Матриксная металлопротеиназа 9 (Bgmjntvugx bymgllkhjkmynug[g 9)

Матриксная металлопротеиназа 9
Матриксная металлопротеиназа 9
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1GKC, 1GKD, 1ITV, 1L6J, 2OVX, 2OVZ, 2OW0, 2OW1, 2OW2, 4H1Q, 4H2E, 4H3X, 4H82, 4HMA, 4JIJ, 4JQG, 4WZV, 4XCT, 5CUH, 5I12
Идентификаторы
Псевдонимы	MMP9, CLG4B, GELB, MANDP2, MMP-9, 92 kDa type IV collagenase, 92 kDa gelatinase, gelatinase B, matrix metallopeptidase 9
Внешние ID	OMIM: 120361 MGI: 97011 HomoloGene: 3659 GeneCards: MMP9
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	20-я хромосома человека
Конец	46,016,561 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	2-я хромосома мыши
Конец	164,797,770 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	skin of hip;
	Наибольшая экспрессия в
	tibiofemoral joint; ; body of femur; ; Dermatocranium; ; trophoblast giant cell;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	collagen binding; zinc ion binding; связывание с ионом металла; peptidase activity; связывание с белками плазмы; связывание похожих белков; гидролазная активность; metallopeptidase activity; endopeptidase activity; serine-type endopeptidase activity; metalloendopeptidase activity;
Компонент клетки	внеклеточный матрикс; экзосома; внеклеточное пространство; tertiary granule lumen; ficolin-1-rich granule lumen; внеклеточная область; collagen-containing extracellular matrix;
Биологический процесс	skeletal system development; negative regulation of cation channel activity; positive regulation of protein phosphorylation; endodermal cell differentiation; negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway; оссификация; negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; ephrin receptor signaling pathway; extracellular matrix disassembly; негативная регуляция апоптоза; протеолиз; macrophage differentiation; positive regulation of keratinocyte migration; positive regulation of apoptotic process; collagen catabolic process; positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria; positive regulation of receptor binding; positive regulation of DNA binding; positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; embryo implantation; leukocyte migration; positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; extracellular matrix organization; positive regulation of cell migration; neutrophil degranulation; cellular response to reactive oxygen species; cellular response to cadmium ion; cytokine-mediated signaling pathway; regulation of neuroinflammatory response; negative regulation of epithelial cell differentiation involved in kidney development; response to amyloid-beta;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	4318
	17395
	ENSG00000100985
	ENSMUSG00000017737
	P14780
	P41245
	NM_004994
	NM_013599
	NP_004985
	NP_038627
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Матриксная металлопротеиназа 9 (MMP9; «желатиназа B») - один из ферментов, участвующих в ремоделинге структур внеклеточного матрикса.

Клиническое значение

По данным одного исследования, один missense-полиморфизм гена MMP9 ассоциирован с риском развития межпозвоночной грыжи поясничного отдела^[5].

См. также

MMP2, «желатиназа A»

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100985 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000017737 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Hirose Y., Chiba K., Karasugi T., Nakajima M., Kawaguchi Y., Mikami Y., Furuichi T., Mio F., Miyake A., Miyamoto T., Ozaki K., Takahashi A., Mizuta H., Kubo T., Kimura T., Tanaka T., Toyama Y., Ikegawa S. A functional polymorphism in THBS2 that affects alternative splicing and MMP binding is associated with lumbar-disc herniation (англ.) // Am. J. Hum. Genet.^[англ.] : journal. — 2008. — May (vol. 82, no. 5). — P. 1122—1129. — doi:10.1016/j.ajhg.2008.03.013. — PMID 18455130. — PMC 2427305.

[refGRCh38EnsemblENSG00000100985-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100985 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000017737-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000017737 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid18455130-5] Hirose Y., Chiba K., Karasugi T., Nakajima M., Kawaguchi Y., Mikami Y., Furuichi T., Mio F., Miyake A., Miyamoto T., Ozaki K., Takahashi A., Mizuta H., Kubo T., Kimura T., Tanaka T., Toyama Y., Ikegawa S. A functional polymorphism in THBS2 that affects alternative splicing and MMP binding is associated with lumbar-disc herniation (англ.) // Am. J. Hum. Genet.^[англ.] : journal. — 2008. — May (vol. 82, no. 5). — P. 1122—1129. — doi:10.1016/j.ajhg.2008.03.013. — PMID 18455130. — PMC 2427305.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]