NAIP (NAIP)

NAIP
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 2VM5
Идентификаторы
Псевдонимы	NAIP, BIRC1, NLRB1, psiNLR family, apoptosis inhibitory protein, NLR family apoptosis inhibitory protein
Внешние ID	OMIM: 600355 MGI: 1298226 HomoloGene: 136092 GeneCards: NAIP
Расположение гена (человек) Хр. 5-я хромосома человека Локус 5q13.2 Начало 70,968,166 bp Конец 71,025,339 bp
Расположение гена (Мышь) Хр. 13-я хромосома мыши Локус 13 D1|13 53.01 cM Начало 100,280,571 bp Конец 100,338,600 bp
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в right uterine tube epithelium of colon Наибольшая экспрессия в left colon epithelium of small intestine Intestinal villus male urethra Дополнительные справочные данные BioGPS н/д
Генная онтология Молекулярная функция peptidase inhibitor activity нуклеотид-связывающий cysteine-type endopeptidase inhibitor activity связывание с ионом металла ubiquitin-protein transferase activity связывание с белками плазмы АТФ-связанные cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process Компонент клетки перикарион soma basolateral plasma membrane neuron projection цитоплазма клеточное ядро Биологический процесс negative regulation of neuron apoptotic process negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process response to amino acid negative regulation of peptidase activity immune system process развитие нервной системы response to axon injury врождённый иммунитет воспалительная реакция апоптоз protein ubiquitination positive regulation of canonical Wnt signaling pathway mitotic spindle assembly inhibition of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process негативная регуляция апоптоза Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 4671 17948 Ensembl ENSG00000278613 ENSG00000276068 ENSG00000249437 ENSMUSG00000078945 UniProt Q13075 Q9QUK4 RefSeq (мРНК) NM_004536 NM_022892 NM_001346870 NM_001126182 NM_010872 RefSeq (белок) NP_001333799 NP_004527 NP_075043 NP_001119654 NP_035002 Локус (UCSC) Chr 5: 70.97 – 71.03 Mb Chr 13: 100.28 – 100.34 Mb Поиск по PubMed Искать Искать
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

NAIP (англ. NLR family, apoptosis inhibitory protein) — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор, продукт гена NAIP, ингибирует апоптоз.

Функции

NAIP является анти-апоптозным белком, ингибирует каспазы 3, 7 и 9. Может ингибировать как аутопротеолиз прокаспазы-9, так и активирующий протеолиз прокаспазы-3 под действием каспазы-9. Играет роль медиатора выживания нейрональных клеток в патологических условиях, предотвращает апоптоз моторных нейронов, вызванный различными сигналами. Различные мутации белка были обнаружены у больных с тяжёлой спинальной мышечной атрофией.

Структура

NLRC5 — крупный белок, состоит из 1403 аминокислот, молекулярная масса — 159,6 кДа. Молекула включает 3 BIR-повтора, NACHT-домен с участком связывания АТФ и 4 цистеиновых участков связываний цинка в 3-м BIR-домене.

Взаимодействует с APAF1 через NACHT-домен.

Тканевая специфичность

Экспрессируется в моторных нейронах, но отсутствует в сенсорных нейронах. Присутствует в печени, плаценте, в меньшей степени — в спинном мозге.

