IRF4 (IRF4)

Регуляторный фактор интерферона 4
Регуляторный фактор интерферона 4
	PDB в комплексе с 2dll.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
	Список идентификаторов PDB 2DLL
Идентификаторы
Символ	IRF4 ; LSIRF; MUM1; NF-EM5
Внешние ID	OMIM: 601900 MGI: 1096873 HomoloGene: 1842 GeneCards: Ген IRF4
Функция	• regulatory region DNA binding; • sequence-specific DNA binding transcription factor activity; • protein binding; • transcription factor binding; • protein-lysine N-methyltransferase activity; • sequence-specific DNA binding;
Компонент клетки	• nuclear nucleosome; • nucleus; • cytosol; • membrane;
Биологический процесс	• transcription, DNA-templated; • peptidyl-lysine methylation; • cytokine-mediated signaling pathway; • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway; • T cell activation; • defense response to protozoan; • myeloid dendritic cell differentiation; • positive regulation of DNA binding; • histone H3 acetylation; • histone H4 acetylation; • positive regulation of interleukin-10 biosynthetic process; • positive regulation of interleukin-2 biosynthetic process; • positive regulation of interleukin-13 biosynthetic process; • positive regulation of interleukin-4 biosynthetic process; • regulation of T-helper cell differentiation; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • type I interferon signaling pathway; • T-helper 17 cell lineage commitment;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

♣

Регуляторный фактор интерферона 4, также известный как MUM1 — белок, который у человека, кодируется геном IRF4,^[1]^[2]^[3], расположенным на 6p25-p23.

Символ MUM1 многозначен; он старше синонима для IRF4 (HGNC: 6119), кроме того, нынешний официальный символ HGNC для меланомы связан с (мутированным) антигеном 1 (HGNC: 29641; расположенном в 19p13.3).

Клиническое значение

В пигментных клетках ген IRF4 может регулироваться MITF^[англ.].^[4] IRF4 является фактором транскрипции, который вовлечен в острый лейкоз.^[5] Этот ген сильно ассоциирован с различной пигментацией, как то: чувствительность кожи к воздействию солнца, веснушки, голубой цвет глаз, и коричневый цвет волос.^[6]

Взаимодействия

IRF4, как было выявлено, взаимодействует с:

