С 1958 года работал ассистентом, после чего стал доцентом хирургической клиники кафедры госпитальной хирургии 1-го ММИ[3]. В 1963 года был назначен руководителем отделения хирургии пищевода и желудка Всесоюзного научно-исследовательского института клинической и экспериментальной хирургии СССР[4]. С 1969 года работает заместителем директора по научной работе того же института.
Эдуард Никитич Ванцян написал более 120 научных работ, включая 6 монографий. Они были посвящены изучению моторной функции и хирургии пищевода, консервативному лечению его сужений и кардиоспазма, и болезням оперированного пищевода. Он создал методы тотальной и сегментарной пластики пищевода, лечения грыж пищеводного отверстия диафрагмы и дивертикулов пищевода.
Ванцян создал пневматический дилататор, целью которого было консервативное лечение сужений пищевода и кардиоспазма. Он сократил необходимость оперативных вмешательств у некоторых групп больных.
За время его руководства было написано 26 диссертаций, включая 12 докторских.
Ванцян был членом президиума Ученого медицинского совета СССР, заместителем председателя Хирургического общества Москвы и Московской области, заместителем редактора журнала «Хирургия», членом Международного общества хирургов, почетный член хирургических обществ ГДР и Кубы.
В 1989 году погиб в автокатастрофе со своим сыном Никитой. Был похоронен на Бабушкинском кладбище[5].
Эдуард Никитич Ванцян в операционной, 1985 г.
Великолепно играл на фортепиано[6]. Виртуозно исполнял джазовые композиции.
Многотомное руководство по хирургии, под редакцией Б. В. Петровского, том 6, книга 2, Москва, 1966
Дивертикулы пищевода, М., 1968 (совместно с Петровским Б. В.)
Лечение ожогов и рубцовых сужений пищевода, М., 1971 (совместно с Тощаковым Р. А.)[7]
Приобретенные свищи между пищеводом и дыхательными путями, Баку, 1972 (совместно с др.)
Грыжи пищеводного отверстия диафрагмы, Тбилиси, 1974 (совместно с другими)
Ванцян Э.Н. в молодости Эдуард Никитич в своем кабинетеОперации на пищеводе, в кн: Атлас грудной хирургии, под ред. Б. В. Петровского, том 2, стр. 121, Москва, 1974 (совместно с Тощаковым Р. А.)
Клиника и хирургическое лечение дивертикулов пищевода [Текст] : Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора мед. наук / 1-й Моск. медицинский институт им. И. М. Сеченова. — Москва : [б. и.], 1964. — 26 стр[8].
