Супероксиддисмутаза-1 (Vrhyjktvn;;nvbrmg[g-1)

Перейти к навигации Перейти к поиску
Супероксиддисмутаза-1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1AZV, 1BA9, 1DSW, 1FUN, 1HL4, 1HL5, 1KMG, 1L3N, 1MFM, 1N18, 1N19, 1OEZ, 1OZT, 1OZU, 1P1V, 1PTZ, 1PU0, 1RK7, 1SOS, 1SPD, 1UXL, 1UXM, 2AF2, 2C9S, 2C9U, 2C9V, 2GBT, 2GBU, 2GBV, 2LU5, 2MP3, 2NNX, 2R27, 2V0A, 2VR6, 2VR7, 2VR8, 2WKO, 2WYT, 2WYZ, 2WZ0, 2WZ5, 2WZ6, 2XJK, 2XJL, 2ZKW, 2ZKX, 2ZKY, 3CQP, 3CQQ, 3ECU, 3ECV, 3ECW, 3GQF, 3GTV, 3GZO, 3GZP, 3GZQ, 3H2P, 3H2Q, 3HFF, 3K91, 3KH3, 3KH4, 3LTV, 3QQD, 3RE0, 3T5W, 4A7G, 4A7Q, 4A7S, 4A7T, 4A7U, 4A7V, 4B3E, 4BCY, 4BCZ, 4BD4, 4FF9, 4MCM, 4MCN, 4NIN, 4NIP, 4OH2, 4XCR

Идентификаторы
ПсевдонимыSOD1, ALS, ALS1, HEL-S-44, IPOA, SOD, hSod1, homodimer, superoxide dismutase 1, soluble, superoxide dismutase 1, STAHP
Внешние IDOMIM: 147450 MGI: 98351 HomoloGene: 392 GeneCards: SOD1
Расположение гена (человек)
21-я хромосома человека
Хр.21-я хромосома человека[1]
21-я хромосома человека
Расположение в геноме SOD1
Расположение в геноме SOD1
Локус21q22.11Начало31,659,666 bp[1]
Конец31,668,931 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
16-я хромосома мыши
Хр.16-я хромосома мыши[2]
16-я хромосома мыши
Расположение в геноме SOD1
Расположение в геноме SOD1
Локус16 C3.3|16 51.56 cMНачало90,017,642 bp[2]
Конец90,023,217 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_000454

NM_011434

RefSeq (белок)

NP_000445

NP_035564

Локус (UCSC)Chr 21: 31.66 – 31.67 MbChr 16: 90.02 – 90.02 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Супероксиддисмутаза-1 (СОД1, англ. superoxide dismutase 1, SOD1) — антиоксидантный фермент, одна из трёх супероксиддисмутаз человека, кодируемая геном SOD1. Фермент защищает внутриклеточное пространство от супероксид-анионов, катализируя их превращение в молекулярный кислород и пероксид водорода.

В активном центре СОД1 содержится атом меди. Кроме этого, для стабилизации структуры белка необходим цинк, поэтому эту супероксиддисмутазу часто обозначают Cu,Zn-SOD.

Альтернативный сплайсинг приводит к образованию пяти форм фермента, различающихся по своей локализации в организме.[5]

Животные модели

[править | править код]

Мышь G93A (G93A mouse) является моделью бокового амиотрофического склероза.

Клиническое значение

[править | править код]

От 15 % до 20 % случаев бокового амиотрофического склероза ассоциированы с мутациями гена SOD1[6].

Отмечены делеции в гене SOD1 в двух различных семьях с наследственным семейным кератоконусом[7][8].

В небольшом исследовании 18 семей с кератоконусом не было отмечено связи как с SOD1, так и с другим геном-кандидатом, VSX1. Не отмечено патогенных мутаций данных генов при кератоконусе и в крупном исследовании 2009 года[9], что может говорить о гетерогенности кератоконуса[10].

Прогностически неблагоприятные аллели обнаружены у 20% американцев и британцев, а также у 40-50% японцев[источник не указан 2217 дней].

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000142168 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022982 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Hirano M., Hung W.Y., Cole N., Azim A.C., Deng H.X., Siddique T. Multiple transcripts of the human Cu,Zn superoxide dismutase gene (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. : journal. — 2000. — September (vol. 276, no. 1). — P. 52—6. — doi:10.1006/bbrc.2000.3427. — PMID 11006081.
  6. OMIM - AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS 1; ALS1. — информация в базе данных OMIM
  7. Udar N., Atilano S.R., Brown D.J., Holguin B., Small K., Nesburn A.B., Kenney M.C. SOD1: a candidate gene for keratoconus (англ.) // Invest. Ophthalmol. Vis. Sci.[англ.] : journal. — 2006. — August (vol. 47, no. 8). — P. 3345—3351. — doi:10.1167/iovs.05-1500. — PMID 16877401. (недоступная ссылка)
  8. SOD1 haplotypes in familial keratoconus. Udar N, Atilano SR, Small K, Nesburn AB, Kenney MC. Cornea. 2009 Sep;28(8):902-7. PMID 19654524
  9. Stabuc-Šilih M., Stražišar M., Hawlina M., Glavač D. Absence of Pathogenic Mutations in VSX1 and SOD1 Genes in Patients With Keratoconus (англ.) // Cornea : journal. — 2009. — December. — doi:10.1097/ICO.0b013e3181aebf7a. — PMID 20023586. (недоступная ссылка)
  10. Gajecka M., Radhakrishna U., Winters D., Nath S.K., Rydzanicz M., Ratnamala U., Ewing K., Molinari A., Pitarque J.A., Lee K., Leal S.M., Bejjani B.A. Localization of a gene for keratoconus to a 5.6-Mb interval on 13q32 (англ.) // Invest. Ophthalmol. Vis. Sci.[англ.] : journal. — 2009. — April (vol. 50, no. 4). — P. 1531—1539. — doi:10.1167/iovs.08-2173. — PMID 19011015. (недоступная ссылка)