↑ Количество игр и голов за профессиональный клуб считается только для различных лиг национальных чемпионатов, обновлено по состоянию на 2 июля 2023 года.
↑ Количество игр и голов за национальную сборную в официальных матчах.
Нильсен начал профессиональную карьеру в клубе «Хёугесунн». В 2007 году он дебютировал за основной состав в Первом дивизионе. Спустя два года Йоаким помог команде выйти в элиту. 13 марта 2010 года в матче против «Бранна» он дебютировал в Типпелиге[2]. 21 марта в поединке против «Стрёмсгодсета» Нильсен забил свой первый гол за «Хёугесунн»[3].
В начале 2016 года Нильсен перешёл в «Одд». 20 марта в матче против «Бранна» он дебютировал за новую команду[4]. 24 апреля в поединке против «Лиллестрёма» Йоаким забил свой первый гол за «Одд»[5].