См. также

Интерферон
IRF1, IRF2, IRF3, IRF5, IRF6, IRF7, IRF8 и IRF9

Примечания

↑ Grossman A., Mittrücker H.W., Nicholl J., Suzuki A., Chung S., Antonio L., Suggs S., Sutherland G.R., Siderovski D.P., Mak T.W. Cloning of human lymphocyte-specific interferon regulatory factor (hLSIRF/hIRF4) and mapping of the gene to 6p23-p25 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1997. — February (vol. 37, no. 2). — P. 229—233. — doi:10.1006/geno.1996.0547. — PMID 8921401.
↑ Xu D., Zhao L., Del Valle L., Miklossy J., Zhang L. Interferon regulatory factor 4 is involved in Epstein-Barr virus-mediated transformation of human B lymphocytes (англ.) // J Virol^[англ.] : journal. — 2008. — June (vol. 82, no. 13). — P. 6251—6258. — doi:10.1128/JVI.00163-08. — PMID 18417578. — PMC 2447047.
↑ Entrez Gene: IRF4 interferon regulatory factor 4 (неопр.).
↑ Hoek K.S., Schlegel N.C., Eichhoff O.M., Widmer D.S., Praetorius C., Einarsson S.O., Valgeirsdottir S., Bergsteinsdottir K., Schepsky A., Dummer R., Steingrimsson E. Novel MITF targets identified using a two-step DNA microarray strategy (англ.) // Pigment Cell Melanoma Res.^[англ.] : journal. — 2008. — Vol. 21, no. 6. — P. 665—676. — doi:10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x. — PMID 19067971.
↑ Adamaki M., Lambrou G.I., Athanasiadou A., Tzanoudaki M., Vlahopoulos S., Moschovi M. Implication of IRF4 aberrant gene expression in the acute leukemias of childhood (англ.) // PLOS One : journal. — 2013. — Vol. 8, no. 8. — P. e72326. — doi:10.1371/journal.pone.0072326. — PMID 23977280. — PMC 3744475.
↑ Praetorius C., Grill C., Stacey S.N., Metcalf A.M., Gorkin D.U., Robinson K.C., Van Otterloo E., Kim R.S., Bergsteinsdottir K., Ogmundsdottir M.H., Magnusdottir E., Mishra P.J., Davis S.R., Guo T., Zaidi M.R., Helgason A.S., Sigurdsson M.I., Meltzer P.S., Merlino G., Petit V., Larue L., Loftus S.K., Adams D.R., Sobhiafshar U., Emre N.C., Pavan W.J., Cornell R., Smith A.G., McCallion A.S., Fisher D.E., Stefansson K., Sturm R.A., Steingrimsson E. A Polymorphism in IRF4 Affects Human Pigmentation through a Tyrosinase-Dependent MITF/TFAP2A Pathway (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2013. — November (vol. 155, no. 5). — P. 1022—1033. — doi:10.1016/j.cell.2013.10.022. — PMID 24267888.
↑ ¹ ² Gupta S., Jiang M., Anthony A., Pernis A.B. Lineage-specific modulation of interleukin 4 signaling by interferon regulatory factor 4 (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 1999. — December (vol. 190, no. 12). — P. 1837—1848. — doi:10.1084/jem.190.12.1837. — PMID 10601358. — PMC 2195723.
↑ Rengarajan J., Mowen K.A., McBride K.D., Smith E.D., Singh H., Glimcher L.H. Interferon regulatory factor 4 (IRF4) interacts with NFATc2 to modulate interleukin 4 gene expression (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2002. — April (vol. 195, no. 8). — P. 1003—1012. — doi:10.1084/jem.20011128. — PMID 11956291. — PMC 2193700.
↑ Brass A.L., Zhu A.Q., Singh H. Assembly requirements of PU.1-Pip (IRF-4) activator complexes: inhibiting function in vivo using fused dimers (англ.) // EMBO J. : journal. — 1999. — February (vol. 18, no. 4). — P. 977—991. — doi:10.1093/emboj/18.4.977. — PMID 10022840. — PMC 1171190.
↑ Escalante C.R., Shen L., Escalante M.C., Brass A.L., Edwards T.A., Singh H., Aggarwal A.K. Crystallization and characterization of PU.1/IRF-4/DNA ternary complex (англ.) // J. Struct. Biol.^[англ.] : journal. — 2002. — July (vol. 139, no. 1). — P. 55—9. — doi:10.1016/S1047-8477(02)00514-2. — PMID 12372320.

