В истории армянского футбола уже имело место название футбольного клуба «Звартноц», но тот клуб был родом из религиозной столицы армян — Эчмиадзина. Ереванский «Звартноц» был образован в 1997 году перед розыгрышем чемпионата. Первый блин вышел комом. Команда заняла 9-е из 10 мест, и то ФК «Армавир» после 7-го тура снялся с соревнования. Однако сезоном далее ситуация меняется в корне и команда занимает твёрдое 1-е место в таблице с опережением ближайшего преследователя на 12 очков и без единого поражения. Таким образом, в 1999 году в элиту армянского футбола врывается клуб с большими надеждами, планами и целями.
Сезон команда начинает под прежним названием, а после к названию прибавляется аббревиатура ААЛ (Армянские авиалинии), который с момента основания клуба являлся его основным спонсором. Этот год «Звартноц-ААЛ» заканчивает на 4-й строчке. В 2000 году клуб возглавляет Самвел Касабоглян. Под его руководством команда занимает в чемпионате 5-е место, а также пробивается в финал Кубка, где уступает 1:2 аштаракской «Мике». Наивысшего результата в чемпионате клуб добился в 2001 году, заняв 2-е место и таким образом завоевал путёвку в Кубок УЕФА.
В 2002 году команда в очередной раз доходит до финального поединка в кубке страны, где она опять проигрывает со счётом 0:2, на этот раз «Пюнику» Ереван, и занимает итоговое 7-е место в турнирной таблице чемпионата. Год 2003-ий стал для команды последним в истории. Из-за финансовых проблем команда отказывается от участия в чемпионате и кубке, и после этого окончательно распускается.
из-за несогласия с действиями ФФА, клуб бойкотировал игры двух последних туров. В связи с чем, команда была снята с чемпионата и её место в итоговой таблице условное.
Звартноц-ААЛ
1
Ф
7
«Приморье» Айдовщина
Рафаел Галустян (? — апрель 1999)