serum response factor (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 17. — P. 12470—12474. — doi:10.1074/jbc.275.17.12470. — PMID 10777532.
  11. ↑ 1 2 Fischer D.D., Cai R., Bhatia U., Asselbergs F.A., Song C., Terry R., Trogani N., Widmer R., Atadja P., Cohen D. Isolation and characterization of a novel class II histone deacetylase, HDAC10 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 8. — P. 6656—6666. — doi:10.1074/jbc.M108055200. — PMID 11739383.
  12. ↑ 1 2 Underhill C., Qutob M.S., Yee S.P., Torchia J. A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 51. — P. 40463—40470. — doi:10.1074/jbc.M007864200. — PMID 11013263.
  13. ↑ 1 2 3 Li J., Wang J., Wang J., Nawaz Z., Liu J.M., Qin J., Wong J. Both corepressor proteins SMRT and N-CoR exist in large protein complexes containing HDAC3 (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2000. — Vol. 19, no. 16. — P. 4342—4350. — doi:10.1093/emboj/19.16.4342. — PMID 10944117. — PMC 302030.
  14. ↑ 1 2 Yoon H.G., Chan D.W., Huang Z.Q., Li J., Fondell J.D., Qin J., Wong J. Purification and functional characterization of the human N-CoR complex: the roles of HDAC3, TBL1 and TBLR1 (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2003. — Vol. 22, no. 6. — P. 1336—1346. — doi:10.1093/emboj/cdg120. — PMID 12628926. — PMC 151047.
  15. ↑ 1 2 Guenther M.G., Yu J., Kao G.D., Yen T.J., Lazar M.A. Assembly of the SMRT-histone deacetylase 3 repression complex requires the TCP-1 ring complex (англ.) // Genes & Development : journal. — 2002. — Vol. 16, no. 24. — P. 3130—3135. — doi:10.1101/gad.1037502. — PMID 12502735. — PMC 187500.
  16. ↑ 1 2 Guenther M.G., Lane W.S., Fischle W., Verdin E., Lazar M.A., Shiekhattar R. A core SMRT corepressor complex containing HDAC3 and TBL1, a WD40-repeat protein linked to deafness (англ.) // Genes & Development : journal. — 2000. — Vol. 14, no. 9. — P. 1048—1057. — PMID 10809664. — PMC 316569.
  17. ↑ 1 2 Fischle W., Dequiedt F., Hendzel M.J., Guenther M.G., Lazar M.A., Voelter W., Verdin E. Enzymatic activity associated with class II HDACs is dependent on a multiprotein complex containing HDAC3 and SMRT/N-CoR (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 9, no. 1. — P. 45—57. — doi:10.1016/S1097-2765(01)00429-4. — PMID 11804585.
  18. ↑ Yoon H.G., Chan D.W., Reynolds A.B., Qin J., Wong J. N-CoR mediates DNA methylation-dependent repression through a methyl CpG binding protein Kaiso (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 12, no. 3. — P. 723—734. — doi:10.1016/j.molcel.2003.08.008. — PMID 14527417.
  19. ↑ 1 2 3 Huang E.Y., Zhang J., Miska E.A., Guenther M.G., Kouzarides T., Lazar M.A. Nuclear receptor corepressors partner with class II histone deacetylases in a Sin3-independent repression pathway (англ.) // Genes & Development : journal. — 2000. — Vol. 14, no. 1. — P. 45—54. — PMID 10640275. — PMC 316335.
  20. ↑ Lyst M.J., Ekiert R., Ebert D.H., Merusi C., Nowak J., Selfridge J., Guy J., Kastan N.R., Robinson N.D., de Lima Alves F., Rappsilber J., Greenberg M.E., Bird A. Rett syndrome mutations abolish the interaction of MeCP2 with the NCoR/SMRT co-repressor (англ.) // Nature Neuroscience : journal. — 2013. — July (vol. 16, no. 7). — P. 898—902. — doi:10.1038/nn.3434. — PMID 23770565.
