Brachyury (Brachyury)

T brachyury transcription factor
T brachyury transcription factor
	PDB rendering based on 1xbr.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
	Список идентификаторов PDB 1xbr
Идентификаторы
Символ	T ; SAVA; TFT
Внешние ID	OMIM: 601397 MGI: 98472 HomoloGene: 2393 GeneCards: Ген T
Функция	• RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription factor binding; • RNA polymerase II activating transcription factor binding; • transcriptional repressor activity, RNA polymerase II transcription factor binding; • transcription factor activity, sequence-specific DNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding;
Компонент клетки	• nuclear chromatin; • nucleus; • cytoplasm;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • vasculogenesis; • somitogenesis; • neural plate morphogenesis; • neural tube closure; • heart morphogenesis; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in myocardial precursor cell differentiation; • transcription, DNA-templated; • signal transduction; • penetration of zona pellucida; • mesoderm development; • mesoderm migration involved in gastrulation; • positive regulation of cell proliferation; • anterior/posterior axis specification, embryo; • notochord formation; • signal transduction involved in regulation of gene expression; • BMP signaling pathway; • post-anal tail morphogenesis; • embryonic skeletal system development; • canonical Wnt signaling pathway; • bone morphogenesis; • SMAD protein signal transduction; • determination of heart left/right asymmetry; • cellular response to retinoic acid; • primitive streak formation;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи

Brachyury — белок, который кодируется геном Т, эмбриональный транскрипционный фактор. Входит в семейство белков с Т-боксом, играет важную роль в эмбриогенезе трехслойных животных.

История открытия

Мутацию brachyury у мышей описала французский генетик Надежда Добровольская в 1927 году^[1]. Гетерозиготы по этой мутацией имели укороченный хвост и крестцовый отдел позвоночника, тогда как гомозиготы погибали ещё до рождения. Название происходит от греческого βράχυς brachys — короткий, и ούρα oura — хвост. Мутация была доминантной, но Добровольская считала, что она связана с потерей функции белка, что и подтвердилось позже.

Белок клонирован в 1990 году. Это оказался эмбриональный транскрипционный фактор длиной в 436 аминокислотных остатков. Он присоединяется с помощью специальной последовательности на N-конце (Т-бокса) к регуляторной последовательности нуклеотидов ДНК TCACACCT^[2].

Функция

Ген транскрибируется у мышей в бластоцисте и при гаструляции. Белок определяет формирование центральной оси тела, хорды, мезодермы, бластопора.

Распространение

Раньше считалось, что Т-ген имеется только у трехслойных животных. В дальнейшем гены с Т-боксом были найдены у кишечнополостных и губок. В 2010 году гомолог Т-гена был описан у амёб, а позже у многих одноклеточных, относящихся к группе Opisthokonta. Т-ген амёбы, который пересадили зародышу шпорцевой лягушки, был способен выполнять нужную функцию.^[3]

Патология

Brachyury имеет высокий уровень экспрессии в некоторых раковых опухолях.

Примечания

↑ Dobrovolskaïa-Zavadskaïa N. Sur la mortification spontanee de la chez la souris nouveau-nee et sur l'existence d'un caractere (facteur) hereditaire, non-viable. // Crit Rev Soc Biol. — 1927. — № 97. — P. 114—116.
↑ Herrmann B.G., Labeit S., Poustka A., King T.R., Lehrach H. Cloning of the T gene required in mesoderm formation in the mouse (англ.) // Nature : journal. — 1990. — February (vol. 343, no. 6259). — P. 617—622. — doi:10.1038/343617a0. — PMID 2154694.
↑ Sebe-Pedros, A.; Ariza-Cosano, A.; Weirauch, M. T.; Leininger, S.; Yang, A.; Torruella, G.; Adamski, M.; Adamska, M.; Hughes, T. R.; Gomez-Skarmeta, J. L.; Ruiz-Trillo, I. Early evolution of the T-box transcription factor family (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2013. — Vol. 110, no. 40. — P. 16050—16055. — ISSN 0027-8424. — doi:10.1073/pnas.1309748110.

Источники

Короткохвості миші на світанку генетики розвитку - Надія Добровольська-Завадська (неопр.). Моя наука. Архивировано из оригинала 31 января 2016 года.
Ястребов, Сергей У одноклеточных организмов есть ген, способный управлять развитием хорды (неопр.). Элементы.ру.

[1] Dobrovolskaïa-Zavadskaïa N. Sur la mortification spontanee de la chez la souris nouveau-nee et sur l'existence d'un caractere (facteur) hereditaire, non-viable. // Crit Rev Soc Biol. — 1927. — № 97. — P. 114—116.

[2] Herrmann B.G., Labeit S., Poustka A., King T.R., Lehrach H. Cloning of the T gene required in mesoderm formation in the mouse (англ.) // Nature : journal. — 1990. — February (vol. 343, no. 6259). — P. 617—622. — doi:10.1038/343617a0. — PMID 2154694.

[Sebe-PedrosAriza-Cosano2013-3] Sebe-Pedros, A.; Ariza-Cosano, A.; Weirauch, M. T.; Leininger, S.; Yang, A.; Torruella, G.; Adamski, M.; Adamska, M.; Hughes, T. R.; Gomez-Skarmeta, J. L.; Ruiz-Trillo, I. Early evolution of the T-box transcription factor family (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2013. — Vol. 110, no. 40. — P. 16050—16055. — ISSN 0027-8424. — doi:10.1073/pnas.1309748110.

[1]

[2]

[3]