Литература

Mamane Y., Sharma S., Grandvaux N., Hernandez E., Hiscott J. IRF-4 activities in HTLV-I-induced T cell leukemogenesis (англ.) // J. Interferon Cytokine Res. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 1. — P. 135—143. — doi:10.1089/107999002753452746. — PMID 11846984.
Yamagata T., Nishida J., Tanaka S., Sakai R., Mitani K., Yoshida M., Taniguchi T., Yazaki Y., Hirai H. A novel interferon regulatory factor family transcription factor, ICSAT/Pip/LSIRF, that negatively regulates the activity of interferon-regulated genes (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 4. — P. 1283—1294. — PMID 8657101. — PMC 231112.
Iida S., Rao P.H., Butler M., Corradini P., Boccadoro M., Klein B., Chaganti R.S., Dalla-Favera R. Deregulation of MUM1/IRF4 by chromosomal translocation in multiple myeloma (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1997. — Vol. 17, no. 2. — P. 226—230. — doi:10.1038/ng1097-226. — PMID 9326949.
Brass A.L., Zhu A.Q., Singh H. Assembly requirements of PU.1-Pip (IRF-4) activator complexes: inhibiting function in vivo using fused dimers (англ.) // EMBO J. : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 4. — P. 977—991. — doi:10.1093/emboj/18.4.977. — PMID 10022840. — PMC 1171190.
Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon M.C. SPI-B activates transcription via a unique proline, serine, and threonine domain and exhibits DNA binding affinity differences from PU.1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 16. — P. 11115—11124. — doi:10.1074/jbc.274.16.11115. — PMID 10196196.
Marecki S., Atchison M.L., Fenton M.J. Differential expression and distinct functions of IFN regulatory factor 4 and IFN consensus sequence binding protein in macrophages (англ.) // J. Immunol. : journal. — 1999. — Vol. 163, no. 5. — P. 2713—2722. — PMID 10453013.
Gupta S., Jiang M., Anthony A., Pernis A.B. Lineage-specific modulation of interleukin 4 signaling by interferon regulatory factor 4 (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2000. — Vol. 190, no. 12. — P. 1837—1848. — doi:10.1084/jem.190.12.1837. — PMID 10601358. — PMC 2195723.
Mamane Y., Sharma S., Petropoulos L., Lin R., Hiscott J. Posttranslational regulation of IRF-4 activity by the immunophilin FKBP52 (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2000. — Vol. 12, no. 2. — P. 129—140. — doi:10.1016/S1074-7613(00)80166-1. — PMID 10714679.
Gupta S., Anthony A., Pernis A.B. Stage-specific modulation of IFN-regulatory factor 4 function by Krüppel-type zinc finger proteins (англ.) // J. Immunol. : journal. — 2001. — Vol. 166, no. 10. — P. 6104—6111. — doi:10.4049/jimmunol.166.10.6104. — PMID 11342629.
Imaizumi Y., Kohno T., Yamada Y., Ikeda S., Tanaka Y., Tomonaga M., Matsuyama T. Possible involvement of interferon regulatory factor 4 (IRF4) in a clinical subtype of adult T-cell leukemia (англ.) // Jpn. J. Cancer Res.^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 92, no. 12. — P. 1284—1292. — doi:10.1111/j.1349-7006.2001.tb02151.x. — PMID 11749693.
Rengarajan J., Mowen K.A., McBride K.D., Smith E.D., Singh H., Glimcher L.H. Interferon regulatory factor 4 (IRF4) interacts with NFATc2 to modulate interleukin 4 gene expression (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2002. — Vol. 195, no. 8. — P. 1003—1012. — doi:10.1084/jem.20011128. — PMID 11956291. — PMC 2193700.
Sharma S., Grandvaux N., Mamane Y., Genin P., Azimi N., Waldmann T., Hiscott J. Regulation of IFN regulatory factor 4 expression in human T cell leukemia virus-I-transformed T cells (англ.) // J. Immunol. : journal. — 2002. — Vol. 169, no. 6. — P. 3120—3130. — doi:10.4049/jimmunol.169.6.3120. — PMID 12218129.
Escalante C.R., Shen L., Escalante M.C., Brass A.L., Edwards T.A., Singh H., Aggarwal A.K. Crystallization and characterization of PU.1/IRF-4/DNA ternary complex (англ.) // J. Struct. Biol.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 139, no. 1. — P. 55—9. — doi:10.1016/S1047-8477(02)00514-2. — PMID 12372320.
Hu C.M., Jang S.Y., Fanzo J.C., Pernis A.B. Modulation of T cell cytokine production by interferon regulatory factor-4 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 277, no. 51. — P. 49238—49246. — doi:10.1074/jbc.M205895200. — PMID 12374808.
Fanzo J.C., Hu C.M., Jang S.Y., Pernis A.B. Regulation of lymphocyte apoptosis by interferon regulatory factor 4 (IRF-4) (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2003. — Vol. 197, no. 3. — P. 303—314. — doi:10.1084/jem.20020717. — PMID 12566414. — PMC 2193834.
O'Reilly D., Quinn C.M., El-Shanawany T., Gordon S., Greaves D.R. Multiple Ets factors and interferon regulatory factor-4 modulate CD68 expression in a cell type-specific manner (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 24. — P. 21909—21919. — doi:10.1074/jbc.M212150200. — PMID 12676954.
Sundram U., Harvell J.D., Rouse R.V., Natkunam Y. Expression of the B-cell proliferation marker MUM1 by melanocytic lesions and comparison with S100, gp100 (HMB45), and MelanA (англ.) // Mod. Pathol. : journal. — 2004. — Vol. 16, no. 8. — P. 802—810. — doi:10.1097/01.MP.0000081726.49886.CF. — PMID 12920225.

[pmid8921401-1] Grossman A., Mittrücker H.W., Nicholl J., Suzuki A., Chung S., Antonio L., Suggs S., Sutherland G.R., Siderovski D.P., Mak T.W. Cloning of human lymphocyte-specific interferon regulatory factor (hLSIRF/hIRF4) and mapping of the gene to 6p23-p25 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1997. — February (vol. 37, no. 2). — P. 229—233. — doi:10.1006/geno.1996.0547. — PMID 8921401.