  21. ↑ Sohn Y.C., Kwak E., Na Y., Lee J.W., Lee S.K. Silencing mediator of retinoid and thyroid hormone receptors and activating signal cointegrator-2 as transcriptional coregulators of the orphan nuclear receptor Nur77 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 47. — P. 43734—43739. — doi:10.1074/jbc.M107208200. — PMID 11559707.
  22. ↑ Kakizawa T., Miyamoto T., Ichikawa K., Takeda T., Suzuki S., Mori J., Kumagai M., Yamashita K., Hashizume K. Silencing mediator for retinoid and thyroid hormone receptors interacts with octamer transcription factor-1 and acts as a transcriptional repressor (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 13. — P. 9720—9725. — doi:10.1074/jbc.M008531200. — PMID 11134019.
  23. ↑ Shi Y., Hon M., Evans R.M. The peroxisome proliferator-activated receptor delta, an integrator of transcriptional repression and nuclear receptor signaling (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 5. — P. 2613—2618. — doi:10.1073/pnas.052707099. — PMID 11867749. — PMC 122396.
  24. ↑ Giangrande P.H., Kimbrel E.A., Edwards D.P., McDonnell D.P. The opposing transcriptional activities of the two isoforms of the human progesterone receptor are due to differential cofactor binding (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 9. — P. 3102—3115. — doi:10.1128/MCB.20.9.3102-3115.2000. — PMID 10757795. — PMC 85605.
  25. ↑ Khan M.M., Nomura T., Kim H., Kaul S.C., Wadhwa R., Shinagawa T., Ichikawa-Iwata E., Zhong S., Pandolfi P.P., Ishii S. Role of PML and PML-RARalpha in Mad-mediated transcriptional repression (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 7, no. 6. — P. 1233—1243. — doi:10.1016/S1097-2765(01)00257-X. — PMID 11430826.
  26. ↑ Hong S.H., Yang Z., Privalsky M.L. Arsenic trioxide is a potent inhibitor of the interaction of SMRT corepressor with Its transcription factor partners, including the PML-retinoic acid receptor alpha oncoprotein found in human acute promyelocytic leukemia (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 21. — P. 7172—7182. — doi:10.1128/MCB.21.21.7172-7182.2001. — PMID 11585900. — PMC 99892.
  27. ↑ Beatus P., Lundkvist J., Oberg C., Pedersen K., Lendahl U. The origin of the ankyrin repeat region in Notch intracellular domains is critical for regulation of HES promoter activity (англ.) // Mechanisms of Development[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 104, no. 1—2. — P. 3—20. — doi:10.1016/S0925-4773(01)00373-2. — PMID 11404076.
  28. ↑ Zhou S., Hayward S.D. Nuclear localization of CBF1 is regulated by interactions with the SMRT corepressor complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 18. — P. 6222—6232. — doi:10.1128/MCB.21.18.6222-6232.2001. — PMID 11509665. — PMC 87339.
  29. ↑ Espinosa L., Inglés-Esteve J., Robert-Moreno A., Bigas A. IkappaBalpha and p65 regulate the cytoplasmic shuttling of nuclear corepressors: cross-talk between Notch and NFkappaB pathways (англ.) // Molecular Biology of the Cell : journal. — 2003. — Vol. 14, no. 2. — P. 491—502. — doi:10.1091/mbc.E02-07-0404. — PMID 12589049. — PMC 149987.
  30. ↑ 1 2 Takahashi S., McConnell M.J., Harigae H., Kaku M., Sasaki T., Melnick A.M., Licht J.D. The Flt3 internal tandem duplication mutant inhibits the function of transcriptional repressors by blocking interactions with SMRT (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2004. — Vol. 103, no. 12. — P. 4650—4658. — doi:10.1182/blood-2003-08-2759. — PMID 14982881.