Литература

• van der Steege G., Draaijers T. G., Grootscholten P. M., et al. A provisional transcript map of the spinal muscular atrophy (SMA) critical region. (англ.) // Eur. J. Hum. Genet. : journal. — 1995. — Vol. 3, no. 2. — P. 87—95. — PMID 7552146.
• Liston P., Roy N., Tamai K., et al. Suppression of apoptosis in mammalian cells by NAIP and a related family of IAP genes. (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 379, no. 6563. — P. 349—353. — doi:10.1038/379349a0. — PMID 8552191.
• Chen Q., Baird S. D., Mahadevan M., et al. Sequence of a 131-kb region of 5q13.1 containing the spinal muscular atrophy candidate genes SMN and NAIP. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 48, no. 1. — P. 121—127. — doi:10.1006/geno.1997.5141. — PMID 9503025.
• Monani U. R., Lorson C. L., Parsons D. W., et al. A single nucleotide difference that alters splicing patterns distinguishes the SMA gene SMN1 from the copy gene SMN2. (англ.) // Human Molecular Genetics : journal. — Oxford University Press, 1999. — Vol. 8, no. 7. — P. 1177—1183. — doi:10.1093/hmg/8.7.1177. — PMID 10369862.
• Yamamoto K., Sakai H., Hadano S., et al. Identification of two distinct transcripts for the neuronal apoptosis inhibitory protein gene. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. : journal. — 1999. — Vol. 264, no. 3. — P. 998—1006. — doi:10.1006/bbrc.1999.1615. — PMID 10544044.
• Mercer E. A., Korhonen L., Skoglösa Y., et al. NAIP interacts with hippocalcin and protects neurons against calcium-induced cell death through caspase-3-dependent and -independent pathways. (англ.) // EMBO J. : journal. — 2000. — Vol. 19, no. 14. — P. 3597—3607. — doi:10.1093/emboj/19.14.3597. — PMID 10899114. — PMC 313967.
• Sanna M. G., da Silva Correia J., Ducrey O., et al. IAP suppression of apoptosis involves distinct mechanisms: the TAK1/JNK1 signaling cascade and caspase inhibition. (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 6. — P. 1754—1766. — doi:10.1128/MCB.22.6.1754-1766.2002. — PMID 11865055. — PMC 135597.
• Akutsu T., Nishio H., Sumino K., et al. Molecular genetics of spinal muscular atrophy: contribution of the NAIP gene to clinical severity. (англ.) // The Kobe journal of medical sciences : journal. — 2002. — Vol. 48, no. 1—2. — P. 25—31. — PMID 11912351.
• Xu M., Okada T., Sakai H., et al. Functional human NAIP promoter transcription regulatory elements for the NAIP and PsiNAIP genes. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta : journal. — 2002. — Vol. 1574, no. 1. — P. 35—50. — doi:10.1016/S0167-4781(01)00343-8. — PMID 11955612.
• Notarbartolo M., Cervello M., Dusonchet L., D'Alessandro N. NAIP-deltaEx10-11: a novel splice variant of the apoptosis inhibitor NAIP differently expressed in drug-sensitive and multidrug-resistant HL60 leukemia cells. (англ.) // Leuk. Res. : journal. — 2002. — Vol. 26, no. 9. — P. 857—862. — doi:10.1016/S0145-2126(02)00016-4. — PMID 12127562.
• Lindholm D., Mercer E. A., Yu L. Y., et al. Neuronal apoptosis inhibitory protein: Structural requirements for hippocalcin binding and effects on survival of NGF-dependent sympathetic neurons. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta : journal. — 2002. — Vol. 1600, no. 1—2. — P. 138—147. — doi:10.1016/S1570-9639(02)00454-5. — PMID 12445469.
• Damiano J. S., Oliveira V., Welsh K., Reed J. C. Heterotypic interactions among NACHT domains: implications for regulation of innate immune responses. (англ.) // Biochem. J. : journal. — 2004. — Vol. 381, no. Pt 1. — P. 213—219. — doi:10.1042/BJ20031506. — PMID 15107016. — PMC 1133779.
• Davoodi J., Lin L., Kelly J., et al. Neuronal apoptosis-inhibitory protein does not interact with Smac and requires ATP to bind caspase-9. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 39. — P. 40622—40628. — doi:10.1074/jbc.M405963200. — PMID 15280366.
• Aubin D., Gagnon A., Grunder L., et al. Adipogenic and antiapoptotic protein levels in human adipose stromal cells after weight loss. (англ.) // Obes. Res. : journal. — 2004. — Vol. 12, no. 8. — P. 1231—1234. — doi:10.1038/oby.2004.156. — PMID 15340105.
• Schmutz J., Martin J., Terry A., et al. The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 5. (англ.) // Nature : journal. — 2004. — Vol. 431, no. 7006. — P. 268—274. — doi:10.1038/nature02919. — PMID 15372022.
• Romanish M. T., Lock W. M., van de Lagemaat L. N., et al. Repeated recruitment of LTR retrotransposons as promoters by the anti-apoptotic locus NAIP during mammalian evolution. (англ.) // PLoS Genet. : journal. — 2007. — Vol. 3, no. 1. — P. e10. — doi:10.1371/journal.pgen.0030010. — PMID 17222062. — PMC 1781489.
• Maier J. K., Balabanian S., Coffill C. R., et al. Distribution of neuronal apoptosis inhibitory protein in human tissues. (англ.) // J. Histochem. Cytochem. : journal. — 2007. — Vol. 55, no. 9. — P. 911—923. — doi:10.1369/jhc.6A7144.2007. — PMID 17510375.