[pmid18417578-2] Xu D., Zhao L., Del Valle L., Miklossy J., Zhang L. Interferon regulatory factor 4 is involved in Epstein-Barr virus-mediated transformation of human B lymphocytes (англ.) // J Virol^[англ.] : journal. — 2008. — June (vol. 82, no. 13). — P. 6251—6258. — doi:10.1128/JVI.00163-08. — PMID 18417578. — PMC 2447047.

[entrez-3] Entrez Gene: IRF4 interferon regulatory factor 4 (неопр.).

[pmid19067971-4] Hoek K.S., Schlegel N.C., Eichhoff O.M., Widmer D.S., Praetorius C., Einarsson S.O., Valgeirsdottir S., Bergsteinsdottir K., Schepsky A., Dummer R., Steingrimsson E. Novel MITF targets identified using a two-step DNA microarray strategy (англ.) // Pigment Cell Melanoma Res.^[англ.] : journal. — 2008. — Vol. 21, no. 6. — P. 665—676. — doi:10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x. — PMID 19067971.

[pmid23977280-5] Adamaki M., Lambrou G.I., Athanasiadou A., Tzanoudaki M., Vlahopoulos S., Moschovi M. Implication of IRF4 aberrant gene expression in the acute leukemias of childhood (англ.) // PLOS One : journal. — 2013. — Vol. 8, no. 8. — P. e72326. — doi:10.1371/journal.pone.0072326. — PMID 23977280. — PMC 3744475.

[pmid24267888-6] Praetorius C., Grill C., Stacey S.N., Metcalf A.M., Gorkin D.U., Robinson K.C., Van Otterloo E., Kim R.S., Bergsteinsdottir K., Ogmundsdottir M.H., Magnusdottir E., Mishra P.J., Davis S.R., Guo T., Zaidi M.R., Helgason A.S., Sigurdsson M.I., Meltzer P.S., Merlino G., Petit V., Larue L., Loftus S.K., Adams D.R., Sobhiafshar U., Emre N.C., Pavan W.J., Cornell R., Smith A.G., McCallion A.S., Fisher D.E., Stefansson K., Sturm R.A., Steingrimsson E. A Polymorphism in IRF4 Affects Human Pigmentation through a Tyrosinase-Dependent MITF/TFAP2A Pathway (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2013. — November (vol. 155, no. 5). — P. 1022—1033. — doi:10.1016/j.cell.2013.10.022. — PMID 24267888.

[pmid10601358-7] ¹ ² Gupta S., Jiang M., Anthony A., Pernis A.B. Lineage-specific modulation of interleukin 4 signaling by interferon regulatory factor 4 (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 1999. — December (vol. 190, no. 12). — P. 1837—1848. — doi:10.1084/jem.190.12.1837. — PMID 10601358. — PMC 2195723.

[pmid11956291-8] Rengarajan J., Mowen K.A., McBride K.D., Smith E.D., Singh H., Glimcher L.H. Interferon regulatory factor 4 (IRF4) interacts with NFATc2 to modulate interleukin 4 gene expression (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2002. — April (vol. 195, no. 8). — P. 1003—1012. — doi:10.1084/jem.20011128. — PMID 11956291. — PMC 2193700.

[pmid10022840-9] Brass A.L., Zhu A.Q., Singh H. Assembly requirements of PU.1-Pip (IRF-4) activator complexes: inhibiting function in vivo using fused dimers (англ.) // EMBO J. : journal. — 1999. — February (vol. 18, no. 4). — P. 977—991. — doi:10.1093/emboj/18.4.977. — PMID 10022840. — PMC 1171190.

[pmid12372320-10] Escalante C.R., Shen L., Escalante M.C., Brass A.L., Edwards T.A., Singh H., Aggarwal A.K. Crystallization and characterization of PU.1/IRF-4/DNA ternary complex (англ.) // J. Struct. Biol.^[англ.] : journal. — 2002. — July (vol. 139, no. 1). — P. 55—9. — doi:10.1016/S1047-8477(02)00514-2. — PMID 12372320.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]