Транспортин-1 (Mjguvhkjmnu-1)

Перейти к навигации Перейти к поиску
Транспортин-1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1QBK, 2H4M, 2OT8, 2QMR, 2Z5J, 2Z5K, 2Z5M, 2Z5N, 2Z5O, 4FDD, 4FQ3, 4JLQ, 4OO6

Идентификаторы
ПсевдонимыTNPO1, IPO2, KPNB2, MIP, MIP1, TRN, Transportin 1
Внешние IDOMIM: 602901 MGI: 2681523 HomoloGene: 5358 GeneCards: TNPO1
Расположение гена (человек)
5-я хромосома человека
Хр.5-я хромосома человека[1]
5-я хромосома человека
Расположение в геноме TNPO1
Расположение в геноме TNPO1
Локус5q13.2Начало72,816,312 bp[1]
Конец72,916,733 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
13-я хромосома мыши
Хр.13-я хромосома мыши[2]
13-я хромосома мыши
Расположение в геноме TNPO1
Расположение в геноме TNPO1
Локус13 D1|13 52.24 cMНачало98,975,527 bp[2]
Конец99,062,892 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002270
NM_153188

NM_001048267
NM_178716

RefSeq (белок)
NP_002261
NP_694858
NP_001351221
NP_001351222
NP_001351223

NP_001351224
NP_001351225

NP_001041732
NP_848831

Локус (UCSC)Chr 5: 72.82 – 72.92 MbChr 13: 98.98 – 99.06 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Транспортин-1 (импортин-β2, кариоферин-β2, MIP) — транспортный фактор, участвующий в переносе белков в клеточное ядро, который у человека кодируется геном TNPO1. Транспортин-1 импортирует в ядро широкий спектр белков, среди которых много РНК-связывающих белков и факторов транскрипции[5]. Гомологом транспортина-1 у дрожжей является Kap104p[6].

Транспортин-1 связывает свои субстраты напрямую без участия адаптера. Он распознаёт особый тип сигнала ядерной локализации — PY-NLS (англ. Nuclear Localization Signal). PY-NLS имеют размер 15—30 аминокислотных остатков и могут довольно сильно отличаться по последовательности, но в целом они характеризуются наличием N-концевого кластера гидрофобных или положительно заряженных аминокислотных остатков и C-концевым мотивом R/K/H-X2—5-P-Y[7]. Соответственно выделяют два подкласса PY-NLS: гидрофобные и основные. Известно несколько белков, которые транспортируются в ядро транспортином-1, но не содержат PY-NLS[8].

Большинство известных субстратов транспортина-1 представлено РНК-связывающими белками[8]. Субстратами транспортина-1 являются белки PQBP1, PABP2, EWS, FUS, SAM68, hnRNP M, hnRNP A1, hnRNP A0, hnRNP A2, hnRNP A3, hnRNP D, hnRNP F, hnRNP H1, JKTP-1, TAP (NXF1), HuR, HEXIM1, RB15B, Clk3, WBS16, циклин T1, TAFII68, CPSF6, HCC1, SOX14, ETLE[6], DJ-1, ELYS, GSK-3β, HCMV UL79, huntingtin, PABPN1, TAF15, TIS11, RP2[7]. Все они содержат мотив PY-NLS. Субстраты KIF17 и symportin 1 содержат гомологичный PL-NLS. Кроме того есть сообщения об участии транспортина-1 в ядерном импорте некоторых белков (ADAR1, CD44, FOXO4, JMJD5, PLK1), которые не содержат явного PY-NLS.

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000083312 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009470 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Christie M., Chang C. W., Róna G., Smith K. M., Stewart A. G., Takeda A. A., Fontes M. R., Stewart M., Vértessy B. G., Forwood J. K., Kobe B. Structural biology and regulation of protein import into the nucleus. (англ.) // Journal of molecular biology. — 2015. — doi:10.1016/j.jmb.2015.10.023. — PMID 26523678. [исправить]
  6. 1 2 Chook Y. M., Süel K. E. Nuclear import by karyopherin-βs: recognition and inhibition. (англ.) // Biochimica et biophysica acta. — 2011. — Vol. 1813, no. 9. — P. 1593—1606. — doi:10.1016/j.bbamcr.2010.10.014. — PMID 21029754. [исправить]
  7. 1 2 Soniat M., Chook Y. M. Nuclear localization signals for four distinct karyopherin-β nuclear import systems. (англ.) // The Biochemical journal. — 2015. — Vol. 468, no. 3. — P. 353—362. — doi:10.1042/BJ20150368. — PMID 26173234. [исправить]
  8. 1 2 Twyffels L., Gueydan C., Kruys V. Transportin-1 and Transportin-2: protein nuclear import and beyond. (англ.) // FEBS letters. — 2014. — Vol. 588, no. 10. — P. 1857—1868. — doi:10.1016/j.febslet.2014.04.023. — PMID 24780099. [исправить]