  31. ↑ Zhang J., Hug B.A., Huang E.Y., Chen C.W., Gelmetti V., Maccarana M., Minucci S., Pelicci P.G., Lazar M.A. Oligomerization of ETO is obligatory for corepressor interaction (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 1. — P. 156—163. — doi:10.1128/MCB.21.1.156-163.2001. — PMID 11113190. — PMC 88789.
  32. ↑ Dong S., Tweardy D.J. Interactions of STAT5b-RARalpha, a novel acute promyelocytic leukemia fusion protein, with retinoic acid receptor and STAT3 signaling pathways (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2002. — Vol. 99, no. 8. — P. 2637—2646. — doi:10.1182/blood.V99.8.2637. — PMID 11929748.
  33. ↑ 1 2 Hong S.H., David G., Wong C.W., Dejean A., Privalsky M.L. SMRT corepressor interacts with PLZF and with the PML-retinoic acid receptor alpha (RARalpha) and PLZF-RARalpha oncoproteins associated with acute promyelocytic leukemia (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — Vol. 94, no. 17. — P. 9028—9033. — doi:10.1073/pnas.94.17.9028. — PMID 9256429. — PMC 23013.
  34. ↑ Zhou S., Fujimuro M., Hsieh J.J., Chen L., Hayward S.D. A role for SKIP in EBNA2 activation of CBF1-repressed promoters (англ.) // Journal of Virology[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 74, no. 4. — P. 1939—1947. — doi:10.1128/JVI.74.4.1939-1947.2000. — PMID 10644367. — PMC 111672.
  35. ↑ Zhou S., Fujimuro M., Hsieh J.J., Chen L., Miyamoto A., Weinmaster G., Hayward S.D. SKIP, a CBF1-associated protein, interacts with the ankyrin repeat domain of NotchIC To facilitate NotchIC function (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 7. — P. 2400—2410. — doi:10.1128/MCB.20.7.2400-2410.2000. — PMID 10713164. — PMC 85419.
  36. ↑ Shi Y., Downes M., Xie W., Kao H.Y., Ordentlich P., Tsai C.C., Hon M., Evans R.M. Sharp, an inducible cofactor that integrates nuclear receptor repression and activation (англ.) // Genes & Development : journal. — 2001. — Vol. 15, no. 9. — P. 1140—1151. — doi:10.1101/gad.871201. — PMID 11331609. — PMC 312688.
  37. ↑ Liu Y., Takeshita A., Misiti S., Chin W.W., Yen P.M. Lack of coactivator interaction can be a mechanism for dominant negative activity by mutant thyroid hormone receptors (англ.) // Endocrinology : journal. — 1998. — Vol. 139, no. 10. — P. 4197—4204. — doi:10.1210/endo.139.10.6218. — PMID 9751500.
  38. ↑ 1 2 Tagami T., Lutz W.H., Kumar R., Jameson J.L. The interaction of the vitamin D receptor with nuclear receptor corepressors and coactivators (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 1998. — Vol. 253, no. 2. — P. 358—363. — doi:10.1006/bbrc.1998.9799. — PMID 9878542.
  39. ↑ Ando S., Sarlis N.J., Krishnan J., Feng X., Refetoff S., Zhang M.Q., Oldfield E.H., Yen P.M. Aberrant alternative splicing of thyroid hormone receptor in a TSH-secreting pituitary tumor is a mechanism for hormone resistance (англ.) // Molecular Endocrinology[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 15, no. 9. — P. 1529—1538. — doi:10.1210/me.15.9.1529. — PMID 11518802.
  40. ↑ Puccetti E., Obradovic D., Beissert T., Bianchini A., Washburn B., Chiaradonna F., Boehrer S., Hoelzer D., Ottmann O.G., Pelicci P.G., Nervi C., Ruthardt M. AML-associated translocation products block vitamin D(3)-induced differentiation by sequestering the vitamin D(3) receptor (англ.) // Cancer Research[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 62, no. 23. — P. 7050—7058. — PMID 12460926.

Литература

[править | править код]
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=NCOR2&oldid=142022351